| تعداد نشریات | 287 |
| تعداد نشریات سازمان | 85 |
| تعداد شمارهها | 3,159 |
| تعداد مقالات | 35,108 |
| تعداد مشاهده مقاله | 50,530,815 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 90,479,602 |
Molecular Detection of Gamma Coronaviruses in Bird Parks of Iran | ||
| Archives of Razi Institute | ||
| مقاله 4، دوره 74، شماره 4، اسفند 2019، صفحه 349-355 اصل مقاله (225.9 K) | ||
| نوع مقاله: Original Articles | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/ari.2018.116786.1176 | ||
| نویسندگان | ||
| H. Yaghoubi1؛ A. Ghalyanchilangeroudi* 1؛ Vahid Karimi2؛ S. A. Ghafouri3؛ M. Hashemzadeh4؛ H. Hosseini5؛ M. H. Fallah4؛ F. Sadat Mousavi1؛ H. Najafi6 | ||
| 1Department of Microbiology and Immunology, Faculty of Veterinary Medicine, University of Tehran, Tehran, Iran | ||
| 2Department of Avian Diseases, Faculty of Veterinary Medicine, University of Tehran, Tehran, Iran | ||
| 3Department of clinical sciences, Faculty of Veterinary Medicine, Ferdowsi University of Mashhad, Mashhad, Iran | ||
| 4Department of Poultry Diseases, Razi Vaccine and Serum Research Institute, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran | ||
| 5Department of Poultry Diseases, Islamic Azad University, University of Tehran, Tehran, Iran | ||
| 6Department of Pathobiology, School of Veterinary Medicine, Shiraz University, Shiraz, Iran | ||
| چکیده | ||
| Gamma Coronaviruses (GCoVs) are distributed worldwide, affecting a wide range of bird species, the beluga whale, and bottlenose dolphins. Because of the limited proofreading capability in the viral encoded polymerase, they emerge genetically diverse. There has been no molecular surveillance data to describe the epidemiology of GCOVs in avian species. The present study was conducted to detect GCOVs in Tehran birds’ parks, 2015. Cloacal swabs (267 samples) from eight different bird species ((Chickens (Gallus gallus), Pheasant (Phasianus colchicus), Turkey (Meleagris gallopavo), Partridge (Perdix perdix), Quail (Coturnix coturnix), Duck (Anas platyrhynchos), Goose (Anserini),and Guinea fowl (Numididae)) were collected, the viral RNA was extracted, the RT-PCR was performed using QIAGEN one step RT-PCR kit and the primers targeting “3'-UTR” and “Nucleocapsid” genes. The detection rate was approximately 8.99%. GCOVs were detected in the chicken, quail, pheasant, turkey, and the partridge with different prevalence rates. Phylogenetic tree based on partial nucleotide sequences of the N gene clustered the samples into two groups. It is the first report of GCOVs in non-commercial birds in Iran. According to our results, GCOVs are circulating in different avian species, and further studies are needed to isolate these viruses and evaluate their pathogenesis. | ||
| کلیدواژهها | ||
| Gamma coronavirus؛ Molecular detection؛ Bird Parks؛ Iran؛ Phylogenetic Analysis | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| ردیابی کرونا ویروسها در پارکهای پرندگان، ایران | ||
| چکیده [English] | ||
| گاماکرونا ویروسها دارای گسترش جهانی بوده و طیف گستردهای از گونههای پرندگان، وال سفید و دلفینها را آلوده میسازند. این ویروسها بهدلیل توانایی محدود تصحیحی پلیمراز ویروسی، از نظر ژنتیکی متنوع هستند. هیچگونه پایش مولکولی برای توصیف همهگیریشناسی گاما کرونا ویروسها در گونههای پرندگان وجود نداشته است. هدف این مطالعه حاضر ردیابی گاما کرونا ویروسها در پارکهای پرندگان تهران در سال 2015 بود. سوآبهای کلوآک (267 نمونه) از 8 گونه مختلف پرنده (مرغ، قرقاول، بوقلمون، کبک، بلدرچین، اردک، غاز و مرغ شاخدار) جمع آوری شدند،RNA ویروسی استخراج گردید و با استفاده از پرایمرهای هدف ژنهای –"UTR'3 " و "نوکلئوکپسید" و کیتRT-PCRیک مرحلهای کیاژن، RT-PCRانجام شد. میزان ردیابی تقریبا 8.99 درصد بود. گاما کرونا ویروسها در مرغ، قرقاول، بوقلمون، کبک و بلدرچین با میزانهای شیوع متفاوت ردیابی شدند. درخت فیلوژنتیکی بر اساس توالیهای نوکلئوتیدی بخشی از ژنN، نمونهها را در دو گروه دستهبندی نمود. این اولین گزارش از گاما کرونا ویروسها در پرندگان غیر تجاری در ایران است. طبق نتایج ما گاما کرونا ویروسها در گونههای مختلف پرندگان در حال گردش بوده و برای جداسازی این ویروسها و ارزیابی بیماریزایی آنها مطالعات بیشتری لازم است. | ||
| کلیدواژهها [English] | ||
| گاما کرونا ویروس, پارک پرندگان, ایران | ||
| مراجع | ||
|
Cavanagh, D., Mawditt, K., Welchman, D.d.B., Britton, P., Gough, R., 2002. Coronaviruses from pheasants (Phasianus colchicus) are genetically closely related to coronaviruses of domestic fowl (infectious bronchitis virus) and turkeys. Avian pathol 31, 81-93.
Chen, G.Q., Zhuang, Q.Y., Wang, K.C., Liu, S., Shao, J.Z., Jiang, W.M., et al., 2013. Identification and survey of a novel avian coronavirus in ducks. PloS One 8, e72918..
Chu, D.K., Leung, C.Y., Gilbert, M., Joyner, P.H., Ng, E.M., Tsemay, M.T., et al., 2011. Avian coronavirus in wild aquatic birds. J Virol 85, 12815-12820.
Circella, E., Camarda, A., Martella, V., Bruni, G., Lavazza, A., Buonavoglia, C., 2007. Coronavirus associated with an enteric syndrome on a quail farm. Avian Pathol 36, 251-258.
Domanska-Blicharz, K., Jacukowicz, A., Lisowska, A., Wyrostek, K., Minta, Z., 2014. Detection and molecular characterization of infectious bronchitis-like viruses in wild bird populations. Avian Pathol 43, 406-413.
Dong, B., Liu, W., Fan, X., Vijaykrishna, D., Tang, X., Gao, F., et al., 2007. Detection of a novel and highly divergent coronavirus from Asian leopard cats and Chinese ferret badgers in Southern China. J Virol 81, 6920-6926.
Duraes-Carvalho, R., Caserta, L.C., Barnabé, A.C., Martini, M.C., Simas, P.V., Santos, M.M., et al., 2015. Phylogenetic and phylogeographic mapping of the avian coronavirus spike protein-encoding gene in wild and synanthropic birds. Virus Res 201, 101-112.
Guihong, Z., Jiadong, F., Tao, R., Weisheng, C., Kaijiang, L., Chenggang, X., et al., 2006. Isolation and identification of a novel coronavirus from wild bird. Prog Nat Sci 16, 1275-1280.
Hughes, L.A., Savage, C., Naylor, C., Bennett, M., Chantrey, J., Jones, R., 2009. Genetically diverse coronaviruses in wild bird populations of northern England. Emerg Infect Dis 15, 1091-1094.
Jordan, B.J., Hilt, D.A., Poulson, R., Stallknecht, D.E., Jackwood, M.W., 2015. Identification of Avian Coronavirus in Wild Aquatic Birds of the Central and Eastern USA. J Wildl Dis 51, 218-221.
Liu, S., Chen, J., Chen, J., Kong, X., Shao, Y., Han, Z., et al., 2005. Isolation of avian infectious bronchitis coronavirus from domestic peafowl (Pavo cristatus) and teal (Anas). J Gen Virol 86, 719-725.
Mihindukulasuriya, K.A., Wu, G., Leger, J.S., Nordhausen, R.W., Wang, D., 2008. Identification of a novel coronavirus from a beluga whale by using a panviral microarray. J Virol 82, 5084-5088.
Muradrasoli, S., Mohamed, N., Hornyák, Á., Fohlman, J., Olsen, B., Belák, S., et al., 2009. Broadly targeted multiprobe QPCR for detection of coronaviruses: Coronavirus is common among mallard ducks (Anas platyrhynchos). J Virol Methods 159, 277-287.
Tamura, K., Peterson, D., Peterson, N., Stecher, G., Nei, M., Kumar, S., 2011. MEGA5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods. Mol Biol Evol 28, 2731-2739.
Torres Alejo, C., Hora, A., Tonietti, P., Taniwaki, S., Cecchinato, M., Villarreal Buitrago, L., et al., 2016. Gamma and Deltacoronavirus in quail. Avian Dis 60, 656-661.
Torres, C., Listorti, V., Lupini, C., Franzo, G., Drigo, M., Catelli, E., et al., 2016. Gamma and Deltacoronaviruses in quail and pheasants from Northern Italy. Poult Sci, 96, 717-722.
Torres, C., Villarreal, L., Ayres, G., Richtzenhain, L., Brandão, P., 2013. An avian coronavirus in quail with respiratory and reproductive signs. Avian Dis 57, 295-299.
Wickramasinghe, I.A., de Vries, R., Weerts, E., van Beurden, S., Peng, W., McBride, R., et al., 2015. Novel Receptor Specificity of Avian Gammacoronaviruses That Cause Enteritis. J Virol 89, 8783-8792.
Wille, M., Muradrasoli, S., Nilsson, A., Järhult, J.D., 2016. High Prevalence and Putative Lineage Maintenance of Avian Coronaviruses in Scandinavian Waterfowl. PloS one 11, e0150198. | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 16,394 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 65,027 |
||