| تعداد نشریات | 282 |
| تعداد نشریات سازمان | 80 |
| تعداد شمارهها | 3,208 |
| تعداد مقالات | 35,560 |
| تعداد مشاهده مقاله | 53,008,152 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 92,291,252 |
بررسی مولکولی ژن اینترلوکین 2 مرغ بومی خراسان | ||
| علوم دامی | ||
| مقاله 18، دوره 31، شماره 119، شهریور 1397، صفحه 209-218 اصل مقاله (1.07 M) | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/asj.2017.110808.1459 | ||
| نویسندگان | ||
| رضا توحیدی* 1؛ محمد دوستی2؛ محمدرضا نصیری3؛ آرش جوانمرد4 | ||
| 1استادیار، گروه علوم دامی، مجتمع آموزش عالی تربت جام | ||
| 2دانشآموخته دکتری ژنتیک، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد. | ||
| 3استاد، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد | ||
| 4استادیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز | ||
| چکیده | ||
| امروزه یکی از نگرانیهای صنعت پرورش طیور در جهان، شیوع بیماریها در گلههای بزرگ است. با وجود استفاده از واکسیناسیون مناسب، مصرف آنتیبیوتیک و انجام ضدعفونی در سالنهای مرغداری، ولی همچنان شیوع بیماریها ضرر اقتصادی جبران ناپذیری را به این صنعت وارد میکند. یکی دیگر از راههای مؤثر افزایش مقاومت طیور به بیماریها، بهبود ژنتیکی سیستم ایمنی است که میتواند هزینههای جاری مصرف واکسن و دارو را کاهش دهد. با توجه به اهمیت IL-2 در سیستم ایمنی، مطالعه حاضر به منظور بررسی ساختار ژن IL-2 مرغ بومی خراسان انجام گرفت. برای انجام این تحقیق تعداد 20 نمونه DNA مرغ بومی خراسان برای تکثیر و توالییابی یک قطعه 875 جفت بازی ژن IL-2 مورد استفاده قرار گرفت. مقایسه توالیهای به دست آمده از مرغ بومی خراسان با توالی به ثبت رسیده در پایگاه دادههای مرکز ملی اطلاعات زیستفناوری وجود جهشهایی را در ژن IL-2 مرغ بومی خراسان نشان داد، به طوری که این جهشها در ناحیه اگزون 1 باعث تغییر اسید آمینه شده بودند. جهشهای اگزونی در نقاط 733، 738، 744 و 794 جفت بازی به ترتیب برای جانشینی بازهای آدنین به جای سیتوزین، تیمین به جای آدنین، آدنین به جای سیتوزین و تیمین به جای سیتوزین بودند. وجود این جهشها امکان استفاده از آنها به عنوان نشانگر ژنی در برنامههای انتخاب ژنومی را فراهم میآورد که برای تأیید آن نیاز به بررسی فراوانی جهشها در جمعیت و همچنین بررسی تأثیر آنها بر عملکرد IL-2 از طریق آزمایشات پروتئومیکس است. | ||
| کلیدواژهها | ||
| ژن؛ اینترلوکین 2؛ توالییابی؛ مرغ بومی خراسان | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| A molecular study on genetic structure of interleukin 2 in Khorasan native chicken | ||
| نویسندگان [English] | ||
| Reza Tohidi1؛ Mohammad Dousti2؛ Mohammadreza Nasiri3؛ Arash Javanmard4 | ||
| 1Torbat-e Jam University of Agriculture | ||
| 2Ferdowsi University | ||
| 3Dept. of Animal Science, Faculty of Agriculture Ferdowsi University of Mashhad, | ||
| 4Dep of Animal Science, University of Tabriz, Tabriz, Iran | ||
| چکیده [English] | ||
| Control of diseases is one of the concerns in poultry industry worldwide. Despite the use of proper vaccines, antibiotics and sanitation in poultry farms, still disease outbreaks make irreparable economical loss. Another effective way of increasing the resistance of poultry to diseases is the genetic improvement of the immune system, which can reduce the current cost of taking vaccine and medicine. Considering the importance of IL-2 in the immune system, the present study was conducted to investigate the structure of IL-2 gene in Khorasan native chickens. To conduct this research, 20 DNA samples from Khorasan native chickens were used to amplify and sequence of 875-base pairs from the IL-2 gene. Comparison of the sequences obtained from the Khorasan native chickens with the sequence deposited in the NCBI showed mutations in the IL-2 gene, so that these mutations in the exon 1 region altered the amino acids. Exon mutations at 733, 738, 744 and 794 base pairs made to replace adenine bases instead of cytosine, thymine instead of adenine, adenine instead of cytosine, and thymine instead of cytosine. Identifying these mutations can allow them to be used as a genetic marker. To confirm this, we need to investigate the frequency of mutations and also examine their effect on IL-2 performance through proteomics experiments. | ||
| کلیدواژهها [English] | ||
| gene, interleukin 2, Sequencing, Khorasan native chicken | ||
| مراجع | ||
|
قاسمیان سوربنی، الف.، رحیمی میانجی، ق.، انصاری پیرسرایی، ز.، کاظمی، ح. و رضایی، م. (1391). شناسایی چندشکلیهای تکنوکلئوتیدی در ناحیه پروموتر ژن اینترلوکین-2 در مرغهای مولد ایستگاه اصلاح نژاد مرغ بومی مازندران. پنجمین کنگره علوم دامی ایران، دانشگاه صنعتی اصفهان، شهریور 1391. نیکبختی، م.، میرزایی، ح.ر.، افشاریان شاندیز، م.، محمدآبادی، م.ر. و ساقی، د.ع. (1388). بررسی تنوع ژنتیکی مرغان بومی استان خراسان رضوی با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره. مجله پژوهشهای علوم دامی ایران. جلد (1)، شماره (2). صفحه: 25-19. Amini, H., Hoseini, S.D., Nowroozi, J. and Shahbazzadeh, D. (2012). Cloning and sequencing of Iranian chicken interleukine-2 gene. Jundishapur Journal of Microbiology. 5: 502-506. Chen, W.T., Huang, W.Y., Chen, T., Salawu, E.O., Wang, D., Lee, Y.Z., Chang, Y.Y., Yang, L.W., Sue, S.C., Wang, X. and Yin, H.S. (2016). Structure and function of chicken interleukin-1 beta mutants: uncoupling of receptor binding and in vivobiological activity. Scientific Reports. 6: 27729. Chorev, M., and Carmel, L. (2012). The Function of introns. Frontiers in Genetics. 3: 55. Dijkstra, J.M., Takizawa, F. and Fischer, U. (2014). Identification of a gene for an ancient cytokine, interleukin 15-like, in mammals; interleukins 2 and 15 co-evolved with this third family member, all sharing binding motifs for IL-15Rα. Immunogenetics. 662: 93-103. Estess, P., Nandi, A., Mohamadzadeh, M. and Siegelman, M.H. (1999). Interleukin 15 induces endothelial hyaluronan expression in vitro and promotes activated T cell extravasations through a CD44-dependent pathway in vivo. Journal of Experimental Medicine. 190: 9-19. Griffin, D.K., Robertson, L.B., Tempest, H.G., Vignal, A., Fillon, V., Crooijmans, R.P.M.A., Groenen, M.A.M., Deryusheva, S., Gaginskaya, E., Carre, W., Waddington, D., Talbot, R., Volker, M., Masabanda, J.S. and Burt, D.W. (2008). Whole genome comparative studies between chicken and turkey and their implications for avian genome evolution. BMC Genomics. 9: 168. Hall, T. (1999). A user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT. Nucleic Acids Symposium Series. 41: 95-98. Jaiswal, G., Kumar, S., Prasad, Y. and Singh, D.P. (2009). PCR-RFLP analysis of IL-2Rγ and IL-15Rα genes in kadakanath native chicken. Journal of Applied Animal Research. 36: 239-242. Kaiser, P. and Mariani, P. (1999). Promoter sequence, exon:intron structure, and synteny of genetic location show that a chicken cytokine with T-cell proliferative activity is IL2 and not IL15. Immunogenetics. 49: 26–35. Kolodsick, J.E., Stepaniak, J.A., Hu, W. and Sundick, R.S. (2001). Mutational analysis of chicken interleukin 2. Cytokine.13: 317-324. Kuby, J. (1997). Pages 326–328 in: Immunology. W. H. Freeman and Company, New York, NY. Lamont, S.J. (1998). Impact of genetics on disease resistance. Poultry Science. 77: 1111-1118. Miller, S.A., Dykes, D.D. and Polesky, H.F. (1988). A simple salting out procedure for extracting DNA from human nucleated cells. Nucleic Acids Research. 16: 1215. Sundick, R.S. and Gill-Dixon, C. (1997). A cloned chicken lymphokine homologous to both mammalian IL-2 and IL-15. The Journal of Immunology. 159: 720-725. Szmolka, A., Wiener, Z., Matulova, M.E., Varmuzova, K. and Rychlik, I. (2015). Gene expression profiles of chicken embryo fibroblasts in response to Salmonella enteritidis infection. PLoS ONE. 10: e0127708. Tohidi, R., Idris, I., Malar Panandam, J. and Hair Bejo, M. (2012). The effects of polymorphisms in IL-2, IFNg, TGF-β2, IgL, TLR-4, MD-2, and iNOS genes on resistance to Salmonella enteritidis in indigenous chickens. Avian Pathology. 41: 605–612. Van Hemert, S.V. (2007). Gene expression profiling of chicken intestinal host responses [PhD thesis]. Wageningen (Netherland): Wageningen University. ISBN 90-8504-581-9. Wigley, P. and Kaiser, P. (2003). Avian cytokines in health and disease. Revista Brasileira de Ciência Avícola, 5: 1-14. Wong, G.K., Liu, B., Wang, J., Zhang, Y., Yang, X., Zhang, Z., Meng, Q., Zhou, J., Li, D., Zhang, J., et al. (2004). A genetic variation map for chicken with 2.8 million single-nucleotide polymorphisms. Nature. 432: 717–722. Zakarias, B., Ter Huurne, A.A.H.M., Landman, W.J.M., Rebel, J.M.J., Pol, J.M.A. and Gruys, E. (2002). Immunological basis of differences of disease resistance in the chicken. Veterinary Research. 33: 109-125. Zhang, D.P., Zhao, H.J., Luo, Y.Z. and Han, J.L. (2011). Characterization of haplotype diversity defined by discontinuous insertions/deletions within the intron 2 of interleukin 2 in different domestic chicken populations. Journal of Biological Sciences. 11: 261-267. Zhang, L., Li, P., Liu, R., Zheng, M., Sun, Y., Wu, D., et al. (2015). The identification of loci for immune traits in chickens using a genome-wide association study. PLoS ONE. 10: e0117269. Zhou, H., Buitenhuis, A., Weigend, S. and Lamont, S. (2001). Candidate gene promoter polymorphisms and antibody response kinetics in chickens: interferon-gamma, interleukin-2, and immunoglobulin light chain. Poultry Science. 80: 1679-1689. | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 775 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 553 |
||