Faghir, Marzieh Beygom, Deylami Moezi, Adeleh, Shahi Shavvon, Robabeh. (1401). Molecular phylogeny of the genus Sanguisorba from Iran: Evidence based on cpDNA and nrDNA sequencing analysis. سامانه مدیریت نشریات علمی, (), -. doi: 10.22092/botany.2022.359495.1318
Marzieh Beygom Faghir; Adeleh Deylami Moezi; Robabeh Shahi Shavvon. "Molecular phylogeny of the genus Sanguisorba from Iran: Evidence based on cpDNA and nrDNA sequencing analysis". سامانه مدیریت نشریات علمی, , , 1401, -. doi: 10.22092/botany.2022.359495.1318
Faghir, Marzieh Beygom, Deylami Moezi, Adeleh, Shahi Shavvon, Robabeh. (1401). 'Molecular phylogeny of the genus Sanguisorba from Iran: Evidence based on cpDNA and nrDNA sequencing analysis', سامانه مدیریت نشریات علمی, (), pp. -. doi: 10.22092/botany.2022.359495.1318
Faghir, Marzieh Beygom, Deylami Moezi, Adeleh, Shahi Shavvon, Robabeh. Molecular phylogeny of the genus Sanguisorba from Iran: Evidence based on cpDNA and nrDNA sequencing analysis. سامانه مدیریت نشریات علمی, 1401; (): -. doi: 10.22092/botany.2022.359495.1318
Molecular phylogeny of the genus Sanguisorba from Iran: Evidence based on cpDNA and nrDNA sequencing analysis
2Department of Biology, Faculty of Science, University of Guilan, Rasht,
3Faculty of ., Department of Biology, Faculty of Science, Yasouj University, Yasouj, science, university of Yazouj, Yasouj Iran
چکیده
In this research, the molecular phylogeny of the genus Sanguisorba (including two species (S. officinalis and S. minor), and the three subspecies (S. minor subsp. muricata, S. minor subsp. lasiocarpa, and S. minor subsp. minor) from Iran were studied using nrDNA ITS and cpDNA rpl32-trnL(UAG). A total of 26 taxa, comprising four Iranian samples plus 22 previously sequenced data received from Genbank were analyzed. In the present research, the phylogenetic relationships were reconstructed within Sanguisorbausing maximum parsimony and Bayesian analyses. The results of nuclear sequence analysis showed separation of two subfamilies (Agrimoniinae and Sanguisorbinae), monophyly of Sanguisorba, complete separation of S. officinalis (in Sanguisorba clade) from S. minor and the three subspecies (in Poterium clade). Although, the intraspecific relationship remained unresolved, it was found that the use of micro-macro morphological criteria could be used as an important tool in different taxonomic ranks, especially in intraspecific identification. In addition, average sequence divergence, genetic differentiation, morphological and micro morphological evidence are discussed.
3استادیار گروه زیست شناسی، دانشکده علوم، دانشگاه یاسوج، کد پستی 75918-74934، یاسوج، ایران
چکیده [English]
در بررسی حاضر، فیلوژنی مولکولی جنس Sanguisorbaمتعلق به گلسرخیان (شامل دو گونه S. officinalis و S. minor) و سه زیرگونه (S. minor subsp. muricata, S. minor subsp. lasiocarpa و S. minor subsp. minor) از ایران با استفاده از nrDNA ITS و rpl32-trnL(UAG)مورد مطالعه قرار گرفت. در مجموع، 26 آرایه، شامل چهار نمونه از ایران به همراه 22 توالی از بانک ژن مورد آنالیز قرار گرفت. روابط فیلوژنتیکی گونههای Sanguisorbaبا استفاده از آنالیزهای ماکزیمم پارسیمونی و بایزین بازسازی شدند. نتایج آنالیز توالی هستهای منجر به جدایی دو زیرطایفه (AgrimoniinaeوSanguisorbinae)، تکتباری جنس Sanguisorbaو جدایی کامل S. officinalis (روی شاخه Sanguisorba) از S. minor و سه زیرگونه آن را (روی شاخه Poterium) شد. باوجودی که روابط فروگونه حل نشده باقی ماند، اما معلوم شد، استفاده از معیارهای ریختشناسی و ریزریختشناسی میتواند به عنوان ابزار مهمی برای تفکیک سطوح مختلف تاکسونومیک به ویژه، شناسایی فروگونهایی استفاده شود. به علاوه، در این بررسی، میانگین درصد واگرایی نوکلئوتیدی، تفاوت توالیها، شواهد ریختشناسی و ریزریختشناسی مورد بحث قرار گرفته است.
کلیدواژهها [English]
بایزین, ریختشناسی و ریزریختشناسی, فیلوژنتیکی, ماکزیمم پارسیمونی, واگرایی نوکلئوتیدها, حد و مرز تاکسونومیک