اخبار و اعلانات

 آمار

تعداد نشریات282
تعداد نشریات سازمان80
تعداد شماره‌ها3,168
تعداد مقالات35,197
تعداد مشاهده مقاله50,932,205
تعداد دریافت فایل اصل مقاله90,937,603
Pirmoradi, S, Jolodar, A, Jafari, H. (1401). Genetic Diversity of Hottentotta sp. Scorpions (Scorpionidae: Buthidae) in Khuzestan, Iran. سامانه مدیریت نشریات علمی, 78(1), 15-24. doi: 10.22092/ari.2022.359194.2385
S Pirmoradi; A Jolodar; H Jafari. "Genetic Diversity of Hottentotta sp. Scorpions (Scorpionidae: Buthidae) in Khuzestan, Iran". سامانه مدیریت نشریات علمی, 78, 1, 1401, 15-24. doi: 10.22092/ari.2022.359194.2385
Pirmoradi, S, Jolodar, A, Jafari, H. (1401). 'Genetic Diversity of Hottentotta sp. Scorpions (Scorpionidae: Buthidae) in Khuzestan, Iran', سامانه مدیریت نشریات علمی, 78(1), pp. 15-24. doi: 10.22092/ari.2022.359194.2385
Pirmoradi, S, Jolodar, A, Jafari, H. Genetic Diversity of Hottentotta sp. Scorpions (Scorpionidae: Buthidae) in Khuzestan, Iran. سامانه مدیریت نشریات علمی, 1401; 78(1): 15-24. doi: 10.22092/ari.2022.359194.2385

Genetic Diversity of Hottentotta sp. Scorpions (Scorpionidae: Buthidae) in Khuzestan, Iran

Archives of Razi Institute
مقاله 5، دوره 78، شماره 1، فروردین و اردیبهشت 2023، صفحه 15-24    اصل مقاله (738.82 K)
نوع مقاله: Original Articles
شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/ari.2022.359194.2385
نویسندگان
S Pirmoradi1؛ A Jolodar* 2؛ H Jafari3
1Faculty of Veterinary Medicine at the Shahid Chamran University of Ahvaz, Ahvaz, Iran
2Department of Basic Sciences, Faculty of Veterinary Medicine, Shahid Chamran University of Ahvaz, Ahvaz, Iran
3Razi Vaccine and Serum Research Institute, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Ahvaz, Iran
چکیده
The genus of Hottentotta sp. scorpion is one of the few medically important scorpions in Iran. This study assessed the genetic relationship analysis of the cytochrome c oxidase subunit I (COXI) and 12sRNA genes and morphometric parameters among the population of Hottentotta sp in Khuzestan. Morphological analysis using the ANOVA T-test with a significance level of P-value less than 0.05 showed differences between the Hottetotta saulcyi and Hottetotta zagrosensis. However, this method was not able to distinguish between members of the same species. The amplification of gene fragments was done on 12srRNA (374 bp), and cytochrome c oxidase subunit I (COXI) (624 bp) from Hottentotta sp. collected from Khuzestan by PCR. Based on sequence 12srRNA, all H. saulcyi specimens (HS4, HS6 and HS7) except HS5 were included in cluster B. While two specimens of H. Zagrosensis (HZ6 and HZ1) with 99% bootstrap value were placed in cluster A. By using 12srRNA sequences, the highest genetic distance between the Khuzestan specimens was related to HS5 and HS7, which was calculated to be 16.7%. However, the amount of amino acid difference between HS5 and HS7 using the COXI sequence was 9.2%. The genetic distances of HS7 and HS5 with the only scorpion reference sequence, H. saulcyi, were 11.8% and 9.2%, respectively. Morphological data showed the separation of the two species, consistent with molecular phylogenetic trees. On the other hand, the genetic distance of specimens HS7 and HS5 with other members of the group as well as the scorpion reference sequence using the COXI gene, confirmed the possibility of an intraspecies difference that could not be proved by the morphological data alone.
کلیدواژه‌ها
Scorpion؛ phylogenetic analysis؛ 12srRNA؛ cytochrome oxidase c subunit 1؛ Hottentotta sp
عنوان مقاله [English]
تنوع ژنتیکی عقرب های هوتنتوتا (Scorpionidae: Buthidae) در خوزستان، ایران
چکیده [English]
جنس عقرب هوتنتوتا یکی از معدود عقرب های مهم پزشکی ایران است. تجزیه و تحلیل مورفولوژیک با استفاده از آزمون تی تست ANNOVA با سطح معنی داری با ارزش P کمتر از 0.05 تفاوت بین هوتنتوتا سلسئی و هوتنتوتا زاگروسنسیس را نشان داد. با این حال، این روش قادر به تشخیص تفاوت بین اعضای یک گونه نبود. قطعات ژنی 12srRNA (374 جفت باز) و سیتوکروم c اکسیداز زیرواحد1 (624 جفت باز) از عقرب های هوتنتوتا جمع آوری شده از خوزستان با روش PCR تکثیر گردیدند. بر اساس توالی 12srRNA، تمام نمونه های هوتنتوتا سلسئی HS4)، HS6 و HS7) به جز HS5 در خوشه B قرار گرفتند، در حالیکه دو نمونه هوتنتوتا زاگروسنسیس (HZ6 و HZ1) با مقدار بوت استرپ 99 درصد در خوشه A جا شدند. با استفاده از توالی‌های 12srRNA، بیشترین فاصله ژنتیکی بین نمونه‌های خوزستان مربوط به نمونه های HS5 و HS7 بود که این میزان 7/16 درصد محاسبه گردید. با این حال، میزان تفاوت اسید آمینه ای این دو نمونه با استفاده از توالی COXI 9.2٪ بود. فاصله ژنتیکی HS7 و HS5 با تنها توالی مرجع عقرب هوتنتوتا سلسئی به ترتیب 8/11 و 2/9 درصد بود. داده های ریخت شناسی جدایی دو گونه را نشان داد که این حالت با درخت فیلوژنی مولکولی مطابقت داشت. از سوی دیگر، فاصله ژنتیکی نمونه‌های HS7 و HS5 با سایر اعضای گروه و همچنین با توالی عقرب مرجع که با استفاده از ژن COXI انجام شده بود، احتمال وجود تفاوت درون گونه‌ای را تایید کرد که این تفاوت تنها با داده‌های مورفولوژیکی قابل اثبات نبود.
کلیدواژه‌ها [English]
عقرب, آنالیز فیلوژنتیک, میتوکوندری, سیتوکروم اکسیداز ساب یونیت 1, هوتنتوتا
سایر فایل های مرتبط با مقاله
مراجع
  1. Fet V, Sissom WD, Lowe G, Braunwalder ME. Catalog of the scorpions of the world (1758-1998). New York: New York Entomological Society; 2000.
  2. Fet V, Lowe G. Family Buthidae. In: Fet V, Sissom W, Lowe G, Braunwalder M, editors. Catalog of the Scorpions of the World (1758-1998). New York: New York Entomological Society; 2000. p. 54-286.
  3. Gantenbein B, Largiader CR. The phylogeographic importance of the Strait of Gibraltar as a gene flow barrier in terrestrial arthropods: a case study with the scorpion Buthus occitanus as model organism. Mol Phylogenet Evol. 2003;28(1):119-30.
  4. Mirshamsi O, Sari A, Elahi E, Hosseinie S. Phylogenetic relationships of Mesobuthus eupeus (C.L. Koch, 1839) inferred from COI sequences (Scorpiones: Buthidae). J Nat Hist. 2010;44(47-48):2851-72.
  5. Fet V. Fauna and Zoogeography of Scorpions (Arachnida: Scorpions) in Turkmenistan. In: Fet V, Atamuradov KI, editors. Biogeography and Ecology of Turkmenistan. Dordrecht: Springer Netherlands; 1994. p. 525-34.
  6. Dehghani R, Haghi FM, Mogaddam MY, Sedaghat M, Hajati H. Review study of scorpion classification in Iran. J Entomol Zool Stud. 2016;4(5):440-4.
  7. Navidpour S. An annotated checklist of scorpions in south and southwestern parts of Iran. Int J Fauna Biol Stud. 2015;2(3):9-15.
  8. Fet V, Gantenbein B, Gromov AV, Lowe G, Lourenço WR. The first molecular phylogeny of Buthidae (Scorpiones). Euscorpius. 2003;2003(4):1-10.
  9. Kassiri H, Dehghani R, Kaviani M, Dehghani M, Kasiri M. First report of Hottentotta schach (Arachnida: Scorpionida: Buthidae) as a new record from Isfahan Province, Central Iran. J Entomol Res. 2020;44(1):153-6.
  10. Sousa P, Froufe E, Harris DJ, Alves PC, Meijden Avd. Genetic Diversity of Maghrebian Hottentotta (Scorpiones: Buthidae) Scorpions Based on CO1: New Insights on the Genus Phylogeny and Distribution. Afr Invertebr. 2011;52(1):135-43.
  11. Jafari H, Saalabi F, Jelodar A, Navidpour S, Jahanifard E, Forouzan A, et al. Phylogenetic study on Orthochirus iranus by using morphological and molecular methods (Scorpiones: Buthidae). J Entomol Zool Stud. 2018;6:304-9.
  12. Nikkhah N, Jolodar A, Taghavi Moghadam A. Phylogenetic analysis of cytochrome oxidase subunit 1 from the Mesobuthus eupeus (Scorpions: Buthidae) of Khuzestan province. Iran Vet J. 2018;14(3):102-11.
  13. Jolodar A. Molecular characterization and phylogeny analysis based on sequences of cytochrome oxidase gene from Hemiscorpius lepturus of Iran. Iran J Vet Med. 2019;13(1):59-67.
  14. Azghadi S, Mirshamsi O, Navidpour S, Aliabadian M. Scorpions of the genus Odontobuthus Vachon, 1950 (Scorpiones: Buthidae) from Iran: Phylogenetic relationships inferred from mitochondrial DNA sequence data. Zoology in the Middle East. 2014;60(2):169-79.
  15. Polis G, Stanford E. The Biology of Scorpion. Stanford, California: Stanford University Press; 1990.
  16. Vachon M. Etude des caraeteres utilises pour classer les families et les genres de Scorpions (Arachnides). 1. La trichobothriotaxie en arachnologie. Sigles trichobothriaux et types de trichobothriotaxie chez les Scorpions. Bull Mus Natl Hist Nat, Paris. 1974;140:857-958.
  1. White TJ, Bruns T, Lee S, Taylor J. 38 - amplification and direct sequencing of fungal ribosomal rna genes for phylogenetics. In: Innis MA, Gelfand DH, Sninsky JJ, White TJ, editors. PCR Protocols. San Diego: Academic Press; 1990. p. 315-22.
  2. Folmer O, Black M, Hoeh W, Lutz R, Vrijenhoek R. DNA primers for amplification of mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I from diverse metazoan invertebrates. Mol Mar Biol Biotechnol. 1994;3(5):294-9.
  3. Altschul SF, Gish W, Miller W, Myers EW, Lipman DJ. Basic local alignment search tool. J Mol Biol. 1990;215(3):403-10.
  4. Quijano-Ravell AF, de Armas LF, Francke OF, Ponce-Saavedra J. A new species of the genus Centruroides Marx (Scorpiones, Buthidae) from western Michoacan State, Mexico using molecular and morphological evidence. Zookeys. 2019;859:31-48.
  5. Melnick DJ, Hoelzer GA. What is mtDNA good for in the study of primate evolution? Evol Anthropol. 1993;2(1):2-10.
  6. Huang X, Miller W. A time-efficient, linear-space local similarity algorithm. Advances in Applied Mathematics. 1991;12(3):337-57.
آمار
تعداد مشاهده مقاله: 2,822
تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 7,185


counter
سامانه مدیریت نشریات علمی. طراحی و پیاده سازی از سیناوب