Roohani, Kiarash, Vatandour, Safieh, Shoushtari, Abdolhamid, Charkhkar, Saeid, Fallah Mehrabadi, Mohammad Hossein. (1405). Molecular characterization and phylogenetic analysis of highly pathogenic avian influenza A(H5N8) viruses isolated from chicken flocks during the 2016 outbreak in Iran. سامانه مدیریت نشریات علمی, (), -. doi: 10.66224/ari.2026.373696.4259
Kiarash Roohani; Safieh Vatandour; Abdolhamid Shoushtari; Saeid Charkhkar; Mohammad Hossein Fallah Mehrabadi. "Molecular characterization and phylogenetic analysis of highly pathogenic avian influenza A(H5N8) viruses isolated from chicken flocks during the 2016 outbreak in Iran". سامانه مدیریت نشریات علمی, , , 1405, -. doi: 10.66224/ari.2026.373696.4259
Roohani, Kiarash, Vatandour, Safieh, Shoushtari, Abdolhamid, Charkhkar, Saeid, Fallah Mehrabadi, Mohammad Hossein. (1405). 'Molecular characterization and phylogenetic analysis of highly pathogenic avian influenza A(H5N8) viruses isolated from chicken flocks during the 2016 outbreak in Iran', سامانه مدیریت نشریات علمی, (), pp. -. doi: 10.66224/ari.2026.373696.4259
Roohani, Kiarash, Vatandour, Safieh, Shoushtari, Abdolhamid, Charkhkar, Saeid, Fallah Mehrabadi, Mohammad Hossein. Molecular characterization and phylogenetic analysis of highly pathogenic avian influenza A(H5N8) viruses isolated from chicken flocks during the 2016 outbreak in Iran. سامانه مدیریت نشریات علمی, 1405; (): -. doi: 10.66224/ari.2026.373696.4259
Molecular characterization and phylogenetic analysis of highly pathogenic avian influenza A(H5N8) viruses isolated from chicken flocks during the 2016 outbreak in Iran
1Department of Clinical Sciences, Faculty of Veterinary Medicine, Islamic Azad University, Science and Research Branch, Tehran, Iran.
2Department of Animal Science, QaS.C., Islamic Azad University, Qaemshahr, Iran
3Department of Avian Diseases Research and Diagnostics, Razi Vaccine and Serum Research Institute, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran
چکیده
Introduction: The objective of this study was to investigate the genetic diversity, evolutionary relationships, and molecular characteristics of highly pathogenic avian influenza A(H5N8) viruses isolated from Iranian poultry during the 2016 outbreak through sequencing and phylogenetic analysis of the hemagglutinin (HA), neuraminidase (NA), and matrix (M) gene segments. Materials & Methods: Four H5-positive isolates were characterized using RT-PCR, Sanger sequencing, comparative sequence analysis, and maximum-likelihood phylogenetic reconstruction, followed by evaluation of molecular markers associated with pathogenicity, host adaptation, antiviral susceptibility, and viral fitness. Results: Phylogenetic analyses placed all four isolates within HPAI clade 2.3.4.4b and demonstrated close genetic relationships with contemporary strains from Egypt, Nigeria, and Cameroon, while molecular characterization identified a conserved polybasic HA cleavage site, mutations linked to enhanced binding to human-type receptors, the NA I314V substitution associated with reduced oseltamivir susceptibility, and the absence of major M2 antiviral resistance markers. Conclusion: These findings provide an important molecular baseline for H5N8 viruses circulating in Iran, emphasize the value of continuous genomic surveillance for early detection of viral evolution and transboundary spread, and support strengthened veterinary biosecurity and integrated One Health surveillance to reduce risks to poultry production, animal health, and potential zoonotic transmission.
تعیین خصوصیات مولکولی و تحلیل فیلوژنتیکی ویروسهای آنفلوانزای فوق حاد پرندگان زیرگونه A(H5N8) جداشده از گلههای مرغ طی شیوع سال ۲۰۱۶ در ایران
چکیده [English]
مقدمه: هدف از این مطالعه، بررسی تنوع ژنتیکی، روابط تکاملی و ویژگیهای مولکولی ویروسهای آنفلوانزای فوقحاد پرندگان جداشده از طیور ایران در جریان شیوع سال ۲۰۱۶، از طریق توالییابی و تحلیل فیلوژنتیک قطعات ژنی هماگلوتینین، نورآمینیداز و ماتریکس بود.
مواد و روشها: چهار جدایه مثبت H5 با استفاده از روشهای RT-PCR، توالییابی سنگر، تحلیل مقایسهای توالیها و بازسازی فیلوژنتیک به روش Maximum-Likelihood شناسایی شدند. سپس، نشانگرهای مولکولی مرتبط با بیماریزایی، سازگاری با میزبان، حساسیت به داروهای ضدویروسی و Viral Fitness مورد ارزیابی قرار گرفتند.
نتایج: تحلیلهای فیلوژنتیک نشان داد که تمامی چهار جدایه در تبار 2.3.4.4b از ویروسهای آنفلوانزای فوقحاد پرندگان قرار میگیرند و همبستگی ژنتیکی نزدیکی با سویههای همزمان در کشورهای مصر، نیجریه و کامرون دارند. شناسایی مولکولی حاکی از وجود جایگاه برش پلیبازیکِ حفاظتشده در پروتئین هماگلوتینین، جهشهای مرتبط با افزایش اتصال به گیرندههای نوع انسانی، جایگزینی I314V در پروتئین نورآمینیداز (مرتبط با کاهش حساسیت به اسلتامیویر) و عدم وجود نشانگرهای اصلی مقاومت ضدویروسی در ژن M2 پروتئین ماتریکس بود.
نتیجهگیری: این یافتهها یک مبنای مولکولی مهم برای ویروسهای H5N8 در گردش در ایران فراهم میآورد. همچنین بر اهمیت پایش مستمر ژنومیک برای تشخیص زودهنگام تکامل ویروسی و گسترش فرامرزی تأکید کرده و لزوم تقویت امنیت زیستی دامپزشکی و نظارت یکپارچه در قالب رویکرد «سلامت واحد» (One Health) را برای کاهش مخاطرات تولید طیور، سلامت حیوانات و انتقال احتمالی بیماری به انسان (زئونوز) تأیید میکند.
کلیدواژهها [English]
ویروسهای آنفلوانزای فوق حاد پرندگان (HPAIV), ایران, شیوع, فیلوژنتیک, طیور
آمار
تعداد مشاهده مقاله: 7
تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 7
سامانه مدیریت نشریات علمی. طراحی و پیاده سازی از سیناوب