| تعداد نشریات | 282 |
| تعداد نشریات سازمان | 80 |
| تعداد شمارهها | 3,174 |
| تعداد مقالات | 35,266 |
| تعداد مشاهده مقاله | 51,116,253 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 91,070,711 |
Molecular Characterization and Phylogenetic Analysis of the S1 Gene of Infectious Bronchitis Virus (IBV) Isolates from Broiler Farms in Markazi Province, Iran | ||
| Archives of Razi Institute | ||
| مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 23 اردیبهشت 1405 اصل مقاله (876.89 K) | ||
| نوع مقاله: Original Articles | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/ari.2026.371023.3896 | ||
| نویسندگان | ||
| Saeideh Ebrahimi* 1؛ vahide Vahidi2؛ Neda Akbari2؛ Parvaneh Jafari2 | ||
| 1Central branch, Razi Vaccine and Serum Research Institute, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Arak, Iran | ||
| 2Department of Microbiology, Arak branch, Islamic Azad University, Arak, Iran | ||
| چکیده | ||
| Infectious bronchitis (IB) is a contagious disease affecting chickens of any age and causes an extremely contagious disease that results in significant financial losses to the worldwide chicken industry. It affects both vaccinated and unvaccinated flocks globally. More information is needed about the recent IBV strains that have spread in Iran's Markazi province. Therefore, this study was designed to isolate IBV from broiler farms showing respiratory distress in Iran’s Markazi province and to analyze the evolutionary and molecular traits of the obtained isolates collected between 2017 and 2019. In this investigation, tracheal and lung tissues were obtained from 42 poultry farms where chickens showed respiratory distress. These samples were inoculated into 9–11-day-old embryonated eggs, resulting in virus isolation from 10 of the examined farms. Afterwards, RT-PCR was applied to amplify fragments of the S1 gene from the newly detected isolates, and the obtained amplicons were sequenced and phylogenetically compared with a reference dataset. As determined by phylogenetic analysis, in total, 10 of 42 (23.80%) samples were evaluated as positive for Bronchitis virus . All ten isolates were sent for sequencing but three of them were failed in sequencing (two time) and finally, seven isolates were sequenced correctly. six isolates were in the GI-23 genotype from seven sequenced samples, and one isolate was in the GI-1 genotype. Therefore, GI-23 is the dominant genotype of IBV circulating in chicken farms of Markazi province, which has a low degree of homology with the vaccines used in the country. Continuous monitoring of each region's circulating genotypes and compliance with health and biosecurity principles can be applied to reduce the complications of viral diseases involved in respiratory syndrome. | ||
| کلیدواژهها | ||
| Chicken؛ IBV؛ phylogenetic analysis؛ S1 gene | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| خصوصیات مولکولی و تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک ژن S1 ویروس برونشیت عفونی (IBV) جدا شده از مزارع گوشتی در استان مرکزی ، ایران | ||
| چکیده [English] | ||
| برونشیت عفونی (IB) یک بیماری مسری است که مرغها را در هر سنی مبتلا میکند و باعث یک بیماری بسیار مسری میشود که منجر به خسارات مالی قابل توجهی به صنعت مرغداری در سراسر جهان میشود. این بیماری هم گلههای واکسینه شده و هم واکسینه نشده را در سطح جهان تحت تأثیر قرار میدهد. اطلاعات بیشتری در مورد سویههای اخیر ویروس برونشیت عفونی که در استان مرکزی ایران شیوع یافتهاند، مورد نیاز است. بنابراین، این مطالعه برای جداسازی ویروس برونشیت عفونی از مزارع مرغ گوشتی که علائم تنفسی در استان مرکزی ایران نشان میدهند و تجزیه و تحلیل صفات تکاملی و مولکولی جدایههای جمعآوریشده بین سالهای ۲۰۱۷ تا ۲۰۱۹ طراحی شده است. در این تحقیق، بافتهای نای و ریه از ۴۲ مزرعه مرغداری که مرغها علائم تنفسی نشان دادند، به دست آمد. این نمونهها به تخممرغهای جنیندار ۹ تا ۱۱ روزه تلقیح شدند و در نتیجه ویروس از ۱۰ مزرعه مورد بررسی جدا شد. پس از آن، از RT-PCR برای تکثیر قطعاتی از ژن S1 از جدایههای تازه شناساییشده استفاده شد و آمپلیکونهای بهدستآمده توالییابی و از نظر فیلوژنتیکی با یک مجموعه داده مرجع مقایسه شدند. همانطور که با آنالیز فیلوژنتیک مشخص شد، در مجموع، 10 نمونه از 42 نمونه (23.80٪) از نظر ویروس برونشیت مثبت ارزیابی شدند. هر ده جدایه برای تعیین توالی ارسال شدند، اما سه مورد از آنها در تعیین توالی (دو بار) ناموفق بودند و در نهایت، هفت جدایه به درستی تعیین توالی شدند. شش جدایه از هفت نمونه تعیین توالی شده در ژنوتیپ GI-23 و یک جدایه در ژنوتیپ GI-1 قرار داشتند. بنابراین، GI-23 ژنوتیپ غالب ویروس برونشیت عفونی در حال گردش در مزارع مرغ استان مرکزی است که درجه همولوژی پایینی با واکسنهای مورد استفاده در کشور دارد. پایش مداوم ژنوتیپهای در گردش هر منطقه و رعایت اصول بهداشتی و امنیت زیستی میتواند برای کاهش عوارض بیماریهای ویروسی مرتبط با سندرم تنفسی اعمال شود. | ||
| کلیدواژهها [English] | ||
| مرغ, ویروس برونشیت عفونی, آنالیز فیلوژنتیک, ژن S1 | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 20 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 26 |
||