| تعداد نشریات | 282 |
| تعداد نشریات سازمان | 80 |
| تعداد شماره‌ها | 3,262 |
| تعداد مقالات | 36,057 |
| تعداد مشاهده مقاله | 55,176,181 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 94,175,544 |
Bioinformatic identification of B-cell epitope for designing Multitope Peptide-Based Vaccine against Covid-19 | ||
| Archives of Razi Institute | ||
| مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 17 فروردین 1405 اصل مقاله (1.36 M) | ||
| نوع مقاله: Original Articles | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/ari.2026.371288.3932 | ||
| نویسندگان | ||
| Zahra Rashidian1؛ Mohammadreza Nassiri1؛ Alireza Haghparast2؛ Mohammad Hadi Sekhavati1؛ Ali Javadmanesh* 1 | ||
| 1Department of Animal Science, Faculty of Agriculture, Ferdowsi University of Mashhad | ||
| 2Department of Pathobiology, Faculty of Veterinary Medicine, Ferdowsi University of Mashhad | ||
| چکیده | ||
| Introduction: During the global outbreak of COVID-19, the crucial role of vaccination in enhancing population immunity, limiting viral transmission, and reducing disease severity, hospitalizations, and mortality became evident. The purpose of all vaccines is to expose the body to an antigen that will not cause disease, but will stimulate the immune system. There are different vaccines against the corona virus. An important aspect of COVID-19 vaccine development is the wide variety of technological platforms that have been explored for producing effective immunization strategies, among which recombinant protein–based vaccines are characterized by high protein expression efficiency, favorable long-term stability, and the ability to elicit robust immune responses. The aim of this research was to design the first Multi-epitope Peptide Vaccine (MPV) candidate targeting SARS-CoV-2. Materials and Methods: Protein sequences were retrieved from public databases, and key epitope-rich regions were linked using rigid peptide linkers. The physicochemical properties of the construct, including antigenicity, allergenicity, toxicity, stability, half-life, and molecular features, were evaluated using bioinformatics tools. Results: Comprehensive in silico analyses confirmed the construct's promising vaccine profile: it was predicted to be highly antigenic (VaxiJen score up to 1.698), non-allergenic, non-toxic, and stable (instability index: 37.59). Structural modeling and validation yielded a high-quality 3D model with 96.1% of residues in favored Ramachandran regions and a ProSA Z-score of -2.46, indicative of native-like folding. Conclusion: These computational results suggest that the designed multi-epitope construct holds strong potential to have a protective immune response against COVID-19. Nevertheless, further laboratory and in-vivo investigations will be required for validating its safety, immunogenicity, and protective potential. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| Bioinformatics؛ Multitope Peptide؛ Recombinant Protein؛ SARS-CoV-2؛ Vaccine | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| شناسایی بیوانفورماتیکی اپیتوپ برای طراحی واکسن مبتنی بر پپتیدهای پلی توپی ضد کووید-19 | ||
| چکیده [English] | ||
| مقدمه: در بحبوحه سونامی همه‌گیری کووید-۱۹، مشخص شد که واکسن‌ها می‌توانند نقش اساسی در افزایش ایمنی جمعیت، کاهش شیوع همه‌گیری، جلوگیری از شرایط شدید ناشی از عفونت کووید-۱۹، بستری شدن در بیمارستان و مرگ و میر داشته باشند. هدف همه واکسن‌ها، قرار دادن بدن در معرض آنتی‌ژنی است که باعث بیماری نمی‌شود، اما سیستم ایمنی را تحریک می‌کند. واکسن‌های مختلفی علیه ویروس کرونا وجود دارد. یکی از ویژگی‌های قابل توجه چشم‌انداز توسعه واکسن برای کووید-۱۹، طیف وسیعی از پلتفرم‌های فناوری است که مورد ارزیابی قرار می‌گیرند، از جمله واکسن‌های مبتنی بر پروتئین نوترکیب، سطح بالایی از بیان پروتئین و پایداری طولانی مدت را ارائه می‌دهند و پاسخ‌های ایمنی قوی را القا می‌کنند. هدف از این تحقیق، توسعه اولین واکسن مبتنی بر پپتید چند وجهی (MPV) علیه SARS-CoV-2 بود. مواد و روشها: برای انجام این مطالعه، توالی پروتئین‌های مهم ویروس کرونا از پایگاه داده NCBI به دست آمد و مهمترین قطعات انتخاب و سپس توسط اتصال‌دهنده‌های سفت و سخت به هم متصل شدند. در مرحله بعد، ساختارهای سوم ساخته شدند و ویژگی‌های فیزیکوشیمیایی ساختار طراحی‌شده شامل اپیتوپ سلول B، آنتی‌ژنیسیته، آلرژی‌زایی، سمیت، پایداری، نیمه‌عمر، بار، وزن مولکولی و قطبیت مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. نتایج: ارزیابی بیوانفورماتیک نشان داد که ساختار پروتئین طراحی‌شده می‌تواند آب‌دوست، مقاوم در برابر حرارت و قلیایی باشد. بر اساس یافته‌های این مطالعه، پیش‌بینی می‌شود که پلی‌توپ طراحی‌شده در این مطالعه می‌تواند به عنوان یک پلی‌پپتید مؤثر برای ایجاد پاسخ ایمنی علیه کووید-۱۹ مورد استفاده قرار گیرد. نتیجه گیری: با این حال، اگرچه نتایج in-silico امیدوارکننده است، آزمایش‌های بیشتر در شرایط آزمایشگاهی (in vitro) و درون‌تنی (in vivo) برای تأیید ایمنی، اثربخشی و توانایی واکسن در تحریک پاسخ ایمنی محافظتی در برابر SARS-CoV-2 مورد نیاز است. | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| SARS-CoV-2, واکسن, پپتید پلی توپی, پروتئین نوترکیب, بیوانفورماتیک | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 128 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 144 |
||