| تعداد نشریات | 285 |
| تعداد نشریات سازمان | 83 |
| تعداد شمارهها | 3,094 |
| تعداد مقالات | 34,537 |
| تعداد مشاهده مقاله | 49,387,708 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 79,837,746 |
شناسایی عوامل باکتریایی دخیل در ایجاد گال روی درختان آلو، گیلاس و سیب | ||
| آفات و بیماری های گیاهی | ||
| مقاله 4، دوره 90، شماره 2 - شماره پیاپی 115، 1401، صفحه 171-181 اصل مقاله (559.38 K) | ||
| نوع مقاله: بیماریشناسی گیاهی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/jaep.2023.359240.1446 | ||
| نویسندگان | ||
| کیوان فرّی1؛ مریم خضری* 2؛ مسعود ابرین بنا3؛ مینا راستگو4 | ||
| 1دانشآموخته کارشناسیارشد رشته بیماریشناسی گیاهی، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ارومیه، ارومیه، ایران. | ||
| 2استادیار موسسه تحقیقات گیاهپزشکی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، تهران، ایران. | ||
| 3دانشیار گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ارومیه، ارومیه، ایران. | ||
| 4استادیار بیماریشناسی گیاهی - ویروس شناسی گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ارومیه | ||
| چکیده | ||
| در سالهای 98-1397، با هدف ردیابی بیماری باکتریایی گال طوقه در استان آذربایجان غربی، از باغات آلو، گیلاس و سیب در شهرستانهای ارومیه، خوی، سلماس و نقده بازدید بهعمل آمد. در مجموع 32 جدایه ایجادکننده گال روی طوقه گیاه گوجهفرنگی، جهت بررسی سایر ویژگیها انتخاب شدند. سویههای بیماریزا گرم منفی، متحرک و هوازی بودند. برخی از ویژگیهای فنوتیپی با سویههای مولد گال گزارش شده از ایران در مطالعات قبلی تفاوت داشت که بیانگر ناهمگن بودن این سویهها در ایران است. شناسایی مولکولی سویهها بر اساس ژنهای virD2، ipt و virC و با استفاده از چهار جفت آغازگر اختصاصی انجام شد. نتایج این تحقیق نشان داد درختان میوه هستهدار و دانهدار مورد بررسی، توسط باکتری Agrobacterium tumefaciens آلوده شدهاند. هیچگونه تداخلی در عملکرد آغازگرهای ذکر شده در آزمون واکنش زنجیرهای پلیمراز چندگانه مشاهده نشد، بنابراین این روش شناسایی دقیق به جهت صرفهجویی در زمان و مصرف مواد مولکولی توصیه میشود. | ||
| کلیدواژهها | ||
| آذربایجان غربی؛ گال طوقه؛ Agrobacterium tumefaciens؛ virD2؛ ipt | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| Identification of bacterial agents involved in tumor formation on plum, sweet cherry and apple trees | ||
| نویسندگان [English] | ||
| Kayvan Farri1؛ Maryam Khezri2؛ Masoud Abrinbana3؛ Mina Rastgou4 | ||
| 1Former M.Sc. student of Plant Pathology, Department of Plant Protection, Faculty of Agriculture, Urmia University, Urmia, Iran. | ||
| 2Assistant professor, Iranian Research Institute of Plant Protection, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Tehran, Iran. | ||
| 3Associate professor, Department of Plant Protection, Faculty of Agriculture, Urmia University, Urmia, Iran. | ||
| 4Assistant professor, Department of Plant Protection, Faculty of Agriculture, Urmia University, Urmia, Iran. | ||
| چکیده [English] | ||
| During 2018 and 2019, a survey was carried out on the detection of bacterial crown gall disease on plum, sweet cherry During 2018 and 2019, a survey was carried out on detection of bacterial crown gall disease on plum, sweet cherry and apple trees in Urmia, Khoy, Salmas and Naghadeh in West Azarbaijan province. In total, 32 isolates causing gall on the crown of tomato seedlings were selected to identify further characteristics. Pathogenic strains were gram-negative, motile, and aerobic. In some of the phenotypic characteristics, differences were observed compared to the previous reports. These results indicate the existence of heterogeneity among Iranian strains. Molecular identification of strains was based on virD2, ipt, and virC genes using four specific primer pairs. The results of this research showed that the tested stone and pome fruit trees were infected with Agrobacterium tumefaciens No interference was observed in the function of the mentioned primers in the multiplex polymerase chain reaction. Thus, this accurate identification method is recommended by saving time and consumption of molecular materials. . | ||
| کلیدواژهها [English] | ||
| Agrobacterium tumefaciens, crown gall, virD2, ipt, West Azerbaijan | ||
| مراجع | ||
|
AYSAN, Y., F. SAHIN, M. MIRIK, M.F. DONMEZ, H. TEKMAN, 2003. First report of crown gall of apricot (Prunus armeniaca) caused by Agrobacterium tumefaciens in Turkey. Plant Pathology, 52: 793. https://doi.org/10.1111/j.1365-3059.2003.00902.x. BINI, F., K. GEIDER, C. BAZZI, 2008. Detection of Agrobacterium vitis by PCR using novel virD2 gene–specific primers that discriminate two subgroups. European Journal of Plant Pathology, 122: 403-411. https://doi.org/10.1007/s10658-008-9307-0. CHANDRASEKARAN, M., J.M. LEE, B.M. YE, S.M. JUNG, J. KIM, J.W. KIM, S.C. CHUN, 2019. Isolation and characterization of avirulent and virulent strains of Agrobacterium tumefaciens from rose crown gall in selected regions of South Korea. Plants (Basal), 8(11): 452. https://doi.org/10.3390/plants8110452. FAIST, H., A. KELLER, U. HENTSCHEL, R. DEEKEN, 2016. Grapevine (Vitis vinifera) crown galls host distinct microbiota. Applied and Environmental Microbiology, 82: 5542-5552. https://doi.org/10.1128/AEM.01131-16. FERDOUS, M.L., M.N. HOSSAIN, M.O. ALI, M.S. ISLAM, S. YASMIN, 2021. Morphological, biochemical and molecular identification of the wild strain of Agrobacterium tumefaciens from crown gall infected mango tree. Fundamental and Applied Agriculture, 6(1): 43-49. https://doi.org/10.5455/faa.136134. GANJEH, A., H. RAHIMIAN, V. BABAEIZAD, E. BASAVAND, 2020. Stem and crown gall disease caused by Agrobacterium tumefaciens on Golden Euonymus in Iran. Journal of Plant Pathology, 102: 1307. https://doi.org/10.1007/s42161-020-00593-4. HAAS, J.H., L.W. MOORE, W. REAM, S. MANULIS, 1995. Universal PCR primers for detection of phytopathogenic Agrobacterium strains. Applied and Environmental Microbiology, 61: 2879-2884. https://doi.org/10.1128/AEM.61.8.2879-2884.1995. KLEMENT, Z., K. RUDOLPH, D.C. SANDS, 1990. Methods in Phytobacteriology. Akademiai Kiado, Budapest, Hungry. 568 pp. https://doi.org/10.1002/jobm.3620310214. KUZMANOVIC, N., J. PULAWSKA, K. SMALLA, X. NESME, 2018. Agrobacterium rosae sp. nov., isolated from galls on different agricultural crops. Systematic and Applied Microbiology, 41: 191-197. https://doi.org/10.1016/j.syapm.2018.01.004. KWON, T. 2016. Mitochondrial porin isoform AtVDAC1 regulates the competence of Arabidopsis thaliana to Agrobacterium–mediated genetic transformation. Molecules and Cells, 39: 705-713. https://doi.org/10.14348/molcells.2016.0159. LI, X. S.H. DE BOER, 1995. Selection of primers for polymerase chain reaction primers from an RNA intergenic spacer region for specific detection Clavibacter michiganensis subsp. sepidonicus. Phytopathology, 85(8): 837-842. https://doi.org/10.1385/0-89603-244-2:31. MAFAKHERI, H., S.M. TAGHAVI, J. PULAWSKA, P. DE LAJUDIE, F. LASSALLE, E. OSDAGHI, 2019. Two novel genomospecies in the Agrobacterium tumefaciens species complex associated with rose crown gall. Phytopathology, 109: 1859-1868. https://doi.org/10.1094/PHYTO-05-19-0178-R. PULAWSKA, J., W. WARABIEDA, E. ISMAIL, 2016. Identification and characterization of bacteria isolated from crown galls on stone fruits in Poland. Plant Pathology, 65: 1034-1043. https://doi.org/10.1111/ppa.12482. ROUHRAZI, K.H., RAHIMIAN, 2013. Determination of Rhizobium species and heterogeneity of strains causing grapevine crown gall disease by IS50-PCR. Agricultural biotechnology Journal, 5(1): 39-56. (in Persian with English summary). https://doi.org/10.22103/JAB.2013.1188. ROUHRAZI, K. H. RAHIMIAN, 2014. Biochemical and genetic characterization of Agrobacterium tumefaciens the causal agent of walnut crown gall disease in Iran. Archives of Phytopathology and Plant Protection, 47 (20): 2493-2500, https://doi.org/10.1080/03235408.2014.880575. SAWADA, H., H. LEKI, I. MATSUDA, 1995. PCR detection of Ti and Ri plasmid from phytopathogenic Agrobacterium strains. Applied and Environmental Microbiology, 61: 828-831. SCHAAD, N.W., J.B. JONES, W. CHUN, 2001. Laboratory Guide for Identification of Plant Pathogenic Bacteria, 3rd ed., APS Press, St. Paul, MN, USA. 373 pp. https://doi.org/10.1046/j.1365-3059.2001.00635.x. SHAHABI MOHAMMAD ABADI, M., S.M. TAGHAVI, M. DJAVAHERI, 2012. Phenotypic and genotypic characteristics of Agrobacterium isolates from different hosts in Fars and Kohgiluye and Boyerahmad provinces. Iranian Journal of Plant Pathology, 48(3): 329-341. (in Persian with English summary). SINGH, N.K., C. LAVIRE, J. NESME, L. VIAL, X. NESME, C.E. MASON, F. LASSALLE, K. VENKATESWARAN, 2021. Comparative genomics of novel Agrobacterium G3 strains isolated from the international space station and description of Agrobacterium tomkonis sp. nov. Frontiers in Microbiology, 12: 765943. https://doi.org/10.3389/fmicb.2021.765943. VLADIMIROV, I.A., T.V. MATVEEVA, L.A. LUTOVA. 2015. Opine Biosynthesis and catabolism genes of Agrobacterium tumefaciens and Agrobacterium rhizogenes. Russian Journal of Genetics, 51: 121-129. http://doi.org/10.1134/ S1022795415020167. | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 671 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 668 |
||