فیلوژنی مولکولی Theileria equi در اسبهای استان خوزستان براساس ژن 18S RNA ریبوزومی | ||
| Archives of Razi Institute | ||
| Article 16, Volume 81, Issue 3, January and February 0, Pages 673-680 PDF (1002.35 K) | ||
| Document Type: مقالات پژوهشی | ||
| DOI: 10.32598/ARI.81.3.3736 | ||
| Abstract | ||
| پیروپلاسموز اسبی یک بیماری منتقله از کنه است که توسط دو گونه انگل تک یاختهای، به نام های Babesia caballi و Theileria equi (قبلاً Babesia equi نامیده میشد) ایجاد میشود. این بیماری توسط کنههای ایکسودید منتقل میگردد. در این مطالعه، بمنظور مطالعه فیلوژنی ملکولی و تعیین ساختار ثانویه، یک قطعه ژن 435 نوکلئوتیدی از ژن 18S RNA ریبوزومی از اسبهای استان خوزستان، ایران تکثیر گردید. آنالیز تاکسونومی توالی افزوده سازی شده، که به عنوان TeKh نامگذاری شد، نشان داد که این قطعه ژن در 108 مورد در شاخه Apicomplexa مشابهت داشت. از این تعداد، 104 مورد مربوط به خانواده Theileriidae و 86 مورد به جنس Theileria است. نتایج مقایسه این ژن با بانک ژن نشان داد که TeKh با تنها توالی موجود از استان فارس (MK615933) کاملا مشابه است. همترازی چندگانه این توالی به ترتیب 71/98٪ و 74/99٪ با T. equi از روسیه (OM475523) و ترکمنستان (OL638195) مشابهت نشان داد. با استفاده از برنامه RNAfold انرژی آزاد ترمودینامیکی TeKh به میزان 98/121- کیلوکالری بر مول پیشبینی گردید، که این نشان می دهد که RNA به شکل پایداری تا خورده است. درخت فیلوژنتیکی نشان داد که توالیهای خوشه A که از کشورهای مختلف منشأ گرفتهاند، حداقل واگرایی را نشان میدهند، که نشاندهنده حفاظت ژنتیکی بالای این ژن در بین سویههای متنوع جغرافیایی است. در خوشه B تنوع بیشتری را دیده شد، بدینصورت که توالیهای T. bicornis (AF499604)و (KF597078) Theileria Sp. به ترتیب، از آفریقای جنوبی و کنیا قرار دارند. توالی. T cervi (KT959227) جدا شده از چین با بوتاسترپ متوسط (۴۴٪) از بقیه اعضای شاخه B جدا افتاده است. نتیجه گیری کلی اینکه، هیچ تفاوت قابل توجهی بین دو توالی جدا شده از استانهای خوزستان و فارس در ایران وجود نداشت، که نشان دهنده شباهت درون گروهی است که احتمالاً به دلیل جابجایی حیوانات بین این دو منطقه بوجود آمده است. شباهت بالای مشاهده شده بین توالیهای T. equi از نقاط مختلف جهان نشان میدهد که قبل از اینکه بتوان از این قطعه ژن به عنوان یک نشانگر ملکولی اختصاصی گونه T. equi در اسبها استفاده کرد، به تحقیقات بیشتری نیاز است. | ||
| Keywords | ||
| 18SRNAریبوزومی; Babesia; اسب; فیلوژنی; Theileria | ||
|
Statistics Article View: 219 PDF Download: 229 |
||
Journal management system. designed by sinaweb