Bastamifard, Marziyeh, Shakib, Pegah, Zolfaghari, Mohammad Reza, Aghaei, Seyed Soheil, Morovvati, Abbas. (1404). Design a Multiplex PCR Molecular Technique to Detect Sexually Transmitted Agents, Neisseria gonorrhoeae, Chlamydia trachomatis, Trichomonas vaginalis, Herpes Simplex Virus Type 2, and Human Papillomavirus. سامانه مدیریت نشریات علمی, 80(6), 1437-1442. doi: 10.66224/ARI.80.6.3409
Marziyeh Bastamifard; Pegah Shakib; Mohammad Reza Zolfaghari; Seyed Soheil Aghaei; Abbas Morovvati. "Design a Multiplex PCR Molecular Technique to Detect Sexually Transmitted Agents, Neisseria gonorrhoeae, Chlamydia trachomatis, Trichomonas vaginalis, Herpes Simplex Virus Type 2, and Human Papillomavirus". سامانه مدیریت نشریات علمی, 80, 6, 1404, 1437-1442. doi: 10.66224/ARI.80.6.3409
Bastamifard, Marziyeh, Shakib, Pegah, Zolfaghari, Mohammad Reza, Aghaei, Seyed Soheil, Morovvati, Abbas. (1404). 'Design a Multiplex PCR Molecular Technique to Detect Sexually Transmitted Agents, Neisseria gonorrhoeae, Chlamydia trachomatis, Trichomonas vaginalis, Herpes Simplex Virus Type 2, and Human Papillomavirus', سامانه مدیریت نشریات علمی, 80(6), pp. 1437-1442. doi: 10.66224/ARI.80.6.3409
Bastamifard, Marziyeh, Shakib, Pegah, Zolfaghari, Mohammad Reza, Aghaei, Seyed Soheil, Morovvati, Abbas. Design a Multiplex PCR Molecular Technique to Detect Sexually Transmitted Agents, Neisseria gonorrhoeae, Chlamydia trachomatis, Trichomonas vaginalis, Herpes Simplex Virus Type 2, and Human Papillomavirus. سامانه مدیریت نشریات علمی, 1404; 80(6): 1437-1442. doi: 10.66224/ARI.80.6.3409
Design a Multiplex PCR Molecular Technique to Detect Sexually Transmitted Agents, Neisseria gonorrhoeae, Chlamydia trachomatis, Trichomonas vaginalis, Herpes Simplex Virus Type 2, and Human Papillomavirus
1Department of Microbiology, Qo.C., Islamic Azad University, Qom, Iran.
2Razi Herbal Medicines Research Center, Lorestan University of Medical Sciences, Khorramabad, Iran.
چکیده
Introduction: Sexually transmitted infections (STIs) that cause sexually transmitted diseases (STDs) include various organisms such as bacteria, viruses, parasites, and fungi. These organisms are transmitted through sexual activity, which can lead to problems such as infertility, ectopic pregnancy, and the risk of genital cancers. Therefore, quick diagnosis of sexually transmitted agents is important. In recent decades, the detection of microbial agents has been improved by using molecular techniques, because it is challenging and often impossible to isolate a disease agent from clinical samples simultaneously and quickly. Most unsuccessful cases and time-consuming culture-based methods have led to the non-identification of microbial agents. This study aims to design a multiplex PCR technique for detecting sexually transmitted agents, Neisseria gonorrhoeae, Chlamydia trachomatis, Trichomonas vaginalis, herpes simplex virus type 2 (HSV-2), and human papillomavirus (HPV) in 2022 in Qom, Iran. Materials & Methods: In the current study, about 100 Pap smear samples of patients in Qom City, Iran, were evaluated over a one-year period (2022) for testing HSV-2, HPV, N. gonorrhoeae, C. trachomatis, and T. vaginalis using multiplex polymerase chain reaction (PCR) design. Results: In the investigated samples, the frequency of C. trachomatis, N. gonorrhoeae, T. vaginalis, HSV-2, and HPV was 8%, 5%, 3%, 12%, and 18%, respectively. HPV and C. trachomatis agents were found in five samples, and HPV and T. vaginalis co-infection was observed in two samples. Conclusion: The multiplex PCR method has higher speed, accuracy, specificity, and sensitivity. With this molecular technique, simultaneous infections can be detected faster and more accurately in clinical samples such as Pup smears, effectively speeding up treatment and reducing infection transmission.
طراحی تکنیک مولکولی Multiplex PCR برای شناسایی عوامل مقاربتی، نایسریا گونوره، کلامیدیا تراکوماتیس، تریکوموناس واژینالیس، ویروس هرپس نوع 2 و ویروس پاپیلوم
چکیده [English]
عفونت های مقاربتی (STIs) که باعث بیماری های مقاربتی (STDs) می شوند، شامل ارگانیسم های مختلفی مانند باکتری ها، ویروس ها، انگل ها و قارچ ها هستند. این ارگانیسم ها از طریق فعالیت جنسی منتقل می شوند که می تواند مشکلاتی مانند ناباروری، حاملگی خارج رحمی و خطر ابتلا به سرطان های تناسلی را افزایش دهد. بنابراین تشخیص سریع عوامل مقاربتی مهم است. در دهههای اخیر، شناسایی عوامل میکروبی با استفاده از تکنیکهای مولکولی تحت تأثیر قرار گرفته است، زیرا جداسازی همزمان و سریع عوامل بیماری از نمونههای بالینی بسیار دشوار و غیرممکن است. با توجه به اینکه اکثر موارد ناموفق و همچنین روش های زمان بر مبتنی بر کشت منجر به عدم شناسایی عوامل میکروبی می شود. هدف این مطالعه طراحی یک تکنیک PCR مالتی پلکس برای تشخیص عوامل مقاربتی نایسریا گونوره، کلامیدیا تراکوماتیس، تریکوموناس واژینالیس، ویروس هرپس نوع 2) HSV-2(و ویروس پاپیلومای (HPV) است. در مطالعه حاضر، حدود 100 نمونه پاپ اسمیر از بیماران شهر قم در یک نقطه زمانی یک ساله (در سال 2022) برای آزمایش HSV-2، HPV، نایسریا سوزاک، کلامیدیا تراکوماتیس و تریکوموناس واژینالیس با استفاده از مالتی پلکس مورد بررسی قرار گرفتند. طراحی PCR در نمونه های مورد بررسی فراوانی کلامیدیا تراکوماتیس، نایسریا سوزاک، تریکوموناس واژینالیس، HSV-2 و HPV به ترتیب 8، 5، 3، 12 و 18 درصد بود. عوامل HPV و Chlamydia trachomatis در 5 نمونه و عفونت همزمان HPV و تریکوموناس واژینالیس در دو نمونه مشاهده شد. روش PCR-multiplex سرعت، دقت، ویژگی و حساسیت بالاتری دارد. با استفاده از این تکنیک مولکولی، عفونتهای همزمان را میتوان سریعتر در نمونههای بالینی مانند اسمیر شرمگاهی تشخیص داد، که میتواند به طور موثر درمان را تسریع کند و انتقال عفونت را کاهش دهد.
کلیدواژهها [English]
عفونت های مقاربتی (STIs), بیماری های مقاربتی (STDs), تشخیص مولکولی
Sadeqi S, Nikkhahi F, Javadi A, Eskandarion S, Amin Marashi SM. Development of multiplex real-time quantitative PCR for simultaneous detection of Chlamydia trachomatis, Mycoplasma hominis, Ureaplasma urealyticum, and Mycoplasma genitalium in infertile women. Indian J Med Microbiol. 2022; 40(2):231-4. [DOI:10.1016/j.ijmmb.2022.01.011] [PMID]
de Souza LS, Sardinha JC, Talhari S, Heibel M, Santos MND, Talhari C. Main etiological agents identified in 170 men with urethritis attended at the Fundação Alfredo da Matta, Manaus, Amazonas, Brazil. An Bras Dermatol. 2021; 96(2):176-83. [DOI:10.1016/j.abd.2020.07.007] [PMID]
Kılıç M, Beşli Y, Köseoğlu E, Palaoğlu EK, Esen T. Gardnerella vaginalis: Is it an Underestimated Cause of Urinary Symptoms in Males? Infect Dis Clin Microbiol. 2022; 4(3):172-7.[DOI:10.36519/idcm.2022.172] [PMID]
de Souza LS, Sardinha JC, Talhari S, Heibel M, Santos MND, Talhari C. Main etiological agents identified in 170 men with urethritis attended at the Fundação Alfredo da Matta, Manaus, Amazonas, Brazil. An Bras Dermatol. 2021; 96(2):176-83. [DOI:10.1016/j.abd.2020.07.007] [PMID]
Carneiro FP, Darós AC, Darós ACM, de Castro TMML, de Vasconcelos Carneiro M, Fidelis CR, et al. Cervical Cytology of Samples with Ureaplasma urealyticum, Ureaplasma parvum, Chlamydia trachomatis, Trichomonas vaginalis, Mycoplasma hominis, and Neisseria gonorrhoeae Detected by Multiplex PCR. Biomed Res Int. 2020; 2020:7045217. [DOI:10.1155/2020/7045217] [PMID]
Suehiro TT, Gimenes F, Souza RP, Taura SKI, Cestari RCC, Irie MMT, et al. High molecular prevalence of HPV and other sexually transmitted infections in a population of asymptomatic women who work or study at a Brazilian university. Rev Inst Med Trop Sao Paulo. 2021; 63:e1. [DOI:10.1590/s1678-9946202163001] [PMID]
Ma W, Chen Z, Niu S. Advances and challenges in sexually transmitted infections prevention among men who have sex with men in Asia. Curr Opin Infect Dis. 2023; 36(1):26-34. [DOI:10.1097/QCO.0000000000000892] [PMID]
No Author. CLC Sequence Viewer version 6 [Internet]. 2026 [26 January 2026]. Available from: [Link]
No Author. Gene Runner software version 6.5.52 beta [Internet]. 2026 [26 January 2026]. Available from: [Link]
No Author. NCBI website [Internet]. 2026 [26 January 2026]. Available from: [Link]
Faroughi E, Amini K. [Molecular identification of Neisseria gonorrhoeae and Toxoplasma gondii isolated from infertile women with vaginal swab samples by Multiplex-PCR (Persian)]. Alborz Uni Med J. 2021; 10(3):297-304. [Link[
Kriesel JD, Bhatia AS, Barrus C, Vaughn M, Gardner J, Crisp RJ. Multiplex PCR testing for nine different sexually transmitted infections. Int J STD AIDS. 2016; 27(14):1275-82. [DOI:10.1177/0956462415615775] [PMID]
Beayni NE, Hamad L, Nakad C, Keleshian S, Yazbek SN, Mahfouz R. Molecular prevalence of eight different sexually transmitted infections in a Lebanese major tertiary care center: impact on public health. Int J Mol Epidemiol Genet. 2021; 12(2):16-23. [PMID]
Yuan L, Xia D, Zhou Q, Xu W, Xu S, Yin Y. An evaluation of a multiplex PCR assay for the detection of Treponema pallidum, HSV-1, and HSV-2. Diagnos Microbiol Infect Dis.2023; 106(3):115958. [DOI:10.1016/j.diagmicrobio.2023.115958] [PMID]
Carneiro FP, Darós AC, Darós ACM, de Castro TMML, de Vasconcelos Carneiro M, Fidelis CR, et al. Cervical cytology of samples with ureaplasma urealyticum, ureaplasma parvum, chlamydia trachomatis, trichomonas vaginalis, mycoplasma hominis, and neisseria gonorrhoeae detected by multiplex PCR. Biomed Res Int. 2020; 2020:7045217. [DOI:10.1155/2020/7045217] [PMID]
Hernández-Rosas F, Rey-Barrera M, Conejo-Saucedo U, Orozco-Hernández E, Maza-Sánchez L, Navarro-Vidal E, et al. Monitoring sexually transmitted infections in cervicovaginal exfoliative samples in Mexican Women. Pathogens. 2021; 10(12):1618. [DOI:10.3390/pathogens10121618] [PMID]
Neena A, Deepa R. Detection of chlamydia trachomatis infection among the pregnant women attending a tertiary care hospital in Kerala - South India by polymerase chain reaction. Indian J Med Microbiol. 2020; 38(3 & 4):319-23. [DOI:10.4103/ijmm.IJMM_19_429] [PMID]
آمار
تعداد مشاهده مقاله: 265
تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 258
سامانه مدیریت نشریات علمی. طراحی و پیاده سازی از سیناوب