| تعداد نشریات | 286 |
| تعداد نشریات سازمان | 84 |
| تعداد شماره‌ها | 3,005 |
| تعداد مقالات | 33,631 |
| تعداد مشاهده مقاله | 44,479,693 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 30,130,544 |
واگرایی ژنتیکی دو جمعیت نژاد بز گوشتی و شیرده: بر پایه تحقیقات چند شکلیهای نوکلئوتیدی موجود در ژن‌های کاندیدا | ||
| علوم دامی | ||
| دوره 33، شماره 128، آذر 1399، صفحه 69-82 اصل مقاله (1.62 M) | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/asj.2019.125931.1904 | ||
| نویسندگان | ||
| آرش جوانمرد1؛ نادر اسدزاده* 2؛ رضا توحیدی3؛ رضا مسعودی2 | ||
| 1گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز، تبریز. | ||
| 2عضو هیئت علمی موسسه تحقیقات علوم دامی کشور، سازمان تحقیقات، اموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران. | ||
| 3دانشکده کشاورزی و دامپروری تربت جام، مجتمع آموزش عالی و کشاورزی تربت جام، تربت جام. | ||
| چکیده | ||
| واگرایی ژنتیکی، فرآیندی است که در طی آن، دو یا چند جمعیت از یک گونه با جد مشترک، در طول زمان از طریق سازکارهای تکاملی، همچون جدایی جغرافیایی، نوترکیبی مولکولی و جهش‌های مستقل، آلل‌های با فراوانی غیر‌مشابه در سطح ژنومشان، فاصله ژنتیکی پیدا می‌کنند. این پدیده را می‌توان، اساس بوجود آمدن دو نژاد متفاوت از لحاظ، تیپ تولیدی در یک گونه دانست. در این راستا، هدف پژوهش حاضر، بررسی مقایسه‌ای چند شکلیهای موجود در شش ژن کاندیدا برای تولید، در دو نژاد شاخص بز تیپ گوشتی و شیرده می‌باشد. بدین‌منظور، مجموعاً، تعداد 30 عدد از هر نژاد بز شیری سانن و گوشتی بوئر، برای شناسایی چند شکلی ها در ناحیه‌ای از شش ژن کالپاستاتین، میوستاتین، هورمون شبه انسولین، لپتین، فاکتور نسخه پرداری اختصاصی هیپوفیزی و SCD با استفاده از تکنیک PCR-RFLP تعیین ژنوتیپ شدند. سپس، پارامترهای ژنتیکی مولکولی، با استفاده از نرم‌افزار POPGENE بین دو جمعیت محاسبه گردید. از آزمون‌کای‌اسکور، بر طبق جدول توافقی، برای آزمون معنی‌داری تفاوت‌های شاخص‌های مولکولی بین دو جمعیت استفاده شد. ضمنا، فراوانی آلل‌های مطلوب مرتبط با تولید در هر دو گروه تعیین گردید. نتایج مطالعه حاضر، نشان داد که ژنوم دو جمعیت مورد مطالعه در پروفایل آلل‌های شناسایی شده در بیشتر موارد تفاوت معنی‌داری دارد(p <0.01). چنین مطالعات واگرایی ژن در خصوص ژن‌های بزرگ اثرمرتبط با صفات تولیدی شاید بتواند، بینش اصلاح‌گران را برای درک بیشتر و پرده‌برداری از سیمای توارث جهش‌ها و نقش آنها در واریانس فنوتیپی مشاهده شده در صفات اقتصادی را بالا ببرد. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| واگرایی ژنتیکی؛ بز نژاد سانن و بوئر؛ ژن کاندیدا؛ جهش مسبب | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| Exploring genetic divergence between two superior meat and diary type goat population: A candidate gene polymorphism based evidence | ||
| نویسندگان [English] | ||
| arash javanmard1؛ nader asadzadeh2؛ reza tohidi3؛ Reza Masoudi2 | ||
| 1Assistant Professor Animal Genetics and Breeding Department of Animal Science, Faculty of Agriculture, University of Tabriz, | ||
| 2scientific board member of animal science research institute of IRAN, Agricultural Research Education and Extension Organization (AREEO) Iran. | ||
| 3Assistant Professor Torbat-e-Jam School of Agriculture and Animal Husbandry, | ||
| چکیده [English] | ||
| The genetic divergence could define as a mechanism which two or more breeds within the same species with a common ancestor could differently evolutionary separated in genome structure. Molecular genetics may provide proper tools for estimation of the level of diversity and mutational events on this breed over time. Accordingly, the main objective of the present report was to evaluate and compare the candidate gene polymorphisms for two meat and dairy type of goat breeds using candidate gene polymorphism approach. For this purpose, in overall, 30 goat individuals for two meat and dairy goat breed were chosen for genotyping of six candidate genes (Calpastatin, Myostatin, Insulin growth like hormone, Leptin, Pituitary-specific transcription factor and SCD genes using PCR-RFLP techniques. Molecular descriptive Statistics such as genotype and allele frequencies observed and expected heterozygosity, Minor allele frequency ,and Hardy-Weinberg Equilibrium was calculated and compared using POPGENE software between populations. The Chi-square test was used for significant differences between the two populations for screened genes. The observed results interesting showed significant genotype and allele frequency pattern between the two studied breeds. Obtained outputs may insight to the understanding of Genetic divergence between well-known breeds due to domestication and artificial selection as well as geographical | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| Genetic divergence, candidate gene, goat, casual mutation | ||
| مراجع | ||
|
Buchanan, F. C and Van Kessel, A. G. (2003). Hot Topic: An Association between a Leptin Single Nucleotide Polymorphism and Milk and Protein Yield. J. Dairy Sci. 86(10): 3164-3166. Buchanan, F. C., Fitzsimmons, C. J., Van Kessel, A.G., Thue, T. D., Winkelman-Sim, D.C and Schmutz. S. M. (2002). Association of a Missense Mutation in the Bovine Leptin Gene with Carcass Fat Content and Leptin mRNA Levels. Genetic. Selec. Evol. 34(1): 105-116. Cano, E. M., Marrube, G. et al. (2007). QTL affecting fleece traits in Angora goats. Small Rumin. Res.71 (1-3): 158. Casey N. H. and Van Niekerk. W. A. (1988). the Boer Goat (I). Origin, Adaptability, Performance Testing, Reproduction and Milk Production. Small Rumin. Res. 1:291-302. Chung, E. R., Shin, S. C., Shin, K. H and Chun, K. Y. (2008). SNP Discovery in the Leptin Promoter Gene and Association with Meat Quality and Carcass Traits in Korean Cattle. Asian-Aust. J. Anim. Sci. 21: 1689-1695. Chung, H. Y., Davis, M. E and Hines, H. C. (2001). Genetic Variants Detected by PCR–RFLP in Intron 6 of the Bovine Calpastatin Gene. Anim. Genet. 32(1): 53-53. Di Stasio, L. A. R. (2005). A PCR-RFLP Method for Genotyping the Myostatin Locus in Piemontese Cattle. Anim Genet. 36(6): 521-521. Fontanesi L, Tazzoli M., Scotti, E and Russo V. (2008). Analysis Of Candidate Genes for Meat Production Traits in Domestics Rabbit Breeds. 9th World Rabbit Congress – June 10-13, 2008 – Verona – Italy. Haegeman A., Van Zeveren A and Peelman L. J. (1999). A New Mutation in the Bovine Insulin like Growth Factor Binding Protein-3. Anim. Genet., 30: 382. Hossner, K. L., Mccusker R. H and Dodson, M. V. (1997). Insulin-Like Growth Factors and their Binding Proteins in Domestic Animals. Anim. Sci., 64: 1–15. Kapelański W., Grajewska, S.,Kurył, J., Bocian, M., Jankowiak, H and Wiśniewska, J. (2004). Calpastatin (CAST) Gene Polymorphism and Selected Meat Quality Traits in Pigs. Animal Science Paper Report 22(4), 435-441. Kury J., Kapelański, W., Pierzchała, M.,Grajewska, S and Bocian, M. (2003). Preliminary Observations on the Effect of Calpastatin Gene (CAST) Polymorphism on Carcass traits in Pigs. Animal Science Paper Report 21(2), 87-95. Lagonigro, R., Wiener, P., Pilla, F., Woolliams, J. A and Martin, J. L. (2003). A New Mutation in the Coding Region of the Bovine Leptin Gene Associated with Feed Intake. Anim. Genet.34:371-374. Lan, X. Y. , Pan, C. Y., Chen, H., Zhao, M., Li, J. Y., Yu, J., Zhang, C. L., Lei, C. Z., Hua, L. S and Yang, X. B. (2007). The novel SNPs of the IGFBP3 Gene and their Associations with Litter Size and Weight Traits in Goat (Brief report) .Arch. Tierz. 50, 223-224.Lan, X. Y., Pan, C. Y and et al. (2007). An AluI PCR-RFLP Detecting a Silent Allele at the Goat POU1F1 locus and its Association with Production Traits. Small Rumin. Res. 73(1-3): 8-15. Lan, X. Y., Pan, C. Y and et al. (2007). The HaeIII and XspI PCR-RFLPs Detecting Polymorphisms at the Goat IGFBP-3 Locus. Small Rumin. Res. (1-3): 283-288. Liefers, S.C., Veerkamp, R. F and Vander lene T. (2002) Association Between Leptin gene Polymorphism and Production, Live Weight Energy Balance, Feed intake and Fertility in Holstein Heifers. J. Dairy Sci. 85: 1633-1638. Lin, C., Lin, S.C., Chang, C. P and Rosenfeld, M. G. (1992). Pit-1-dependent Releasing Factor Mediates Pituitary Cell Growth. Nature, 360:765-768. Lusk, J. L. (2007). Association of Single Nucleotide Polymorphisms in the Leptin Gene with Body Weight and Backfat Growth Curve Parameters for Beef Cattle. J. Anim Sci. 85(8): 1865-1872. Maciulla ,J.H., Zhang, H.M and DeNise, S.K. (1997) A Novel Polymorphism in the Bovine Insulin-Like Growth Factor Binding Protein-3 (IGFBP-3) gene. Anim. Genet., 28, 375. Parmentier, I., Portelle, D., Gengler, N., Prandai, A., Bertozzi, C., Vleurick, L., Gilson, R and Riller, R. (1999). Candidate Gene Markers Associated with Somatotropic axis and Milk Selection. Dom. Anim. Endo, 17:139-148. Murachi, T. (1983). Calpain and calpastatin. Trends Biochem. Sci. 8, 167-169. Rothschild, M,F and Soller, M. (1997). Candidate Gene Analysis to Detect Traits of Economic Importance in Domestic Livestock. Probe, 8, 13–22. Sahlu, T and Goetsch, A. L. (2005). A foresight on goat research. Small Rumin. Res 60(1-2): 7. Schenkel, F,s., Miller, Sp., Jiang, Z., Mandell,Bi., Ye, X., Li, H and Wilton ,Wj. (2006). Association of a Single Nucleotide Polymorphism in the Calpastatin Gene with Carcass and Meat Quality Traits of Beef cattle. J. Anim. Sc. 84:291–299. Shrestha, J. N. B and Fahmy, M. H. (2005). Breeding goats for meat production: A Review: 1. Genetic Resources, Management and Breed Evaluation. Small Rumin. Res 58(2): 93. Takano, J., Watanabe, M and et al. (2000). Four Types of Calpastatin Isoforms with Distinct Amino-Terminal Sequences Are Specified by Alternative First Exons and Differentially Expressed in Mouse Tissues. J Biochem 128(1): 83-92. Van Niekerk, W.A and Casey, N. H. (1988). Growth, Nutrient Requirements, Carcass and Meat Quality. Small Ruminant Res. 1: pp. 355–368. Yahyaoui, M. H. (2003). Mapping of the Goat Stearoyl Coenzyme A Desaturase Gene to Chromosome 26. Anim. Genet. 34(6): 474-475. Yeh FC, Yang RC, Boyle T (1997) POPGENE version 1.31, the user-friendly shareware for population genetic analysis. Molecular Biology and Biotechnology Center, University of Alberta, Edmonton, Canada. Zhou, H., Hickford, J. G. H and et al. (2007). Polymorphism of the Ovine Calpastatin Gene. Molecular and Cellular Probes 21(3): 242. | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 641 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 315 |
||