| تعداد نشریات | 282 |
| تعداد نشریات سازمان | 80 |
| تعداد شمارهها | 3,168 |
| تعداد مقالات | 35,197 |
| تعداد مشاهده مقاله | 50,944,176 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 90,949,602 |
An optimized affordable DNA-extraction method from Salmonella enterica Enteritidis for PCR experiments | ||
| Archives of Razi Institute | ||
| مقاله 3، دوره 68، شماره 2، بهمن 2013، صفحه 105-109 اصل مقاله (97.73 K) | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.7508/ari.2013.02.003 | ||
| نویسندگان | ||
| Rainak Ghaderi1؛ S. Moradi Bidhendi2؛ P. Khaki2؛ K. Tadayon* 2؛ Nasim Karimnasab3؛ M. Sekhavati4؛ F. Asadi2 | ||
| 1Razi vaccine & Serum Research Institite AND Armenian National Agrarian University, Yerevan, Armenia | ||
| 2Razi Vaccine & Serum Research Institute | ||
| 3Razi vaccine & Serum Research Institite AND Azad University-Karaj Branch | ||
| 4Department of Animal Science, Ferdowsi University of Mashhad, Mashhad, Iran | ||
| چکیده | ||
| In diagnostic and research bacteriology settings with budget and staff restrictions, fast and cost-effective genome extraction methods are desirable. If not inactivated properly, cellular and/or environmental DNA nucleases will degrade genomic material during the extraction stage, and therefore might give rise to incorrect results in PCR experiments. When crude cell extracts, proteinase K–treated templates and purified DNAs prepared by phenol-chloroform-isoamylalcohol method as well as a commercial extraction kit were subjected to the Salmonella enterica Enteritidis specific STM2 PCR, with exception of crude cell extract, PCR products from all other three methods saved their integrity for 28 days post-generation. This work aimed to find out whether improvement to boiling method can guaranty stability of PCR products. As results showed, treatment of crude cell extracts from S. Enteritidis with proteinase K offers an inexpensive, fast and effective DNA extraction method suitable for high-throughput laboratories. | ||
| کلیدواژهها | ||
| DNA Exrtaction؛ Salmonella enterica Enteritidis؛ STM2؛ DNase؛ proteinase K | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| معرفی یک روش مقرون به صرفه استخراج DNA از سالمونلا انتریکا انتریتیدیس مناسب برای آزمون های واکنش زنجیره ای پلیمراز | ||
| نویسندگان [English] | ||
| رایناک قادری1؛ سهیلا مرادی بیدهندی2؛ حبیب اله پایکاری2؛ کیوان تدین2؛ نسیم کریم نسب3؛ محمدهادی سخاوتی4؛ فرزاد اسدی2 | ||
| 2موسسه تحقیقات واکسن و سرمسازی رازی | ||
| 3موسسه تحقیقات واکسن و سرمسازی رازی و دانشگاه آزاد شعبه کرج | ||
| 4دانشگاه فردوسی مشهد | ||
| چکیده [English] | ||
| روش های سریع و کم هزینه استخراج ماده ژنومی باکتری ها در آزمایشگاه های میکروب شناسی تشخیصی و تحقیقاتی معمولا از مقبولیت بیشتری برخوردار هستند. آنزیم های نوکلئاز موجود در باکتری ها که در جریان استخراج ماده ژنومی آزاد می گردند می توانند سبب تخریب ماده ژنتیکی آنها و اختلال در نتایج آزمون های واکنش زنجیره ای پلیمراز بگردند. در مطالعه حاضر هنگامی که استخراج شده از سالمونلا انتریکا انتریتیدیس به چهار روش جوشانیدن ساده در بافر TE ، جوشانیدن در بافر TE محتوی پروتئیناز K ، فنل- کلروفرم-آیزوآمیل الکل و بالاخره کیت تجارتی در یک آزمون واکنش زنجیره ای پلیمراز اختصاصی بنام STM2-PCR بر روی یک سروتایپ استاندارد آزمایشگاهی و یک جدایه کلینیکی بکار گرفته شدند محصولات واکنش زنجیره ای پلیمراز هر چهار روش بجز نمونه حاصل از روش جوشانیدن ساده پایداری خود در دمای 4 درجه سانتیگراد را بمدت 28 روز حفظ نمودند. این تحقیق با هدف ارزیابی امکان یافتن راهکاری برای بهینه سازی روش ساده جوشانیدن باکتری که بتواند پایداری محصولات واکنش زنجیره ای پلیمراز را تضمین نماید صورت پذیرفته است. یافته کاربردی این مطالعه آن است که جوشانیدن باکتری در بافر TE محتوی 0.02 mg/µl پروتئیناز K ، ضمن آنکه بسرعت و با حداقل هزینه قابل انجام می باشد می تواند در آزمایشگاه هایی که با تعداد زیادی نمونه سالمونلا سروکار دارند مورد استفاده قرار گیرد . | ||
| کلیدواژهها [English] | ||
| استخراج DNA, سالمونلا انتریکا انتریتیدیس, STM2, DNase, پروتئینازK | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 13,719 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 65,421 |
||