| تعداد نشریات | 282 |
| تعداد نشریات سازمان | 80 |
| تعداد شماره‌ها | 3,272 |
| تعداد مقالات | 36,131 |
| تعداد مشاهده مقاله | 55,698,185 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 94,483,281 |
Identification of Mycobacterium spp. Isolates From Suspected Tuberculosis Patients Using Molecular Methods in Zahedan, Iran | ||
| Archives of Razi Institute | ||
| مقاله 20، دوره 81، شماره 1، فروردین و اردیبهشت 2026، صفحه 173-182 اصل مقاله (967.99 K) | ||
| نوع مقاله: Original Articles | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.66224/ARI.81.1.3715 | ||
| نویسندگان | ||
| Fatemeh Alimardani1؛ Nader Mosavari* 1؛ Soheila Moradi Bidhendi1؛ Ali Reza Salimi Khorashad2؛ Lida Abdolmohammadi Khiav3 | ||
| 1Department of Microbiology, Razi Vaccine and Serum Research Institute, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran. | ||
| 2Department of Parasitology and Mycology, Infectious Diseases and Tropical Medicine Research Center, School of Medicine, Research Institute of Cellular and Molecular Sciences in Infectious Diseases, Zahedan University of Medical Sciences, Zahedan, Iran. | ||
| 3Department of Anaerobic Bacterial Vaccine Production and Research, Razi Vaccine and Serum Research Institute, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran. | ||
| چکیده | ||
| Introduction: Tuberculosis is one of the oldest zoonotic diseases, with a high prevalence in many low-income countries. Specific and sensitive tuberculosis diagnostic methods in the early stages play a significant role in saving the lives of patients. There is little data available in Zahedan on the prevalence of the Mycobacterium species, so this study aimed to identify the Mycobacterium species in patients with pulmonary tuberculosis in Zahedan. Materials & Methods: This study included 500 samples collected from sputum in Zahedan. The samples were cultured on LJ and simultaneously stained with cold Ziehl-Neelsen (ZN). After growth, DNA was extracted and used for molecular identification of the Mycobacterium species from the samples. RD typing was used to differentiate members of the Mycobacterium tuberculosis complex. Finally, the PCR-RFLP method was used as a comparison method. Results: The typical 543 bp band was observed in all isolates via amplicon PCR-16S rRNA, emphasizing that all isolates belong to the genus Mycobacterium. Sixty isolates were identified as belonging to the MTBC and were classified as M. tuberculosis species. The PCR-RFLP analysis using Alu I on the oxyR gene confirmed that all 60 isolates were M. tuberculosis. Three samples (4.7%) were also positive for Nontubercolous mycobacteria (NTM). One isolate was categorized in the M. terrae complex group (MTC), and two isolates belonged to the M. simiae group. Conclusion: Our results indicated that M. tuberculosis has a high prevalence in the human population of this city. Therefore, screening these individuals plays a significant role in reducing the prevalence of the disease in Zahedan. It is suggested that further studies be conducted on the human population to find Mycobacterium strains in the future. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| Mycobacterium tuberculosis؛ NTM؛ PCR؛ PCR-RFLP؛ Zahedan | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| شناسایی جدایه‌های گونه‌های مایکوباکتریوم از بیماران مشکوک به سل با استفاده از روش مولکولی در زاهدان، ایران | ||
| چکیده [English] | ||
| سل یکی از قدیمی‌ترین بیماری‌های مشترک بین انسان و دام است که شیوع بالایی در بسیاری از کشورهای کم‌درآمد دارد. روش‌های تشخیصی اختصاصی سل در مراحل اولیه نقش مهمی در نجات جان بیماران دارند. داده‌های کمی در زاهدان در مورد شیوع گونه‌های مایکوباکتریوم موجود است، بنابراین این مطالعه با هدف شناسایی گونه‌های مایکوباکتریوم در بیماران مبتلا به سل ریوی در زاهدان انجام شد. این مطالعه شامل ۵۰۰ نمونه جمع‌آوری‌شده از خلط زاهدان بود. نمونه‌ها بر روی محیط کشت LJ کشت داده شدند و همزمان با ZN سرد رنگ‌آمیزی شدند. پس از رشد، DNA استخراج و برای شناسایی مولکولی گونه‌های مایکوباکتریوم از نمونه‌ها استفاده شد. از تایپینگ RD برای تمایز اعضای کمپلکس مایکوباکتریوم توبرکلوزیس استفاده شد. در نهایت، از روش PCR-RFLP به عنوان روش مقایسه‌ای استفاده شد. باند معمول ۵۴۳ جفت بازی در همه ایزوله‌ها از طریق آمپلیکون PCR-16S rRNA مشاهده شد که تأکید می‌کند همه ایزوله‌ها متعلق به جنس مایکوباکتریوم هستند. شصت ایزوله متعلق به MTBC شناسایی و به عنوان گونه‌های M. tuberculosis طبقه‌بندی شدند. آنالیز PCR-RFLP با استفاده از Alu I روی ژن oxyR تایید کرد که هر 60 جدایه، مایکوباکتریوم توبرکلوزیس بودند. سه نمونه (4.7%) نیز برای NTM مثبت بودند. یک جدایه در گروه کمپلکس M. terrae (MTC) طبقه‌بندی شد و دو جدایه متعلق به گروه M. simiae بودند. نتایج ما نشان داد که مایکوباکتریوم توبرکلوزیس شیوع بالایی در جمعیت انسانی این شهر دارد. بنابراین، غربالگری این افراد نقش مهمی در کاهش شیوع بیماری در زاهدان ایفا می کند. پیشنهاد می‌شود مطالعات بیشتری روی جمعیت انسانی برای یافتن سویه‌های مایکوباکتریوم در آینده انجام شود. | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| مایکوباکتریوم توبرکلوزیس, NTM, PCR, PCR-RFLP, زاهدان | ||
|
سایر فایل های مرتبط با مقاله
|
||
| مراجع | ||
|
Behr MA, Kaufmann E, Duffin J, Edelstein PH, Ramakrishnan L. Latent tuberculosis: Two centuries of confusion. Am J Respir Crit Care Med. 2021; 204(2):142-8. [DOI:10.1164/rccm.202011-4239PP] [PMID]
Ravansalar H, Tadayon K, Ghazvini K. Molecular typing methods used in studies of Mycobacterium tuberculosis in Iran: a systematic review. Iran J Microbiol. 2016; 8(5):338-46. [PMID]
World Health Organization. Global tuberculosis report. Geneva: WHO; 2023. [Link]
Parsons LM, Brosch R, Cole ST, Somoskövi A, Loder A, Bretzel G, et al. Rapid and simple approach for identification of Mycobacterium tuberculosis complex isolates by PCR-based genomic deletion analysis. J Clin Microbiol. 2002; 40(7):2339-45. [DOI:10.1128/JCM.40.7.2339-2345.2002][PMID]
Fallahzadeh H, Khazaei Z, Najafi ML, Pordanjani SR, Goodarzi E. Distribution incidence, mortality of tuberculosis and human development index in Iran: Estimates from the global burden of disease study 2019. BMC Public Health. 2023; 23(1):2404. [DOI:10.1186/s12889-023-17114-4][PMID]
Shakiba Mehr. Reported Mycobacterium bois from suspected patients with TB in Zahedan. 2015. [Unpublished]
Van Soolingen D, Hoogenboezem T, De Haas PE, Hermans PW, Koedam MA, Teppema KS, et al. A novel pathogenic taxon of the Mycobacterium tuberculosis complex, Canetti: characterization of an exceptional isolate from Africa. Int J Syst Bacteriol. 1997; 47(4):1236-45. [DOI:10.1099/00207713-47-4-1236] [PMID]
Sreevatsan S, Escalante P, Pan X, Gillies DA 2nd, Siddiqui S, Khalaf CN, et al. Identification of a polymorphic nucleotide in oxyR specific for Mycobacterium bovis. J Clin Microbiol. 1996; 34(8):2007-10. [DOI:10.1128/jcm.34.8.2007-2010.1996][PMID]
Clustal. Chromas and Clustal X programs [Internet]. 2026 [Uupdated 7 April 2026]. Available from: [link]
Blast.cgi. NCBI BLAST. 2026 [Uupdated 7 April 2026]. Available from: [Link]
Huard RC, Lazzarini LC, Butler WR, van Soolingen D, Ho JL. PCR-based method to differentiate the subspecies of the Mycobacterium tuberculosis complex on the basis of genomic deletions. J Clin Microbiol. 2003; 41(4):1637-50. [DOI:10.1128/JCM.41.4.1637-1650.2003][PMID]
van Embden JD, Cave MD, Crawford JT, Dale JW, Eisenach KD, Gicquel B, et al. Strain identification of Mycobacterium tuberculosis by DNA fingerprinting: Recommendations for a standardized methodology. J Clin Microbiol. 1993; 31(2):406-9. [DOI:10.1128/jcm.31.2.406-409.1993][PMID]
Warren RM, Gey van Pittius NC, Barnard M, Hesseling A, Engelke E, de Kock M, et al. Differentiation of Mycobacterium tuberculosis complex by PCR amplification of genomic regions of difference. Int J Tuberc Lung Dis. 2006; 10(7):818-22. [PMID]
Torabi N, Mosavari N, Nazari R. [Molecular identification of Mycobacterium tuberculosis complex by RD-Typing and PCR-RFLP Method (Persian)]. Vet Res Biol Prod. 2017; 30(3):16-25. [Link]
Dehghanpour M, Baghcheh Saraee H, Mosavari N, Mazloom Zadeh S. [Isolation of Mycobacterium bovis from tuberculosis patients in Zanjan Province (2013) (Persian)]. J Adv Med Biomed Res. 2016; 24(107):71-83. [Link]
Karami-Zarandi M, Bahador A, Gizaw Feysia S, Kardan-Yamchi J, Hasan-Nejad M, Vosough H, et al. Identification of non-tuberculosis mycobacteria by line probe assay and determination of drug resistance patterns of isolates in Iranian patients. Arch Razi Inst. 2019; 74(4):375-84. [Link]
Ledesma Y, Echeverría G, Claro-Almea FE, Silva D, Guerrero-Freire S, Rojas Y, et al. The re-identification of previously unidentifiable clinical non-tuberculous mycobacterial isolates shows great species diversity and the presence of other acid-fast genera. Pathogens. 2022; 11(10):1159. [DOI:10.3390/pathogens11101159][PMID]
Hoefsloot W, Van Ingen J, Andrejak C, Ängeby K, Bauriaud R, Bemer P, et al. The geographic diversity of nontuberculous mycobacteria isolated from pulmonary samples: An NTM-NET collaborative study. Eur Respir J. 2013; 42(6):1604-13. [DOI:10.1183/09031936.00149212][PMID]
Shafipour M, Shirzad-Aski H, Ghaemi EA, Sohrabi A, Taziki M, Kochkaksaraei MB, et al. Occurrence and risk factors of nontuberculous mycobacteria in tuberculosis-suspected patients in the north of Iran. Iran J Microbiol. 2021; 13(2):190-8. [DOI:10.18502/ijm.v13i2.5980][PMID]
Ong LT. Epidemiology of nontuberculous mycobacteria infection in Asia: A Narrative Review. Indian J Tuberc. 2025; 72(2):259-65 [DOI:10.1016/j.ijtb.2024.08.006] [PMID]
Firoozeh F, Firoozeh A, Salmani A. An update on the prevalence of nontuberculous in clinical samples in Iran during 2000-2022: A Retrospective Systematic Review and Meta-Analysis. Med Lab J. 2023; 17(3):22-31. [DOI:10.61186/mlj.17.3.22]
Hassansoltan Solaghani T, Nazari R, Mosavari N, Tadayon K, Zolfaghari MR. Isolation and identification of nontuberculous mycobacteria from raw milk and traditional cheese based on the 16S rRNA and hsp65 genes, Tehran, Iran. Folia Microbiol (Praha). 2024; 69(1):81-9. [DOI:10.1007/s12223-023-01073-9] [PMID]
Lee CK, Gi HM, Cho Y, Kim YK, Lee KN, Song KJ, et al. The genomic heterogeneity among Mycobacterium terrae complex displayed by sequencing of 16S rRNA and hsp65 genes. Microbiol Immunol. 2004; 48(2):83-90. [DOI:10.1111/j.1348-0421.2004.tb03492.x] [PMID]
Abudaff NN, Beam E. Mycobacterium arupense: A review article on an emerging potential pathogen in the Mycobacterium terrae complex. J Clin Tuberc Other Mycobact Dis. 2017; 10:1-5. [DOI:10.1016/j.jctube.2017.11.001][PMID]
Masaki T, Ohkusu K, Hata H, Fujiwara N, Iihara H, Yamada‐Noda M, et al. Mycobacterium kumamotonense sp. nov. recovered from clinical specimen and the first isolation report of Mycobacterium arupense in Japan: Novel slowly growing, nonchromogenic clinical isolates related to Mycobacterium terrae complex. Microbiol Immunol. 2006; 50(11):889-97. [DOI:10.1111/j.1348-0421.2006.tb03865.x] [PMID]
Mun HS, Park JH, Kim H, Yu HK, Park YG, Cha CY, et al. Mycobacterium senuense sp. nov., a slowly growing, non-chromogenic species closely related to the Mycobacterium terrae complex. Int J Syst Evol Microbiol. 2008; 58(Pt 3):641-6. [DOI:10.1099/ijs.0.65374-0] [PMID]
Wang JY, Lin HC, Lin HA, Chung CH, Chen LC, Huang KY, et al. Associations between diabetes mellitus and nontuberculous mycobacterium-caused diseases in Taiwan: A nationwide cohort study. Am J Trop Med Hyg. 2021; 105(6):1672-19. [DOI:10.4269/ajtmh.20-1441][PMID]
Malekshahian D, Tabarsi P, Farnia P, Javanmard P, Seif S, Teymouri H. Mycobacterium simiae isolates subtypes and molecular drug susceptibility in Iran. Arch Clin Infect Dis. 2022; 17(3):e127866. [DOI:10.5812/archcid-127866]
Khammarnia M, Daghighi M, Peyvand M. Analysis of the epidemiological trend of tuberculosis in Sistan and Baluchestan province during 2015-2019. J Shahid Sadoughi Univ Med Sci. 2024, 31(11):7194-203. [DOI:10.18502/ssu.v31i11.14784] | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 354 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 471 |
||
