| تعداد نشریات | 285 |
| تعداد نشریات سازمان | 83 |
| تعداد شماره‌ها | 3,086 |
| تعداد مقالات | 34,441 |
| تعداد مشاهده مقاله | 48,886,462 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 79,339,197 |
Phylogenetic relationships within the Lythraceae in Iran | ||
| Rostaniha | ||
| دوره 26، شماره 1 - شماره پیاپی 72، دی 2025، صفحه 14-26 اصل مقاله (1.21 M) | ||
| نوع مقاله: Systematics and Biodiversity of Plants | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/bot.j.iran.2025.368269.1412 | ||
| نویسندگان | ||
| Rana Mahmoodi1؛ Marzieh Beygom Faghir* 2؛ Robabeh Shahi Shavvon* 3 | ||
| 1PhD in Plant Systematics, Department of Biology, Faculty of Science, University of Guilan, Rasht, 41938-33697, Iran | ||
| 2Associate Prof., Department of Biology, Faculty of Science, University of Guilan, Rasht, 41938-33697, Iran | ||
| 3Assistant Prof., Department of Biology, Faculty of Science, Yasouj University, Yasouj, 75918-74934, Iran | ||
| چکیده | ||
| The Lythraceae consists of a group of plants with a complex taxonomy. The difficulty of classifying them becomes particularly clear when morphological characteristics are used. In the Flora Iranica and the Flora of Iran, this family is represented by five and four genera, respectively. In the present study, three genera Lythrum, Ammannia, and Rotala, and six species of Lythraceae growing in Iran were analyzed, using nine cpDNA trnH-psbA and 21 nrDNA ITS sequences retrieved from GenBank. Phylogenetic relationships within the family were evaluated based on cpDNA trnH-psbA and nrDNA ITS, as well as combined datasets using maximum parsimony, maximum likelihood, and Bayesian inference methods. Most of the reconstructed trees revealed the monophyly of the above-mentioned genera in Iran. All trees confirmed the distinctiveness of species within these three genera. The results of this study indicate a phylogenetic alliance of L. thesioides with L. silenoides and the three species L. thymifolia, L. junceum and L. hyssopifolia. Moreover, A. coccinea is evolutionarily related to A. multiflora and A. baccifera to A. auriculata. The results indicate that, a taxonomic revision of these genera is required. In addition, the evolutionary patterns of some diagnostic morphological and micromorphological characters were evaluated in this study. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| Monophyly؛ morphological characteristics؛ phylogeny؛ sequence؛ taxonomy | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| روابط فیلوژنتیکی گل‌حنائیان در ایران | ||
| نویسندگان [English] | ||
| رعنا محمودی1؛ مرضیه بیگم فقیر2؛ ربابه شاهی شاوون3 | ||
| 1دکتری سیستماتیک گیاهی، گروه زیست‌شناسی، دانشکده علوم، دانشگاه گیلان، کد پستی 33697-41938، رشت، ایران | ||
| 2دانشیار گروه زیست‌شناسی دانشکده علوم، دانشگاه گیلان، کد پستی 33697-41938، رشت، ایران | ||
| 3استادیار گروه زیست‌شناسی، دانشکده علوم، دانشگاه یاسوج، کد پستی 75918-74934، یاسوج، ایران | ||
| چکیده [English] | ||
| گل‌حنائیان متشکل از گروهی از گیاهان، دارای رده‌بندی پیچیده‌ای است. دشواری در رده‌بندی آن‌ها به ویژه وقتی مشخص می‌شود که از صفات ریخت‌شناسی استفاده شود. در فلورا ایرانیکا و فلور ایران، به ترتیب پنج و چهار جنس از این تیره گزارش شده است. در مطالعه حاضر، سه جنس Lythrum ،Ammannia و Rotala و شش گونه از گل‌حنائیان در ایران، با استفاده از نُه توالی کلروپلاستی trnH-psbA و 21 توالی هسته‌ای ITS که از بانک ژن دریافت شد، مورد بررسی قرار گرفتند. روابط فیلوژنتیکی این تیره براساس داده‌های توالی‌های کلروپلاستی trnH-psbA، هسته‌ایITS و ترکیبی از این توالی‌ها با استفاده از روش‌های بیشینه صرفه‌جویی، بیشینه احتمال و بیزین مورد ارزیابی قرار گرفت. بیشتر درخت‌های بازسازی‌شده، تک‌تباری سه جنس مذکور را در ایران نشان دادند. همه درخت‌ها، متمایز بودن گونه‌ها در سه جنس مذکور را تایید کردند. یافته‌های این تحقیق بیانگر اتحاد فیلوژنتیکی L. thesioides با L. silenoides و سه گونه L. thymifolia ،L. junceum و L. hyssopifolia بود. به علاوه، از لحاظ تکاملی، A. coccinea با A. multiflora و A. baccifera با A. auriculata رابطه خویشاوندی نشان داد. نتایج حاصل، نیاز به بازنگری آرایه‌شناختی این جنس‌ها را آشکار ساخت. همچنین، در این بررسی، الگوهای تکاملی برخی صفات تشخیصی ریخت‌شناسی و ریزریخت‌شناسی مورد ارزیابی قرار گرفت. | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| آرایه‌شناسی, تبارزایی, تک‌نیایی, توالی, صفات ریخت‌شناسی | ||
| مراجع | ||
|
APG IV, 2016. An update of the angiosperm phylogeny group classification for the orders and families of flowering plants. Botanical Journal of the Linnean Society 181(1): 1–20. DOI: 10.1111/boj.12385. Conti, E., Litt, A., Wilson, P.G., Graham, S.A., Briggs, B.G., Johnson, L.A.S. & Sytsma, K.J. 1997. Interfamilial relationships in Myrtales: Molecular phylogeny and patterns of morphological evolution. Systematic Botany 22(4): 629. DOI: 10.2307/2419432. Cronquist, A. 1982. An integrated system of classification of flowering plants Vol. 34. New York, USA, Columbia University Press. DOI: 10.2307/2806386. Dahlgren, R. & Thorne, R.F. 1984. The order Myrtales: circumscription, variation, and relationships. Annals of the Missouri Botanical Garden 71(3): 633. DOI: 10.2307/2399158. Davis, P.H. 1988. Flora of Turkey and the East Aegean Islands Vol. 10. Edinburgh, Edinburgh University Press. Doyle, J.J. & Doyle, J.L. 1987. A rapid DNA isolation procedure for small quantities of fresh leaf tissue. Phytochemical Bulletin 19(1): 11–15. Felsenstein, J. 1985. Confidence limits on phylogenies: An approach using the bootstrap. Evolution 39(4): 783. DOI: 10.2307/2408678. Graham, S.A. 2007. Lythraceae, In: Flowering Plants Eudicots, The families and genera of vascular plants Vol. 9 (Kubitzki, K.; ed.). Berlin, Springer. Graham, S.A. & Cavalcanti, T.B. 2001. New Chromosome counts in the Lythraceae and a review of chromosome numbers in the family. Systematic Botany 26: 445–458. Graham, S.A. 1985. A revision of Ammannia (Lythraceae) in the Western Hemisphere. Journal of the Arnold Arboretum 66(4): 395–420. DOI: 10.5962/bhl.part.13185. Graham, S.A., Hall, J., Sytsma, K. & Shi, S. 2005. Phylogenetic analysis of the Lythraceae based on four gene regions and morphology. International Journal of Plant Sciences 166(6): 995–1017. DOI: 10.1086/432631. Gu, C., Ma, L., Wu, Z., Chen, K. & Wang, Y. 2019. Comparative analyses of chloroplast genomes from 22 Lythraceae species: inferences for phylogenetic relationships and genome evolution within Myrtales. BMC Plant Biology 19(1): 281. DOI: 10.1186/s12870-019-1870-3. Haining, H.N., Graham, S. & Gilbert, M.G. 2007. Lythraceae, In: Flora of China Vol. 13 (Wu, Z.Y.; ed.). Beijing, China, Science Publishers. Huang, Y. & Shi, S. 2002. Phylogenetics of Lythraceae sensu lato: A preliminary analysis based on chloroplast rbcL gene, psaA-ycf3 spacer and nuclear rDNA internal transcribed spacer (ITS). International Journal of Plant Sciences 163(2): 215–225. DOI: 10.1086/338392. Inglis, P.W., Cavalcanti, T.B., Facco, M.G., Bakker, F.T. & Graham, S.A. 2023. A comprehensive genus-level phylogeny and biogeographical history of the Lythraceae based on whole plastome sequences. Annals of Botany 132(2): 293–318. DOI: 10.1093/aob/mcad091. Johnson, L.A.S. & Briggs, B.G. 1984. Myrtales and Myrtaceae - A phylogenetic analysis. Annals of the Missouri Botanical Garden 71(3): 700. DOI: 10.2307/2399159. Johnson, P.N. & Brooke, P.A. 1989. Wetland plants in New Zealand. DSIR Publishing, Wellington. 319 pp. Koehne, E. 1903. Lythraceae, In: Das Pflanzenreich IV. 216 (Engler, A.; ed.). Leipzig: Verlag von Wilhelm Engelmann. Koehne, E. 1881. Lythraceae monographice describuntur. Botanische Jahrbucher fur Systematik, Pfl- anzengeschichte und Pfl anzengeographie 1: 142–157. Mahmoodi, R., Faghir, M.B. & Parsapanah, S. 2022a. Palynological study of the family Lythraceae J.St.-Hil. in Iran; with special emphasis on the genera Ammannia, Lythrum, and Rotala. Feddes Repertorium 133(4): 289–304. DOI: 10.1002/fedr.202100052. Mahmoodi, R., Faghir, M.B. & Shahi Shavvon, R. 2022b. Foliar micromorphology of the family Lythraceae in Iran with special emphasis on the genera Lythrum, Ammannia, and Rotala. Rostaniha 23(2): 161–179. Miller, M.A., Pfeiffer, W. & Schwartz, T. 2010. Creating the CIPRES Science Gateway for inference of large phylogenetic trees: 1–8. Morris, J.A. 2007. A molecular Phylogeny of Lythrum (Lythraceae): Preliminary analyses based on the atpB-rbcL Intergenic Spacer and ITS. PhD thesis, Biology Department, Kent State University, UK. Naqinezhad, A. & Naseri Larijani, N. 2017. Ammannia coccinea (Lythraceae), a new record for the Flora Iranica area. Phytologia Balcanica 23(1): 35–38. Page, D.M. 2001. TreeView (Win32). Retrieved from http://taxonomy.zoology.gla.ac.uk/rod. Polatschek, A. & Rechinger, K.H. 1968. Lythraceae, In: Flora Iranica Vol. 51 (Rechinger, K.H.; ed.). Akad." Druck-und Verlagsanstalt, Graz. POWO 2024. Plants of the World Online. Published on the Internet. http://www.plantsoftheworldonline.org. Rambaut, A., Suchard, M.A., Xie, D. & Drummond, A.J. 2014. Tracer v1.6. http://beast.bio.ed.ac.uk/Tracer. Sang, T., Crawford, D.J. & Stuessy, T.F. 1997. Chloroplast DNA phylogeny, reticulate evolution, and biogeography of Paeonia (Paeoniaceae). American Journal of Botany 84(8): 1120–1136. DOI: 10.2307/2446155. Shi, S., Huang, Y., Tan, F., He, X. & Boufford, D.E. 2000. Phylogenetic analysis of the Sonneratiaceae and its relationship to Lythraceae based on ITS sequences of nrDNA. Journal of Plant Research 113(3): 253–258. DOI: 10.1007/PL00013926. Swofford, D.L. 2002. PAUP*, Phylogenetic Analysis Using Parsimony, version 4.0b10. Sunderland: Sinauer Associates. Sytsma, K.J., Litt, A., Zjhra, M.L., Chris Pires, J., Nepokroeff, M., Conti, E., Walker, J. & Wilson, P.G. 2004. Clades, clocks, and continents: Historical and biogeographical analysis of Myrtaceae, Vochysiaceae, and relatives in the Southern hemisphere. International Journal of Plant Sciences 165 (S4): S85–S105. DOI: 10.1086/421066. Takhtajan, A. 1987. System of Magnoliophyta. Leningrad, Academy of Sciences USSR. Tate, J.A. & Simpson, B.B. 2003. Paraphyly of Tarasa (Malvaceae) and diverse origins of the polyploid species. Systematic Botany 28(4): 723–737. Webb, C.J., Sykes, W.R. & Garnock-Jones, P.J. 1988. Flora of New Zealand. Naturalised Pteridophytes, Gymnosperms, Dicotyledons Vol. 4. Botany Division DSIR, Christchurch. Webb, D.A. 1967. Lythraceae, Pp. 300–303. In: Flora Europaea Vol. 2. (Tutin, T.G.; ed.). Cambridge, Cambridge University Press. Yadav, S., Kumar, A., Dora, J. & Kumar, A. 2013. Essential perspectives of Lawsonia inermis. Journal of Pharmaceutical and Chemical Sciences 2(2): 888–896. Yousef-Naanaie, S. 2010. Lythraceae, In: Flora of Iran Vol. 67 (Assadi, M., Maassoumi, A.A., Babakhanlou, P. & Mozaffarian, V.; eds). Research Institute of Forests and Rangelands, Tehran (In Persian). Zhang, W. & Song, X. 2022. Occurrence of leaf spot caused by Neodeightonia phoenicum on Pygmy date palm (Phoenix roebelenii) in China. Plant Disease 106(8): 2269. DOI: 10.1094/PDIS-10-21-2190-PDN. | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 281 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 309 |
||