| تعداد نشریات | 285 |
| تعداد نشریات سازمان | 83 |
| تعداد شمارهها | 3,094 |
| تعداد مقالات | 34,533 |
| تعداد مشاهده مقاله | 49,381,089 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 79,831,839 |
بارکدگذاری DNA برخی از گیاهان دارویی در شرق استان گلستان | ||
| تحقیقات گیاهان دارویی و معطر ایران | ||
| مقاله 10، دوره 37، شماره 5 - شماره پیاپی 109، آذر و دی 1400، صفحه 838-849 اصل مقاله (1012.36 K) | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/ijmapr.2021.355498.3040 | ||
| نویسندگان | ||
| راضیه سعادتی* 1؛ علی ستاریان2؛ ابوالفضل دانشور3؛ الهام امینی4؛ فاطمه نصرالهی5 | ||
| 1دانشآموخته کارشناسی ارشد، دانشکده علوم پایه، دانشگاه گنبدکاووس، گنبد کاووس، ایران | ||
| 2دانشیار، گروه زیستشناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه گنبدکاووس، گنبد کاووس، ایران | ||
| 3استادیار، گروه زیستشناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه گنبدکاووس، گنبد کاووس، ایران | ||
| 4دانشآموخته دکتری، دانشکده علوم پایه، دانشگاه گنبدکاووس، گنبد کاووس، ایران | ||
| 5دانشآموخته دکتری، گروه زیستشناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه قم، قم، ایران | ||
| چکیده | ||
| روش بارکدگذاری DNA ابزاری مفید برای شناسایی گونههای گیاهی و جانوری است. بارکدگذاری DNA روش شناسایی گونهها با استفاده از یک توالی کوتاه و استاندارد، از ژنوم است. در این تحقیق، از این روش بهمنظور شناسایی چهار گونه گیاهی از شرق استان گلستان شامل همیشهبهار (Calendula persica C.A.Mey.)، خارمریم (Silybum marianum L.)، مرزه جنگلی (Satureja mutica Fisch.) و پنیرک معمولی (Malva neglecta Wallr.) استفاده شد. استخراج DNA به روش CTAB انجام و PCR با آغازگرهای طراحی شده براساس بارکدهای کلروپلاستی rbcL و trnH-psbA و بارکد هستهای ITS انجام شد. توالیهای حاصل، با اطلاعات موجود در پایگاه اطلاعات NCBI تطبیق داده شد. نتایج نشان داد که هر سه بارکد بهدلیل قدرت تفکیک بالا، تعداد SNP پایین و جامعیت در اکثر گونهها، بارکدهای بسیار مناسبی برای نمونههای مورد بررسی میباشند. همچنین، مقایسهی بارکدهای گونههای جمعآوری شده از مراتع و عطاریها نشان داد که برخی گونههای گیاهی که در عطاریها عرضه میشوند، با گیاهی که مردم بومی از آن بهعنوان دارو استفاده میکنند، متفاوت هستند. میتوان گفت امکان اشتباه در ارائه گیاهان دارویی در عطاریها غیر قابل انکار است. بنابراین بررسی سایر گونههای گیاهی موجود در عطاریها به روش بارکدگذاری DNA بهعنوان امری ضروری پیشنهاد میشود. | ||
| کلیدواژهها | ||
| بارکد هستهای ITS؛ بارکد کلروپلاستی rbcL؛ بارکد کلروپلاستی trnH-psbA؛ گیاهان دارویی | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| DNA barcoding of some medicinal plants in eastern Golestan province | ||
| نویسندگان [English] | ||
| R. Saadati1؛ A. Sattarian2؛ A. Daneshvar3؛ E. Amini4؛ F. Nasrollahi5 | ||
| 1M.Sc. Graduated, Department of Biology, Faculty of Sciences, Gonbad Kavous University, Gonbad, Iran | ||
| 2Department of Biology, Faculty of Sciences, Gonbad Kavous University, Gonbad, Iran | ||
| 3Department of Biology, Faculty of Sciences, Gonbad Kavous University, Gonbad, Iran | ||
| 4Ph.D. graduated, Department of Biology, Faculty of Sciences, Gonbad Kavous University, Gonbad, Iran | ||
| 5Ph.D. graduated, Department of Biology, Faculty of Sciences, University of Qom, Qom, Iran | ||
| چکیده [English] | ||
| DNA barcoding technique is a useful tool for the identification of plant and animal species using a short and standard sequence of the genome. In the present study, this method was used to identify four plant species including Calendula persica C.A.Mey., Silybum marianum (L.) Gaertn., Satureja mutica Fisch. & C.A.Mey., and Malva neglecta Wallr. from the eastern Golestan province. The DNA was extracted by CTAB method and the PCR was performed with the primers designed based on the rbcL and trnH-psbA chloroplast barcodes and ITS nuclear barcode. The results of sequences were matched with the information in the NCBI database. The results showed that the all three barcodes were suitable for the samples studied due to their high resolution, low SNP number, and comprehensiveness in most species. Also, the barcodes comparison of the species collected from the rangelands and perfumeries showd that some plant species that are offered in the perfumeries are different from the plants that the natives use as medicine. It could be mentioned that the mistakes possibility in the medicinal plants offered in the perfumeries is undeniable. Therefore, the study on the other plant species in the perfumeries by the DNA barcoding method could be recommended as a necessity. | ||
| کلیدواژهها [English] | ||
| ITS nuclear barcode, rbcl chloroplast barcode, trnH-psbA chloroplast barcode, medicinal plants | ||
| مراجع | ||
|
- Abedi, M., Panahi, J., Sattarian, A. and Habibi, M., 2016. Ethnobotanical study of medicinal plants of gheregh ghoinik in jargalan of north Khorasan province. The First National Conference of Aromatic and Medicinal Herbs, Gonbad Kavous University, 20 April. - Aghuiy, S., 2018. Anthropology and anthropology of medicinal plants in the deserts of Turkmen Sahara (Case study: Kurdish pastures, Dashliberun, Incheh Barun). Master Thesis, Faculty of Agriculture and Natural Resources, Gonbad Kavous University, 72p. - Asadi, F., Dezhsetan, S., Ghahramanzadeh, R., Razmjou, J. and Alebrahim, M.T., 2015. DNA barcoding of some local medicinal plants of Ardabil province. Crop Biotechnology, 5(10): 31-40. - Chen, S., Yao, H., Han, J., Liu, C., Song, J., Shi, L., Zhu, Y., Ma, X., Gao, T., Pang, X., Luo, K., Li, K., Jia, X., Lin, Y. and Leon, Ch., 2010. Validation of the ITS2 region as a novel DNA barcode for identifying medicinal plant species. PloS One, 5: e8613. - Darvizheh, H., Zahedi, M., Abaszadeh, B. and Dudmani, A., 2016. Importance of cultivation and production of Medicinal Plants in the Iran Economy and Industry with a case Study of the E.purpurea.L. The First National Conference of Aromatic and Medicinal Herbs, Gonbad Kavous University, 20 April. - Doyle, J.J. and Doyle, J.L., 1987. A rapid DNA isolation procedure for small quantities of fresh leaf tissue. Phytochemical Bulletin, 19: 11-15. - Ghahramanzadeh, R., Marashi, H., Van de Weil, K., Malekzadeh, S., Shahriari, F. and Asmaldrz, R., 2012. The use of DNA barcoding to separation invasive species of aquatic weeds Myriophyllum spp. Noninvasive from relatives. 12th Congress of Iranian Genetics Society, Tehran, 21 May: 101. - Ghorbani Marghashi, M., Bagheri, H. and Gholami, M., 2019. Identification of some Iranian cardamine species using the ITS molecular marker. Journal of Plant Research (Iranian Journal of Biology). 32(1): 183-193. - Guo, X., Wang, X., Su., W., Zhang, G. and Zhou, R., 2011. DNA barcodes for discriminating the medicinal plant Scutellaria baicalensis (Lamiaceae) and its adulterants. Biological and Pharmaceutical Bulletin, 34(8): 1198-1203. - Heubl, G., 2010. New aspects of DNA-based authentication of Chinese medicinal plants by molecular biological techniques. Planta Medica, 76(7): 1963-1974. - Hoseini, S.A.R., Abrasji, G.H. and Hoseini, S.A.H., 2008. Medicinal Plants of Golestan province. Iranian Journal of Medicinal and Aromatic Plants, 24(4): 472-498. - Hollingsworth, P.M., Graham, S.W. and Little, D.P., 2011. Choosing and using plant DNA barcode. PloS One, 6(5): 19254. - Kress, W.J., Liu, Z., Newman, M. and Li, Q.J., 2005. The molecular phylogeny of Alpinia (Zingiberaceae): a complex and polyphyletic genus of gingers. American Journal of Botany, 92: 167-178. - Kress, W.J. and Erickson, D.L., 2007. A two-locus global DNA barcode for land plants: The coding rbcLgene complements the noncoding trnH-psbA spacer region. PloS One, 2: e508. - Mahadani, P. and Ghosh, S., 2013. DNA Barcoding: A tool for species identification from herbal juices. DNA Barcode and Genomics Laboratory, 2013: 35-38. - Mirdeilami, S.Z., Heshmati, G.H. and Barani, H., 2015. Ethnobotanical and ethnoecological survey on medicinal species (case study Kechik rangelands in the Northeast Golestan province). Journal of Indigenous Knowledge, 1(2): 129-154. - Mohebi anabat, M., Riahi, H., Sheidai and M. and Koohdar, F., 2020. Population genetic study and barcoding in Iran saffron (Crocus sativus L.). Industrial Crops and Products, 143 :111915. - Naeem, A., Khan, A.A., Cheema, H.M.N., Khan, I.A. and Buerkert, A., 2014. DNA barcoding for species identification in the Palmae family. Genetics and Molecular Research, 13(4): 10341-10348. - Rahim-Malik, M., 2011. Study and comparison of different methods of DNA extraction medicinal plants and aromatic. Journal of Medical Herbs, 2(1): 1-5. - Sheidai, M., Tabaripour, R., Talebi, S.M., Noormohammadi, Z. and Koohdar, F., 2019. Adulteration in medicinally important plant species of Ziziphora in Iran market: DNA barcoding approach. Industrial Crops and Products, 130: - Tabaripour, R., Sheidai, M., Talebi, S.M. and Noormohammadi, Z., 2021. Molecular and morphological investigation in Hymenocrater: species delimitation, relationship, divergence time and DNA barcoding. Genetic Resources and Crop Evolution, 68: 2003-2017. - Tamura, K., Peterson, D., Peterson, N., Stecher, G., Nei, M. and Kumar, S., 2011. MEGA5: Molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods. Molecular Biology and Evolution, 28: 2731-2739. - Techen, N., Parveen, I., Pan, Z. and Khan, I.A., 2014. DNA barcoding of medicinal plant material for identification. Current Opinion in Biotechnology, 25: 103-110. - Vanisree, M., Lee, C.Y., Lo, S.F., Nalawade, S.M., Lin, C.Y. and Tsay, H.S., 2004. Studies on the production of some important secondary metabolites from medicinal plants by plant tissue cultures. Botanical Bulletin-Academia Sinica Taipei, 45: 1-22. | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 1,609 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 636 |
||