| تعداد نشریات | 282 |
| تعداد نشریات سازمان | 80 |
| تعداد شماره‌ها | 3,258 |
| تعداد مقالات | 36,030 |
| تعداد مشاهده مقاله | 55,063,835 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 94,084,105 |
Molecular Sequencing and Phylogenetic Analysis of Malassezia pachydermatis Isolates from Dogs and Cats | ||
| Archives of Razi Institute | ||
| مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 27 مهر 1405 اصل مقاله (530.28 K) | ||
| نوع مقاله: Original Articles | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/ari.2026.372093.4031 | ||
| نویسندگان | ||
| Nima Niaee Barmachi* 1؛ Mansour Bayat2؛ Nakisa Sohrabi Haghdoost2؛ Batool ghorbaniyekta3؛ Leila eini farahani4 | ||
| 1Department of Veterinary Microbiology, Islamic Azad University, Iran | ||
| 2Department of Veterinary Microbiology, Science and Research Branch, Islamic Azad University | ||
| 3Department of Physiology, Faculty of Medicine, TeMS.C., Islamic Azad University, Tehran, Iran | ||
| 4Department of Veterinary Basic Sciences, SR.C., Islamic Azad University, Tehran, Iran | ||
| چکیده | ||
| Abstract Introduction: Malassezia pachydermatis is a lipophilic yeast that is part of the normal skin microbiota of dogs and cats but can act as an opportunistic pathogen associated with dermatitis and otitis externa. Molecular characterization is essential for understanding its genetic diversity and epidemiology. This study aimed to perform ITS-1-based sequencing and phylogenetic analysis of M. pachydermatis isolates from companion animals. Materials and Methods: A total of 300 clinical samples were collected from dogs and cats with dermatological lesions or otitis externa in northern Iran. Isolates were identified by culture on modified Dixon agar and ITS-1 PCR. Ten representative isolates were sequenced using the Sanger method. Sequence similarity was analyzed using BLAST, and phylogenetic relationships were inferred using the Neighbour-Joining method with the Kimura two-parameter model and 1000 bootstrap replications. Results: Eighty isolates were identified as Malassezia spp., including 87.5% M. pachydermatis and 12.5% M. nana. All sequenced isolates showed ≥98% similarity with reference strains. Phylogenetic analysis revealed clustering mainly within genotype B. No host-specific clustering was observed between canine and feline isolates. Most isolates showed identical or closely related haplotypes, with high bootstrap support (>70%). Conclusion:The results indicate high genetic homogeneity among M. pachydermatis isolates. ITS-1 sequencing is a reliable method for molecular identification and phylogenetic analysis. The lack of host-specific clustering suggests a shared population structure between canine and feline isolates. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| Companion animals؛ ITS-1؛ Malassezia pachydermatis؛ Molecular sequencing؛ Phylogenetic analysis | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| تعیین توالی مولکولی و آنالیز فیلوژنتیکی جدایه‌های مالاسزیا پاکیدرماتیس از سگ‌ها و گربه‌ها | ||
| چکیده [English] | ||
| مقدمه: Malassezia pachydermatis مخمری لیپوفیل و بخشی از فلور طبیعی پوست سگ و گربه است که می‌تواند به‌عنوان عامل فرصت‌طلب در درماتیت و اوتیت خارجی نقش داشته باشد. این مطالعه با هدف تعیین توالی ITS-1 و بررسی فیلوژنتیکی جدایه‌های این گونه انجام شد. مواد و روش‌ها: ۳۰۰ نمونه بالینی از سگ‌ها و گربه‌های مبتلا به ضایعات پوستی یا اوتیت خارجی در شمال ایران جمع‌آوری شد. شناسایی جدایه‌ها با کشت روی آگار دیکسون اصلاح‌شده و PCR ناحیه ITS-1 انجام گرفت. از میان آن‌ها، ۱۰ جدایه نماینده با روش سنگر تعیین توالی شدند. شباهت توالی‌ها با BLAST و روابط فیلوژنتیکی با روش Neighbour-Joining، مدل دوپارامتری کیمورا و ۱۰۰۰ تکرار بوت‌استرپ بررسی شد. نتایج: از ۸۰ جدایه مالاسزیا، ۸۷٫۵٪ متعلق به Malassezia pachydermatis و ۱۲٫۵٪ متعلق به Malassezia nana بودند. تمام توالی‌ها بیش از ۹۸٪ شباهت با سویه‌های مرجع داشتند. بیشتر جدایه‌ها در ژنوتیپ B قرار گرفتند و بین جدایه‌های سگ و گربه خوشه‌بندی اختصاصی مشاهده نشد. همچنین بیشتر جدایه‌ها هاپلوتیپ‌های یکسان یا نزدیک به هم با پشتیبانی بوت‌استرپ بالای ۷۰٪ نشان دادند. نتیجه‌گیری: نتایج نشان‌دهنده همگنی ژنتیکی بالای جدایه‌های Malassezia pachydermatis است. تعیین توالی ITS-1 روشی قابل اعتماد برای شناسایی مولکولی و تحلیل فیلوژنتیکی این گونه محسوب می‌شود. | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| حیوانات خانگی, ITS-1, مالاسزیا پاکی درماتیس, توالی یابی مولکولی, آنالیز فیلوژنیک | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 3 |
||