اخبار و اعلانات

 آمار

تعداد نشریات282
تعداد نشریات سازمان80
تعداد شماره‌ها3,196
تعداد مقالات35,423
تعداد مشاهده مقاله52,250,111
تعداد دریافت فایل اصل مقاله91,781,898
Bozorgi, Soghra, Nabian, Sedigheh, Habibi, Gholamreza, Afshari, Asghar, Shahedi, Amin, Nasiri, Vahid. (1404). Phylogenetic study of protozoan Toxoplasma gondii using Cytochrome b and Gra20 genes. سامانه مدیریت نشریات علمی, 80(4), 1029-1038. doi: 10.66224/ARI.80.4.1029
Soghra Bozorgi; Sedigheh Nabian; Gholamreza Habibi; Asghar Afshari; Amin Shahedi; Vahid Nasiri. "Phylogenetic study of protozoan Toxoplasma gondii using Cytochrome b and Gra20 genes". سامانه مدیریت نشریات علمی, 80, 4, 1404, 1029-1038. doi: 10.66224/ARI.80.4.1029
Bozorgi, Soghra, Nabian, Sedigheh, Habibi, Gholamreza, Afshari, Asghar, Shahedi, Amin, Nasiri, Vahid. (1404). 'Phylogenetic study of protozoan Toxoplasma gondii using Cytochrome b and Gra20 genes', سامانه مدیریت نشریات علمی, 80(4), pp. 1029-1038. doi: 10.66224/ARI.80.4.1029
Bozorgi, Soghra, Nabian, Sedigheh, Habibi, Gholamreza, Afshari, Asghar, Shahedi, Amin, Nasiri, Vahid. Phylogenetic study of protozoan Toxoplasma gondii using Cytochrome b and Gra20 genes. سامانه مدیریت نشریات علمی, 1404; 80(4): 1029-1038. doi: 10.66224/ARI.80.4.1029

Phylogenetic study of protozoan Toxoplasma gondii using Cytochrome b and Gra20 genes

Archives of Razi Institute
مقاله 25، دوره 80، شماره 4، مهر و آبان 2025، صفحه 1029-1038    اصل مقاله (939.21 K)
نوع مقاله: Original Articles
شناسه دیجیتال (DOI): 10.66224/ARI.80.4.1029
نویسندگان
Soghra Bozorgi* 1؛ Sedigheh Nabian2؛ Gholamreza Habibi1؛ Asghar Afshari1؛ Amin Shahedi1؛ Vahid Nasiri3
1Department of Parasite Vaccine Research and Production, Razi Vaccine and Serum Research Institute, Agriculture Research, Education, and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran.
2Department of Ticks and Tick-borne Diseases (RCTTD), Faculty of Veterinary Medicine, University of Tehran, Iran.
3Department of Parasitology, Razi Vaccine and Serum Research Institute, Agriculture Research, Education, and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran.
چکیده
Toxoplasma gondii is an obligate intracellular protozoan in the phylum Apicomplexa. In addition to humans, toxoplasmosis can also cause serious diseases in livestock, leading to significant economic losses. The Toxoplasma gondii parasite is transmitted through the feces of its primary host, the Felidae family. The use of molecular methods with high sensitivity has made it possible to detect and study microorganisms. In this study the cytochrome b and dense granule 20 (Gra20) genes were utilized for studying Toxoplasma gondii parasites.
After collecting 29 animal samples of Toxoplasma gondii, the PCR method was applied to evaluate the presence of Gra20 and cytochrome b genes. The sequence of 11 samples was acceptable and submitted in the NCBI database. Mega X software was utilized to create the phylogenetic tree. In addition, the genetic diversity was studied using the RFLP-PCR assay for Gra6 gene.
Assessment of the bands obtained from PCR showed that the bands related to cytochrome b are found in all species of the Sarcocystidae family, but the bands related to the Gra20 gene are specific to Toxoplasma gondii. In the phylogenic tree, there was a closer relationship between Iranian isolates of Toxoplasma gondii and French strain of Toxoplasma gondii. Type I was determined as the genetic type of protozoan Toxoplasma gondii isolated from Iran.
Based on the results, the cytochrome b gene was considered as a general gene for recognizing different species of the Sarcocystidae family, however divergence was seen in the Gra20 gene, which is considered a particular gene for Toxoplasma gondii.
کلیدواژه‌ها
Toxoplasma gondii؛ dense granule 20 (GRA20)؛ cytochrome b؛ phylogenetic analysis
عنوان مقاله [English]
مطالعه فیلوژنتیکی تک یاخته توکسوپلاسما گوندی با استفاده از ژن های سیتوکروم بی و Gra20
چکیده [English]
چکیده
سابقه و هدف: توکسوپلاسما گوندی یک تک یاخته درون سلولی اجباری در شاخه Apicomplexa است. علاوه بر انسان، توکسوپلاسموز می تواند باعث بیماری های جدی در دام ها شود که منجر به خسارات اقتصادی قابل توجهی می شود. انگل توکسوپلاسما گوندی از طریق مدفوع میزبان اصلی خود یعنی خانواده Felidae منتقل می شود. استفاده از روش های مولکولی با حساسیت بالا امکان شناسایی و مطالعه میکروارگانیسم ها را فراهم کرده است. در این مطالعه از ژن های سیتوکروم b و گرانول متراکم 20 (Gra20) برای بررسی انگل های توکسوپلاسما گوندی استفاده شد.
مواد و روش‌ها: پس از جمع‌آوری 29 نمونه حیوانی توکسوپلاسما گوندی، از روش PCR برای بررسی حضور ژن‌های Gra20 و سیتوکروم b استفاده شد. توالی 11 نمونه قابل قبول بود و در پایگاه داده NCBI ارسال شد. برای ایجاد درخت فیلوژنتیک از نرم افزار Mega X استفاده شد. علاوه بر این، تنوع ژنتیکی با استفاده از روش RFLP-PCR برای ژن Gra6 مورد مطالعه قرار گرفت.
یافته‌ها: ارزیابی باندهای به‌دست‌آمده از PCR نشان داد که باندهای مربوط به سیتوکروم b در همه گونه‌های خانواده Sarcocystidae وجود دارد، اما باندهای مربوط به ژن Gra20 مختص توکسوپلاسما گوندی است. در درخت فیلوژنیک، بین جدایه های ایرانی توکسوپلاسما گوندی و سویه فرانسوی توکسوپلاسما گوندی رابطه نزدیک تری وجود داشت. تیپ I به عنوان تیپ ژنتیکی تک یاخته Toxoplasma gondii جدا شده از ایران تعیین شد.
نتیجه‌گیری: بر اساس نتایج، ژن سیتوکروم b به‌عنوان یک ژن عمومی برای شناسایی گونه‌های مختلف خانواده Sarcocystidae در نظر گرفته شد، اما در ژن Gra20 که یک ژن خاص برای توکسوپلاسما گوندی محسوب می‌شود، واگرایی مشاهده شد.
کلیدواژه‌ها [English]
توکسوپلاسما گوندی, گرانول متراکم 20, سیتوکروم بی, آنالیز فیلوژنتیکی
سایر فایل های مرتبط با مقاله
مراجع
  1. Delgado IL, Zúquete S, Santos D, Basto AP, Leitão A, Nolasco S. The apicomplexan parasite Toxoplasma gondii. Encyclopedia. 2022;2(1):189-211.
  2. Robert-Gangneux F, Aubert D, Villena I. Toxoplasmosis: a widespread zoonosis diversely affecting humans and animals. Zoonoses: Infections Affecting Humans and Animals: Springer; 2022. p. 1-27.
  3. Dubey JP. The history of Toxoplasma gondii—the first 100 years. Journal of eukaryotic microbiology. 2008;55(6):467-75.
  4. Gómez-Chávez F, Murrieta-Coxca JM, Caballero-Ortega H, Morales-Prieto DM, Markert UR. Host-pathogen interactions mediated by extracellular vesicles in Toxoplasma gondii infection during pregnancy. Journal of Reproductive Immunology. 2023:103957.
  5. Daryani A, Hosseini AZ, Dalimi A. Immune responses against excreted/secreted antigens of Toxoplasma gondii tachyzoites in the murine model. Veterinary parasitology. 2003;113(2):123-34.
  6. Galal L, Ajzenberg D, Hamidović A, Durieux M-F, Dardé M-L, Mercier A. Toxoplasma and Africa: one parasite, two opposite population structures. Trends in Parasitology. 2018;34(2):140-54.
  7. Sharif M, Amouei A, Sarvi S, Mizani A, Aarabi M, Hosseini S-A, Daryani A. Genetic diversity of Toxoplasma gondii isolates from ruminants: a systematic review. International Journal of Food Microbiology. 2017;258:38-49.
  8. Khanaliha K, Bokharaei-Salim F, Hedayatfar A, Esteghamati A, Alemzadeh SA, Asgari Q, et al. Comparison of real-time PCR and nested PCR for toxoplasmosis diagnosis in toxoplasmic retinochoroiditis patients. BMC Infectious Diseases. 2021;21:1-7.
  9. Miura AC, Barros LDd, Minutti AF, Martins TA, Sasse JP, Nino BdSL, Garcia JL. Evaluation of quantitative polymerase chain reaction for the detection of Toxoplasma gondii oocysts shed by cats. Revista Brasileira de Parasitologia Veterinária. 2021;30:e016621.
  10. Fazaeli A, Carter P, Darde M, Pennington T. Molecular typing of Toxoplasma gondii strains by GRA6 gene sequence analysis. International Journal for Parasitology. 2000;30(5):637-42.
  11. Ning H-R, Huang S-Y, Wang J-L, Xu Q-M, Zhu X-Q. Genetic diversity of Toxoplasma gondii strains from different hosts and geographical regions by sequence analysis of GRA20 gene. The Korean Journal of Parasitology. 2015;53(3):345.
  12. Bruford MW, Bradley DG, Luikart G. DNA markers reveal the complexity of livestock domestication. Nature Reviews Genetics. 2003;4(11):900-10.
  13. Sercundes MK, Valadas SYOB, Keid LB, Oliveira TMFS, Ferreira HL, Vitor RWdA, et al. Molecular phylogeny of Toxoplasmatinae: comparison between inferences based on mitochondrial and apicoplast genetic sequences. Revista Brasileira de Parasitologia Veterinária. 2016;25:82-9.
  14. Gjerde B. Characterisation of full-length mitochondrial copies and partial nuclear copies (numts) of the cytochrome b and cytochrome c oxidase subunit I genes of Toxoplasma gondii, Neospora caninum, Hammondia heydorni and Hammondia triffittae (Apicomplexa: Sarcocystidae). Parasitology research. 2013;112:1493-511.
  15. Norouzi M, Tabaei SJS, Niyyati M, Saber V, Behniafar H. Genotyping of Toxoplasma gondii strains isolated from patients with ocular toxoplasmosis in Iran. Iranian Journal of Parasitology. 2016;11(3):316.
آمار
تعداد مشاهده مقاله: 363
تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 407


counter
سامانه مدیریت نشریات علمی. طراحی و پیاده سازی از سیناوب