| تعداد نشریات | 282 |
| تعداد نشریات سازمان | 80 |
| تعداد شمارهها | 3,196 |
| تعداد مقالات | 35,422 |
| تعداد مشاهده مقاله | 52,237,626 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 91,771,769 |
بررسی روابط خویشاوندی برخی گونههای ماشک (Vicia spp.) براساس پروتئینهای ذخیره-ای و نشانگرهای RAPD | ||
| تحقیقات ژنتیک و اصلاح گیاهان مرتعی و جنگلی ایران | ||
| مقاله 4، دوره 20، شماره 1، شهریور 1391، صفحه 39-54 اصل مقاله (561.77 K) | ||
| نوع مقاله: مقاله علمی - پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/ijrfpbgr.2012.6499 | ||
| نویسندگان | ||
| علی اصغری* ؛ زهرا بزرگی؛ مجید شکرپور؛ علی اشرف جعفری | ||
| هیئت علمی | ||
| چکیده | ||
| به منظور بررسی روابط فیلوژنتیکی برخی گونهها، زیرگونهها و اکوتیپهای ماشک، 17 نمونه توسط الکتروفورز پروتئینهای ذخیرهای دانه و 14 نمونه نیز توسط نشانگرهای RAPD (رپید) مورد مطالعه قرار گرفتند. پروتئینهای ذخیرهای دانه از بذرهای جمعآوری شده و DNA نمونهها از برگ بوتههای کشت شده استخراج شد. شاخص تنوع ژنی نی و شانون مربوط به نشانگرهای رپید و پروتئین تفاوت قابل ملاحظهای باهم نداشت، ولی شاخصهای PIC و MI مربوط به نشانگرهای پروتئینی بیشتر از میانگین این شاخصها در آغازگرهای رپید بود. در درخت فیلوژنی براساس نشانگرهای پروتئینی، زیرگونهها و اکوتیپهای گونه sativa در یک شاخه قرار گرفتند. در تجزیه رپید نیز این نمونهها در یک شاخه بزرگ قرار گرفتند که در زیر شاخههای آن گونههای دیگر نیز قرار داشتند. دو اکوتیپ از گونه V. pannonica در یک شاخه و در رده بالاتر، گونه V. cracca قرار گرفت. ترسیم درخت فیلوژنی با استفاده از ترکیب دادههای دو سری نشانگر، نتایج بهتری را ارائه کرد. گروهبندی نمونهها با استفاده از روش تجزیه به مؤلفههای هماهنگ اصلی، با نتایج حاصل از درخت فیلوژنی در هر سه حالت تاحدودی همخوانی داشت. البتّه مقایسه ماتریس فاصله مربوط به نشانگرهای رپید و پروتئین توسط آزمون مانتل، همبستگی کمی بین این دو دسته داده نشان داد. | ||
| کلیدواژهها | ||
| فیلوژنی؛ ماشک؛ نشانگر؛ رپید؛ SDS-PAGE | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| Study of phylogenetic relationships of some Vicia species using storage proteins and RAPD markers | ||
| نویسندگان [English] | ||
| ali asghari؛ zahra bozorgi؛ majid shekarpoor؛ ali ashraf jafar | ||
| چکیده [English] | ||
| In order to evaluate phylogenetic relationships among some Vicia species, subspecies and ecotypes from Iran, 17 and 14 entries were studied using seed storage proteins electrophoresis and RAPDs markers, respectively. Total seed storage proteins were extracted from the collected seeds and DNA was extracted from leaf samples of seedlings. Nei and Shanon genetic diversity indices didn't show considerable difference between RAPD and storage protein data. While the PIC and MI indices for protein markers were greater than those of RAPD markers. In the phylogeny tree based on protein markers, the subspecies and ecotypes of sativa species were classified in the same group. In RAPD analysis, the subspecies and ecotypes were classified in a larger group along with other species. Ecotypes of V. panonica and V. cracca were classified in another group. Constructing the phylogenetic tree using incorporated RAPD and protein markers produced better results than separated ones. Also, classifying the entries using PCoA method was in correspondence to the classifying by phylogenetic trees. The distance matrices from RAPD and protein data were compared using Mantel test and were not observed any significant correlation between the two data sets. | ||
| کلیدواژهها [English] | ||
| Vicia, RAPD, SDS-PAGE, phylogeny | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 2,256 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 1,135 |
||