| تعداد نشریات | 286 |
| تعداد نشریات سازمان | 84 |
| تعداد شماره‌ها | 2,980 |
| تعداد مقالات | 33,446 |
| تعداد مشاهده مقاله | 43,913,114 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 20,411,920 |
Molecular typing of toxigenic Clostridum perfringens isolated from sheep in Iran | ||
| Archives of Razi Institute | ||
| مقاله 2، دوره 66، شماره 2، بهمن 2011، صفحه 81-86 اصل مقاله (1.25 M) | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/ari.2016.103869 | ||
| نویسندگان | ||
| M. Moosawi shooshtari؛ R. Pilehchian Langroudi؛ M. Esmaelizad؛ S.A.R. Afshari Far؛ A.R. Jabbari* ؛ L. Abdolmohammadi Khiav | ||
| چکیده | ||
| In this research a molecular method based on polymerase chain reaction for typing of Clostridium perfringens was developed and toxin genotypes of 64 isolates from sheep and goats in Iran were determined. The PCR assays were developed for detection of alpha (cpa), beta (cpb) and epsilon (etx) toxin genes, allowing classification of the isolates into genotypes A B, C and D. The field isolates were assigned to genotypes A (n=9, 14.07 %), B (n=20, 31.25%), C (n=17, 26.56%) and D (n=18, 28.12%). In this PCR system the fragments of 900, 611 and 402 bp were amplified using specific primers for alpha, beta and epsilon toxins, respectively. The fragments were confirmed by sequencing and blasting in GenBank. The sequence alignment of the fragments showed more than 98% similarity with other related published sequences from other sources. Our results suggest that PCR genotyping is an acceptable tool for in vitro typing of C. perfringens. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| Clostridium perfringens؛ typing؛ Toxin؛ PCR | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| تعیین تیپ مولکولی کلستریدیوم پرفرینجنز جدا شده از گوسفند و بز در ایران | ||
| نویسندگان [English] | ||
| م. موسوی شوشتری؛ رضا پیله چیان لنگرودی؛ م. اسماعیل زاد؛ سید علی رضا افشاری فر؛ احمدرضا جباری؛ ل. عبدالمحمدی خیاو | ||
| چکیده [English] | ||
| در این مطالعه یک روش مولکولی مبتنی بر واکنش زنجیرهای پلیمراز برای تایپینگ کلستریدیوم پرفرینجنز راه اندازی شده و سپس نسبت به تعیین تیپ64 نمونه کلستریدیوم پرفرینجنز جدا شده از گوسفند و بزدر ایران اقدام گردید . با استفاده از روش واکنش زنجیرهای پلیمراز ژن‌های آلفا، بتا و اپسیلون تکثیر یافته و ژنوتیپ های A، B، C و D مورد شناسایی قرار گرفتند. تعداد 9 عدد (07/14%) از جدایه های آزمایش شده در ژنوتیپ های A ، 20 نمونه (25/31%) در ژنوتیپ B ، 17 نمونه (5/26%) در ژنوتیپ C و 18 نمونه (1/28%) در ژنوتیپ D قرار گرفتند. قطعات مرتبط با هریک از توکسین های آلفا ، بتا و اپسیلون با یک جفت پرایمر اختصاصی که ابتدا روی سویه های رفرانس ( واکسینال ) آزمایش گردید تکثیر داده شدند . در سیستم واکنش زنجیرهای پلیمراز استفاده شده در این مطالعه قطعه مرتبط با ژن توکسین های آلفا ، بتا و اپسیلون به ترتیب 900 ، 611 و 402 جفت باز طول داشتند. هویت قطعات محصول واکنش زنجیرهای پلیمراز ژن‌های آلفا ، بتا و اپسیلون به روش سیکونسینگ و مقایسه آنها در بانک ژن تاًیید گردید. نتایج حاصل از Alignment نشان دهنده تشابه بالای 98% بین توالی حاصل از سویه‌های رفرانس این مطالعه با توالی های موجود در بانک ژن می باشد. نتایج این تحقیق نشان داد که ژنوتایپینگ به روش واکنش زنجیرهای پلیمراز برای تایپینگ کلستریدیوم پرفرینجنز ابزار آزمایشگاهی مناسبی می‌باشد. | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| کلستریدیوم پرفرینجنز, تایپینگ, توکسین, واکنش زنجیرهای پلیمراز | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 15,456 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 1,160 |
||