- همه نشریات
- علوم آب و خاک
- علوم اقتصاد و ترویج کشاورزی
- علوم جنگل, مرتع و آبخیزداری
- علوم دامی و شیلات
- علوم زراعی و باغی
- علوم گیاهپزشکی
- علوم مهندسی و مکانیزاسیون کشاورزی
- مجلات ترویجی کشاورزی
- نشریات انجمن ها
- نشریات با زبان انگلیسی
- نشریات با زبان فارسی
- نشریات دانشگاه آزاد اسلامی
- نشریات علمی
- نشریات علمی سازمان تحقیقات، آموزش و ترویچ کشاورزی
آمار
| تعداد نشریات | 275 |
| تعداد نشریات سازمان | 74 |
| تعداد شماره‌ها | 1,716 |
| تعداد مقالات | 19,966 |
| تعداد مشاهده مقاله | 10,890,747 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 8,506,009 |
Taxonomic study of cyanoprokaryotes from medicinal plants bed with emphasis on phylogeny of complex taxa using 16S rRNA marker | ||
| Rostaniha | ||
| مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 20 دی 1398 | ||
| نوع مقاله: Research Paper | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/botany.2019.126659.1159 | ||
| نویسندگان | ||
Somayeh Zarezadeh؛ Hossein Riahi؛ Zeinab Shariatmadari  ؛ Masoumeh Sadat Hosseini
| ||
| Faculty of Life Sciences and Biotechnology, Shahid Beheshti University, Tehran, Iran | ||
| چکیده | ||
| Cyanoprokaryotes are simple photosynthetic microorganisms which have an important role in the soil carbon and nitrogen cycle. The current study aimed to investigate the flora of cyanoprokaryotes from medicinal plants bed. Also phylogenetic analysis based on 16S rRNA marker was performed to investigate the phylogenetic relationships between different cyanoprokaryotic taxa and evaluate the efficiency of this marker in separation of taxonomic boundaries between taxa especially in the case of complex taxa, which relations are not well defined. For this purpose, after soil collection, isolation and purification of strains was performed. The Cyanoprokaryotic taxa were identified morphologically and 16S rRNA marker was used to approve the identifications. Phylogenetic analysis performed using Maximum likelihood, Maximum Parsimony and Bayesian inference. Totally 42 cyanoprokaryotic taxa were identified and Nostoc was an abundant genus in the soil of medicinal plants bed. The phylogenetic tree revealed Nostocales as a monophyletic group. Also Wollea and Anabaena together and genera Nostoc and Desmonostoc together created monophyletic groups. Results revealed that 16S rRNA is an effective phylogenetic marker in high classification rankings such as order, Family and genus. However, 16S rRNA could not be an effective marker in separation of close genera such as Nostoc and Desmonostoc. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| Cyanoprokaryotes؛ 16S rRNA؛ Phylogeny؛ Wollea؛ Desmonostoc | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| مطالعه تاکسونومیک سیانوپروکاریوت‌های بستر رویشی گیاهان دارویی با تاکید بر فیلوژنی تاکسون‌های پیچیده با استفاده از مارکر 16S rRNA | ||
| نویسندگان [English] | ||
| سمیه زارع زاده؛ حسین ریاحی؛ زینب شریعتمداری؛ معصومه سادات حسینی | ||
| چکیده [English] | ||
| سیانوپروکاریوت‌ها موجودات ریز ساده فتوسنتز کننده‌ای هستند که نقش مهمی در چرخه‌های نیتروژن و کربن خاک ایفا می‌نمایند. هدف مطالعه حاضر بررسی فلور سیانوپروکاریوت‌های موجود در بستر رویشی گیاهان دارویی است. همچنین، بررسی فیلوژنتیک به منظور ارزیابی روابط فیلوژنی میان تاکسون‌های مختلف سیانوپروکاریوتی با استفاده از مارکر 16S rRNA و ارزیابی کارآمدی این مارکر در جداسازی مرزهای تاکسونومیک میان تاکسون‌ها، به ویژه در مورد تاکسون‌های پیچیده، که روابط میان آنها به‌خوبی شناخته شده نیست، انجام گرفته است. به این منظور، پس از جمع‌آوری خاک جداسازی و خالص‌سازی سویه‌ها انجام گرفت. تاکسون‌های سیانوپروکاریوتی بر اساس خصوصیات مورفولوژیک شناسایی شدند و تأیید شناسایی‌ها با کمک مارکر مولکولی 16S rRNA انجام گرفت. روابط فیلوژنی با استفاده از Maximum likelihood، Maximum parsimony و Bayesian inference مورد ارزیابی قرار گرفت. در مجموع 42 تاکسون سیانوپروکاریوتی شناسایی شد و نتایج نشان دهنده‌ی غالب بودن گونه Nostoc در فلور بستر رویشی گیاهان دارویی بود. درخت حاصل از نتایج فیلوژنی نشان‌دهنده تک‌نیایی بودن Nostocales است. همچنین جنس‌های Wollea و Anabaena با‌همدیگر و نیز جنس‌های Nostoc و Desmonostoc باهم گروه‌های تک‌نیا را تشکیل دادند. نتایج نشان‌دهنده‌ی کارآمدی مارکر 16S rRNA در سطوح بالای سیستم رده‌بندی، اعم از راسته، خانواده و جنس می‌باشد. با‌این وجود، این مارکر در جداسازی تاکسون‌های نزدیک به یکدیگر نظیر Desmonostoc و Nostoc از کارآمدی لازم برخوردار نیست. | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| سیانوپروکاریوت, 16S rRNA, فیلوژنی, Wollea, Desmonostoc | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 2 |
||
