اخبار و اعلانات

 آمار

تعداد نشریات282
تعداد نشریات سازمان80
تعداد شماره‌ها3,251
تعداد مقالات35,917
تعداد مشاهده مقاله54,574,486
تعداد دریافت فایل اصل مقاله93,695,730
Hanifi, Gh. R, Samadi Kafil, H, Tayebi Khosroshahi, H, Shapouri, R., Asgharzadeh, M. (1400). Bifidobacteriaceae Family Diversity in Gut Microbiota of Patients with Renal Failure. سامانه مدیریت نشریات علمی, 76(3), 521-528. doi: 10.22092/ari.2020.352271.1557
Gh. R Hanifi; H Samadi Kafil; H Tayebi Khosroshahi; R. Shapouri; M Asgharzadeh. "Bifidobacteriaceae Family Diversity in Gut Microbiota of Patients with Renal Failure". سامانه مدیریت نشریات علمی, 76, 3, 1400, 521-528. doi: 10.22092/ari.2020.352271.1557
Hanifi, Gh. R, Samadi Kafil, H, Tayebi Khosroshahi, H, Shapouri, R., Asgharzadeh, M. (1400). 'Bifidobacteriaceae Family Diversity in Gut Microbiota of Patients with Renal Failure', سامانه مدیریت نشریات علمی, 76(3), pp. 521-528. doi: 10.22092/ari.2020.352271.1557
Hanifi, Gh. R, Samadi Kafil, H, Tayebi Khosroshahi, H, Shapouri, R., Asgharzadeh, M. Bifidobacteriaceae Family Diversity in Gut Microbiota of Patients with Renal Failure. سامانه مدیریت نشریات علمی, 1400; 76(3): 521-528. doi: 10.22092/ari.2020.352271.1557

Bifidobacteriaceae Family Diversity in Gut Microbiota of Patients with Renal Failure

Archives of Razi Institute
مقاله 15، دوره 76، شماره 3، آذر 2021، صفحه 521-528    اصل مقاله (261.34 K)
نوع مقاله: Original Articles
شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/ari.2020.352271.1557
نویسندگان
Gh. R Hanifi1؛ H Samadi Kafil* 2؛ H Tayebi Khosroshahi3؛ R. Shapouri1؛ M Asgharzadeh4
1Department of Microbiology, Zanjan Branch, Islamic Azad University, Zanjan, Iran
2Drug Applied Research Center, Tabriz University of Medical Sciences, Tabriz, Iran
3Kidney Research Center, Tabriz University of Medical Sciences, Tabriz, Iran
4Biotechnology Research Center, Tabriz University of Medical Sciences, Tabriz, Iran
چکیده
Bifidobacteriaceae family are gut microbiota that exhibit probiotic or health promoting effects on the host. Several studies have suggested that gut microbiota are quantitatively and qualitatively altered in patients with chronic kidney disease (CKD) and end-stage renal disease (ESRD). The present study aimed to assess the members of Bifidobacteriaceae family in fecal samples of patients with CKD and ESRD and compare them with non-CKD/ESRD patients to find any changes in their counts and diversions in these patients. Twenty fresh fecal samples from patients with CKD/ESRD and twenty from non-CKD/ESRD patients were examined. Whole DNA was extracted from fecal samples and the gut microbiota composition was analyzed by next generation sequencing (NGS). A total of 651 strains were identified from 40 fecal samples, 8 (1.23%) strains of which were identified as family Bifidobacteriaceae. The most abundant species in both control and disease groups were Bifidobacterium adolescentis and Bifidobacterium longum subsp. longum, and the least abundant species in the disease group was Bifidobacterium animalis subsp. lactis. There was no significant difference in the abundance of various species between the disease and control groups (p < 0.05). This study confirms that the members of the Bifidobacteriaceae family are not altered in patients with CKD/ESRD.
کلیدواژه‌ها
Bifidobacteriaceae؛ chronic kidney disease (CKD)؛ end-stage renal disease (ESRD)؛ next generation sequencing (NGS)
عنوان مقاله [English]
بررسی تنوع بیفیدوباکتریوم‌های میکروفلور روده‌ای در بیماران مبتلا به نارسایی مزمن کلیوی
چکیده [English]
باکتری‌های خانواده بیفیدوباکتریاسه عضو میکروفلور روده‌ای هستند که به عنوان پروبیوتیک بر سلامتی میزبان تاثیر بسزایی دارند. مطالعات متعدد حاکی از تغییر کمی و کیفی فلور روده‌ای افراد مبتلا به بیماری مزمن کلیه (Chronic Kidney Disease, CKD) و یا بیماری انتهایی کلیه (End-Stage Renal Disease, ESRD) است. مطالعه حاضر با هدف بررسی فراوانی و تنوع گونه‌های خانواده بیفیدوباکتریاسه در فلور مدفوع افراد مبتلا به CKD/ESRD و مقایسه آن با گروه شاهد طراحی گردید. بدین ‌منظور، 20 نمونه مدفوع از بیماران مبتلا به CKD/ESRD و نیازمند پیوند کلیه (گروه بیمار) و 20 نمونه نیز از بیماران کلیوی غیر ESRD (گروه شاهد) اخذ گردید. پس از استخراج DNA کامل نمونه‌ها، ترکیب میکروفلور آن‌ها با روش توالی‌یابی نسل جدید (Next Generation Sequencing, NGS) مورد شناسایی و آنالیز قرار گرفت. نتایج نشان داد که از مجموع 651 سویه باکتریایی شناسایی‌شده، 8 سویه (23/1 %) مربوط به خانواده بیفیدوباکتریاسه بودند. بیشترین فراوانی در هر دو گروه شاهد و بیمار متعلق به گونه‌های بیفیدوباکتریوم آدولسنتیس و بیفیدوباکتریوم لانگوم تحت‌گونه لانگوم و کمترین فراوانی در گروه بیمار مربوط به گونه بیفیدوباکتریوم انیمالیس تحت‌گونه لاکتیس بود. مقایسه میانگین فراوانی سویه‌های مختلف مشخص نمود که بین گروه شاهد و بیمار اختلاف معنی‌داری وجود ندارد (P < 0.05). یافته‌های این مطالعه نشان داد که باکتری‌های خانواده بیفیدوباکتریاسه در بیماران مبتلا به CKD/ESRD از نظر تنوع و تعداد تغییر چندانی نمی‌کنند. به نظر می‌رسد حضور گونه‌های مختلف خانواده بیفیدوباکتریاسه بر بهبود عملکرد کلیوی افراد بیمار تاثیر چندانی نداشته و شاید فقط گونه‌های خاصی از این خانواده بر عملکرد کلیوی بیماران به‌طور معنی‌داری موثر باشند.
کلیدواژه‌ها [English]
بیفیدوباکتریاسه, بیماری مزمن کلیه (CKD), بیماری انتهایی کلیه (ESRD), توالی‌یابی نسل جدید (NGS)
مراجع
  1. Hooper LV, Midtvedt T, Gordon JI. How host-microbial interactions shape the nutrient environment of the mammalian intestine. Annu Rev Nutr. 2002;22:283-307.
  2. Leahy SC, Higgins DG, Fitzgerald GF, van Sinderen D. Getting better with bifidobacteria. J Appl Microbiol. 2005;98(6):1303-15.
  3. O'Hara AM, Shanahan F. Mechanisms of action of probiotics in intestinal diseases. Sci World J. 2007;7:31-46.
  4. Reinhardt C, Reigstad CS, Backhed F. Intestinal microbiota during infancy and its implications for obesity. J Pediatr Gastroenterol Nutr. 2009;48(3):249-56.
  5. Azcarate-Peril MA, Sikes M, Bruno-Barcena JM. The intestinal microbiota, gastrointestinal environment and colorectal cancer: a putative role for probiotics in prevention of colorectal cancer? Am J Physiol Gastrointest Liver Physiol. 2011;301(3):G401-24.
  6. Bisgaard H, Li N, Bonnelykke K, Chawes BL, Skov T, Paludan-Muller G, et al. Reduced diversity of the intestinal microbiota during infancy is associated with increased risk of allergic disease at school age. J Allergy Clin Immunol. 2011;128(3):646-52 e1-5.
  7. Gholizadeh P, Mahallei M, Pormohammad A, Varshochi M, Ganbarov K, Zeinalzadeh E, et al. Microbial balance in the intestinal microbiota and its association with diabetes, obesity and allergic disease. Microb Pathog. 2019;127:48-55.
  8. Mouzaki M, Comelli EM, Arendt BM, Bonengel J, Fung SK, Fischer SE, et al. Intestinal microbiota in patients with nonalcoholic fatty liver disease. Hepatology. 2013;58(1):120-7.
  9. Ventura M, Canchaya C, Tauch A, Chandra G, Fitzgerald GF, Chater KF, et al. Genomics of Actinobacteria: tracing the evolutionary history of an ancient phylum. Microbiol Mol Biol Rev. 2007;71(3):495-548.
  10. Parte A, Whitman W, Goodfellow M, Kämpfer P, Busse H, Trujillo M, et al. The Actinobacteria. Bergey’s manual of systematic bacteriology. New York: Springer; 2012.
  11. Zhang G, Gao B, Adeolu M, Khadka B, Gupta RS. Phylogenomic Analyses and Comparative Studies on Genomes of the Bifidobacteriales: Identification of Molecular Signatures Specific for the Order Bifidobacteriales and Its Different Subclades. Front Microbiol. 2016;7(978).
  12. Laureys D, Cnockaert M, De Vuyst L, Vandamme P. Bifidobacterium aquikefiri sp. nov., isolated from water kefir. Int J Syst Evol Microbiol. 2016;66(3):1281-6.
  13. Ventura M, van Sinderen D, Fitzgerald GF, Zink R. Insights into the taxonomy, genetics and physiology of bifidobacteria. Antonie Van Leeuwenhoek. Antonie Van Leeuwenhoek. 2004;86(3):205-23.
  14. Hida M, Aiba Y, Sawamura S, Suzuki N, Satoh T, Koga Y. Inhibition of the accumulation of uremic toxins in the blood and their precursors in the feces after oral administration of Lebenin, a lactic acid bacteria preparation, to uremic patients undergoing hemodialysis. Nephron. 1996;74(2):349-55.
  15. Vaziri ND, Yuan J, Rahimi A, Ni Z, Said H, Subramanian VS. Disintegration of colonic epithelial tight junction in uremia: a likely cause of CKD-associated inflammation. Nephrol Dial Transplant. 2012;27(7):2686-93.
  16. Vaziri ND, Wong J, Pahl M, Piceno YM, Yuan J, DeSantis TZ, et al. Chronic kidney disease alters intestinal microbial flora. Kidney Int. 2013;83(2):308-15.
  17. Kalantar-Zadeh K, Ikizler TA, Block G, Avram MM, Kopple JD. Malnutrition-inflammation complex syndrome in dialysis patients: causes and consequences. Am J Kidney Dis. 2003;42(5):864-81.
  18. Lau WL, Ix JH. Clinical detection, risk factors, and cardiovascular consequences of medial arterial calcification: a pattern of vascular injury associated with aberrant mineral metabolism. Semin Nephrol. 2013;33(2):93-105.
  19. Konstantinov SR, Smidt H, de Vos WM, Bruijns SC, Singh SK, Valence F, et al. S layer protein A of Lactobacillus acidophilus NCFM regulates immature dendritic cell and T cell functions. Proc Natl Acad Sci U S A. 2008;105(49):19474-9.
  20. van Baarlen P, Troost FJ, van Hemert S, van der Meer C, de Vos WM, de Groot PJ, et al. Differential NF-kappaB pathways induction by Lactobacillus plantarum in the duodenum of healthy humans correlating with immune tolerance. Proc Natl Acad Sci U S A. 2009;106(7):2371-6.
  21. Simenhoff M, Dunn S, Zollner G, Fitzpatrick M, Emery S, Sandine W, et al. Biomodulation of the toxic and nutritional effects of small bowel bacterial overgrowth in end-stage kidney disease using freeze-dried Lactobacillus acidophilus. Miner Electrolyte Metab. 1996;22(1-3):92-6.
  1. Vrieze A, Holleman F, Zoetendal EG, de Vos WM, Hoekstra JB, Nieuwdorp M. The environment within: how gut microbiota may influence metabolism and body composition. Diabetologia. 2010;53(4):606-13.
  2. Klindworth A, Pruesse E, Schweer T, Peplies J, Quast C, Horn M, et al. Evaluation of general 16S ribosomal RNA gene PCR primers for classical and next-generation sequencing-based diversity studies. Nucleic Acids Res. 2013;41(1):e1.
  3. Cruz-Mora J, Martinez-Hernandez NE, Martin del Campo-Lopez F, Viramontes-Horner D, Vizmanos-Lamotte B, Munoz-Valle JF, et al. Effects of a symbiotic on gut microbiota in Mexican patients with end-stage renal disease. J Ren Nutr. 2014;24(5):330-5.
  4. Kotanko P, Carter M, Levin NW. Intestinal bacterial microflora--a potential source of chronic inflammation in patients with chronic kidney disease. Nephrol Dial Transplant. 2006;21(8):2057-60.
  5. Chapkin RS, Seo J, McMurray DN, Lupton JR. Mechanisms by which docosahexaenoic acid and related fatty acids reduce colon cancer risk and inflammatory disorders of the intestine. Chem Phys Lipids. 2008;153(1):14-23.
  6. Simopoulos AP. Omega-3 fatty acids in inflammation and autoimmune diseases. J Am Coll Nutr. 2002;21(6):495-505.
  7. Brun P, Castagliuolo I, Di Leo V, Buda A, Pinzani M, Palu G, et al. Increased intestinal permeability in obese mice: new evidence in the pathogenesis of nonalcoholic steatohepatitis. Am J Physiol Gastrointest Liver Physiol. 2007;292(2):G518-25.
  8. Cani PD, Bibiloni R, Knauf C, Waget A, Neyrinck AM, Delzenne NM, et al. Changes in gut microbiota control metabolic endotoxemia-induced inflammation in high-fat diet-induced obesity and diabetes in mice. Diabetes. 2008;57(6):1470-81.
  9. Cani PD, Neyrinck AM, Fava F, Knauf C, Burcelin RG, Tuohy KM, et al. Selective increases of bifidobacteria in gut microflora improve high-fat-diet-induced diabetes in mice through a mechanism associated with endotoxaemia. Diabetologia. 2007;50(11):2374-83.
  10. de Goffau MC, Luopajarvi K, Knip M, Ilonen J, Ruohtula T, Harkonen T, et al. Fecal microbiota composition differs between children with beta-cell autoimmunity and those without. Diabetes. 2013;62(4):1238-44.
  1. Evenepoel P, Meijers BK, Bammens BR, Verbeke K. Uremic toxins originating from colonic microbial metabolism. Kidney Int Suppl. 2009(114):S12-9.
  2. Goetze O, Fruehauf H, Pohl D, Giarre M, Rochat F, Ornstein K, et al. Effect of a prebiotic mixture on intestinal comfort and general wellbeing in health. Br J Nutr.

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

   2008;100(5):1077-85.

  1. Taki K, Takayama F, Niwa T. Beneficial effects of Bifidobacteria in a gastroresistant seamless capsule on hyperhomocysteinemia in hemodialysis patients. J Ren Nutr. 2005;15(1):77-80.
  2. Koppe L, Mafra D, Fouque D. Probiotics and chronic kidney disease. Kidney Int. 2015;88(5):958-66.
آمار
تعداد مشاهده مقاله: 2,161
تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 3,236


counter
سامانه مدیریت نشریات علمی. طراحی و پیاده سازی از سیناوب