| تعداد نشریات | 286 |
| تعداد نشریات سازمان | 84 |
| تعداد شماره‌ها | 3,019 |
| تعداد مقالات | 33,735 |
| تعداد مشاهده مقاله | 44,976,707 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 46,596,720 |
تعیین برخی ویژگی های مولکولی و زیستی ویروس پسوروز مرکبات آلوده کننده نارنگی انشو دیررس (Citrus unshiu Marc) در شرق استان مازندران | ||
| آفات و بیماری های گیاهی | ||
| مقاله 5، دوره 87، شماره 2 - شماره پیاپی 109، اسفند 1398، صفحه 195-207 اصل مقاله (652.63 K) | ||
| نوع مقاله: بیماری‌شناسی گیاهی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/jaep.2019.126782.1290 | ||
| نویسندگان | ||
| فائزه فلکی1؛ سید وحید علوی2؛ فرشاد رخشنده رو* 3؛ امیر موسوی4 | ||
| 1گروه گیاه پزشکی، دانشکده علوم کشاورزی و صنایع غذایی، واحد علوم و تحقیقات تهران، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران | ||
| 2عضو هیئت علمی/ مرکز تحقیقات کشاورزی و منابع طبیعی مازندران | ||
| 3گروه گیاه پزشکی، دانشکده علوم کشاورزی و صنایع غذایی، واحد علوم و تحقیقات تهران، دانشگاه آزاد اسلامی | ||
| 4گروه زیست فناوری مولکولی گیاهی، پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری، تهران | ||
| چکیده | ||
| طی سال‌های اخیر علایم پوسته پوسته شدن تنه، نقوش موزاییکی و لکههای حلقوی روی میوه بالغ به‌خصوص در اطراف گلگاه و لکههای زرد رنگ گسترده و حلقوی روی برگهای مسن درختان نارنگی انشو دیررس Citrus unshiu (Yu.Tanaka ex Swingle)در استان مازندران مشاهده شده است. خصوصیات زیستی جدایه‌ها از طریق نموده سازی روی پایه‌های مختلف مرکبات بررسی شد و نتایج حاکی از حضور تیپ B ویروس پسوروز مرکبات در نمونه ها بود. ردیابی مولکولی CPsV توسط واکنش زنجیرهای پلیمراز نسخه برداری معکوس (RT-PCR) با یک جفت آغازگر اختصاصی طراحی شده صورت گرفت و قطعه مورد انتظار به‌طول حدود bp 600 در نمونه های جمع آوری شده از باغ و گلخانه تکثیر شد. بررسی تبارزائی جدایه‌های منتخب بر مبنی توالی ژنتیکی پروتئین پوششی ویروس، جدایه‌های جهانی را در دو گروه مجزا و سه زیر گروه در گروه اول قرار داد. جدایه‌های ایرانی در زیرگروه دوم در کنار جدایه‌هایی از کشورهای آمریکا و ژاپن قرار گرفتند و کمترین میزان شباهت ژنتیکی را با جدایه هایی از کشورهای آمریکای لاتین و آفریقا داشتند. واژه‌های کلیدی: | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| تبارزائی؛ تغییرات ژنتیکی؛ توالی یابی؛ نموده سازی | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| Partial Biological and Molecular Characterization of Citrus psorosis virus Infecting Satsuma mandarin (Citrus unshiu Marc) in the east of Mazandaran province | ||
| نویسندگان [English] | ||
| Faezeh Falaki1؛ Seyed Vahid Alavi2؛ Farshad Rakhshandehroo3؛ Amir Mousavi4 | ||
| 1Department of Plant Protection, College of Agriculture Sciences and Food Industries, Science and Research Branch, Islamic Azad university, Tehran, Iran | ||
| 2member of scientific board/ Mazandaran agricultural and natural resources research centre | ||
| 4Department of Plant Biotechnology, National Institute of Genetic Engineering and Biotechnology, P.O. Box 14155-6343, Tehran, Iran | ||
| چکیده [English] | ||
| A disorder on Satsuma mandarin, Citrus unshiu (Yu.Tanaka ex Swingle) trees with bark scaling of the trunk, ring spot or mosaic pattern symptoms on mature fruits especially around the calyx and extended yellow ring spot on the old leaves observed over the recent years in Mazandaran province. The results of virus mechanical inoculation on Gomphrena globosa indicator plants and indexing on different citrus stock and biological properties of the studied isolates indicated the presence of the type B citrus psorosis virus in samples. Molecular detection of CPsV was done by using RT-PCR and specific designed primers in which a desired amplicon with a size about 600bp amplified in infected samples collected from the orchards and greenhouse. Phylogenetic analysis of the representative isolates on the basis of nucleotide sequences of the CPsV-coat protein, categorized the representative isolates into two distinct groups which the group one further divided into three subgroups. Iranian isolates were clustered in the second subgroup beside the Americans and Japanese isolates and showed the lowest identity with the isolates from Latin American and African countries | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| Genetic variation, indexing, sequencing, phylogeny | ||
| مراجع | ||
|
ACHACHI, A., E. A. BARKA, and M. IBRIZ, 2014. Recent advances in Citrus psorosis virus. Virus Disease, 25 (3): 261-276. ACHACHI, A., M. H. JIJAKLI, E. E. FAHIME, A. SOULAYMANI, and M. IBRIZ, 2015. Detection of Citrus psorosis virus using an improved one-step RT-PCR. Arabian Journal for Science and Engineering, 40 (1): 7-13. AHLAWAT, Y. S, and R. P. PANT, 2008. Indian citrus ringspot virus. Characterization, diagnosis & management of plant viruses. Volume 2, horticultural crops, pp. 97-107. ALIOTO, D., M. GANGEMI, S. DEAGLIO, S. SPOSATO, E. LOISONI, and R. G. MILNI, 1999. Improved detection of Citrus psorosis virus using polyclonal and monoclonal antibodies. Plant Pathology, 48: 735-741. ALIOTO, D., M. MALFITANO, A. TROISI, S. PELUSO, R.G. MARTIN, J. MILNE, P.GURRI, and P. MORENO, 2003.Variability of the coat protein gene of Citrus psorosis virus in Campania, southern Italy.Archives of Virology, 148: 2155-66. ALTSCHUL, S. F., T. L. MADDEN, A. A. SCHAFFER, J. ZHANG, Z. ZHANG, W. MILLER, and D. J. LIPMAN, 1997. Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs. Nucleic Acids Research, 25: 3389-3402. ANONYMOUS, 2017. Production and yield per hectare of mandarin crop by province. Agricultural Statistics of the Crop Year 2014-2015. Department of Statistics and Information of Ministry of Agriculture Jihad, 154 pages. BARTHE, G.A., T.L. TCECCARDI, K.L. MANJUNATH, and K.S. DERRICK, 1998. Citrus psorosis virus: nucleotide sequencing of the coat protein gene and detection by hybridization and RT–PCR. Journal of General Virology, 79:1531-1537. DANOS, E. 1989. Development of psorosis-citrus pathosystems in controlled-environment chambers, Rivista di Agricoltura Subtropicale e Tropicale. No. 83: 275-282. DERRICK, K. S., R. H. BRLANSKY, J. V. DA GRACA, R. F. LEE, L. W. TIMMER, and T. K. NGUYEN, 1988. Partial characterization of a virus associated with citrus ringspot. Phytopathology, 78: 1298-1301. DURAN-VILA, N., PINA, J. A. and NAVARRO, L. 1993. Improved indexing of citrus viroids. 12th.Conf. IOCV. 202-211. GARCÍA, M. L., E. DAL. BÓ, O. GRAU, and R. G. MILNE, 1994. The closely related citrus ringspot and citrus psorosis viruses have particles of novel filamentous morphology. General Virology Journal, 75: 3585-3590. FALAKI, F., S. V. ALAVI, and F. RAKHSHANDEHROO. 2013. Citrus psorosis virus, causal agent of ring pattern disorder in Thomson Navel trees in east of Mazandaran. Iranian Journal of Applied Entomology and Phytopathology, 80 (2): 161-172. (In Persian) FAO STAT, 2016. National Agricultural statistics Service, USDA.http://www.faostat.fao.org. FAWCETT, H.S. 1948. Psorosis (scaly bark) in the Rio Grande Valley. Texas Fmg & Citricult. 25(1): 15-16. FOTOHI-GHAZVINI, R. 1999. Citrus Growing in Iran. 1th Ed, Guilan University Press. Iran.150pp FRISON, E. A. and M. M. TAHER, 1991. Technical Guidelines for the Safe Movement of Citrus Germplasm, FAO/IBPGR, Rome, Italy, 45 pp. FUJIII H., OHTA S., NONAKA K., K ATAYOSE Y, MATSUMOTO T., ENDO T, YOSHIOKA T, OMURA M and T. SHIMADA. 2016. Parental diagnosis of satsuma mandarin (Citrus unshiu Marc.) revealed by nuclear and cytoplasmic markers. Breeding science, 66 (5): 683-691. GOLEIN, B and B. ADOLI, 2011. Citrus (Planting),Novin Pouya Press, 160 p. (in Persian). HABASHI, M. 2004. Citrus virus diseases in north of Iran. Journal of Plant Diseases, 2: 127-133. LOCONSOLE, G., M. T. FATONE, and V. SAVINO, 2009. Specific digoxigenin-labelled riboprobes for detection of Citrus psorosis virus and Citrus variegation virus by molecular hybridization, Plant Pathology Journal, 91 (2): 311-319. MARTÍN, S., M. L. GARCIA, A. TROISI, L. RUBIO, G. LEGARRETA, O. GRAU, D. ALIOTO, P. MORENO, and J. GUERRI, 2006. Genetic variation of populations of Citrus psorosis virus, Journal of General Virology. 87: 3097-3102. MARTÍN, S., C. LOPEZ, M. L. GARCIA, G. NAUMONGANIA, O. GRAU, R. FLORES, P. MORENO and J. GUERRI, 2005. The complete nucleotide sequence of Spanish isolate of Citrus psoriasis virus: Comparative analysis with other Polioviruses, Archives of Virology. 150: 167-176. MARTÍN, S., D. ALIOTO, R. G. MILNE, S. M. GARNSEY, M. L. GARCIA, O. GRAU, J. GUERRI and P. MORENO, 2004. Detection of Citrus psorosis virus by ELISA, molecular hybridization, RT-PCR and immunosorbent electron microscopy and its association with citrus psoriasis disease, European Journal of Plant Pathology. 110: 747-757. MILNE, R. G., K. DJELOUAH, M. L. GARCIA, E. DAL BO and O. GRAU. 1996. Structure of Citrus Ringspot-Psorosis-Associated Virus Particles: Implications for Diagnosis and Taxonomy. 13th Conf. IOCV. 189-197. MILNE, R. G. 2005. Genus Poliovirus, Proc. 18th Conf. IOCV. p. 673-679. NASROLLAHNEZHAD, S. and A. EBADI, 2011. Serological and molecular detection of Citrus psoroasis virus in Goleta province, New Genetics. 1: 65-74. NAVAS-CASTILLO, J. N, and P. MORENO. 1995. Filamentous flexuous particles and serologically related proteins of variable size associated with citrus psorosis and ringspot diseases. European Journal of Plant Pathology, 1(01): 343-348. NAVAS-CASTILLO, J. N, P. MORENO, J. F. BALLESTEROLMOS, J. A. PINA, and A. HERMOSO DE MENDOZA, 1991. Detection of a necrotic strain of Citrus ringspot virus in Star Ruby grapefruit in Spain, Proc. 11th Conf. IOCV. p. 345-351. ROISTACHER, C. N. 1991. Graft -Transmissible Diseases of Citrus, FAO: Rome. 286 pp. ROISTACHER, C. N. 1993. Psorosis-Areview. Proc. 12th Conf. IOCV. 139-154. SHARMA, S., B. SINGH, A. NAGPAL, G. S. VIRK and A. A. ZAIDI, 2009. Indexing tools for Indian citrus ringspot virus (ICRSV), The Open Biology Journal 2: 27-31. BANI HASHEMI, S.M., and TAHERI, H. 2016. Citrus psorosis disease. Citrus and Subtropical Fruits Research Center publication, AREEO, Iran (In Persian). 16pp. TIMMER, L. W, 1973. A necrotic strain of Citrus ringspot virus and its relationship to Citrus psorosis virus. Phytopathology, 64: 389-394. VELÁZQUEZ, K., A. RENOVELL, M. COMELLAS, P. SERRA, M. L. GARCÍA, J. A. PINA, L. NAVARRO, P. MORENO and J. GUERRI, 2010. Effect of temperature on RNA silencing of a negative-stranded RNA plant virus: Citrus psorosis virus. Plant Pathology: 59, 982-990. VELAZQUEZ K, J.A.PINA., l. NAVARRO, P. MORENO, and J. GUERRI. 2012.Association of citrus psorosis B symptoms with a sequence variant of the Citrus psorosis virus RNA 2. Plant Pathology, 61: 448-456. WALLACE, J. M. 1957. Virus-strain interference in relation to symptoms of psorosis disease of citrus, Hilgar. No. 27: 223-245. WHITESIDE, J. O., S. M. GARNSEY and L. W. TIMMER,1989. Compendium of Citrus Diseases, APS Press. 80pp. | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 768 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 387 |
||