- همه نشریات
- علوم آب و خاک
- علوم اقتصاد و ترویج کشاورزی
- علوم جنگل, مرتع و آبخیزداری
- علوم دامی و شیلات
- علوم زراعی و باغی
- علوم گیاهپزشکی
- علوم مهندسی و مکانیزاسیون کشاورزی
- مجلات ترویجی
- نشریات انجمن ها
- نشریات با زبان انگلیسی
- نشریات با زبان فارسی
- نشریات ترویجی کشاورزی
- نشریات دانشگاه آزاد اسلامی
- نشریات علمی پژوهشی
- نشریات علمی پژوهشی سازمان تحقیقات, آموزش و ترویچ
- نشریات علمی ترویجی
آمار
| تعداد نشریات | 273 |
| تعداد نشریات سازمان | 72 |
| تعداد شماره‌ها | 1,661 |
| تعداد مقالات | 19,196 |
| تعداد مشاهده مقاله | 10,619,858 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 8,111,375 |
Identification, sequencing and phylogenetic analysis of bor gene in Escherichia coli strain X1378 (O78:K80) isolated from avian colibacillosis in Iran | ||
| Archives of Razi Institute | ||
| مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده ، انتشار آنلاین از تاریخ 11 تیر 1398 | ||
| نوع مقاله: Original Articles | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/ari.2018.120869.1200 | ||
| نویسندگان | ||
Bahar Nayeri Fasaei1؛ T. Zahraei Salehi2؛ Saaed Salari   3؛ Mohammad mehdi Ranjbar 4؛ Ali Reza Yousefi5
| ||
| 1Department of Microbiology, Faculty of Veterinary Medicine, University of Tehran, Tehran, Iran. | ||
| 2دانشگاه تهران | ||
| 3گروه پاتوبیولوژی، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه زابل، سیستان و بلوچستان، ایران | ||
| 4Razi vaccine and Sera institute | ||
| 5سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی | ||
| چکیده | ||
| Colibacillosis known as fatal bacterial diseases with high commercial losses importance world-wide. This study was amid to elucidate of sequence, genetic characteristics and phylogeny of bor gene in Escherichia coli strain X1378 (O78:K80) isolated from avian colibacillosis in Iran, and also developing a rapid and optimize PCR molecular based technique with specific primers to detect this gene in E. coli. A virulent wild type avian E. coli (laboratory designation E. coli strain X1378) isolated from a chicken with systemic colibacillosis in Iran was used as a source of bor gene. DNA was extracted and PCR method was used to amplify bor gen. A 658 bp fragment of bor gene was amplified, sequenced and blasted, and phylogenetic study was followed. The most similar sequence to bor gene in E. coli strain X1378 were Escherichia coli APEC O78, Enterobacteria phage HK630, Escherichia coli BW2952, respectively. There were high similarity between bor gen in E. coli bacteria and phag and their plasmid. Also, a high similarity observed between bor and iss gene (approximately 92%), showing they seems are homologous gens. In addition, similarity analysis of in different bacterial species, their plasmid and bacteriophage with bor gene showed that nearest similar to O78:K80 were Paracoccidioides brasiliensis, Bacillus thuringiensis CT43 plasmid pBMB0558 and S. enterica subsp. enterica serovar Kentucky str .CVM29188 plasmid, respectively. Altogether, Results of present study confirmed the presence of bor gene in Iranian isolates and clarified its sequence, phylogenetic relationship and similarities for Escherichia coli strain X1378 (O78:K80) isolated from avian colibacillosis. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| E. coli؛ Colibacillosis؛ Avian؛ Identification | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| تشخیص، توالی یابی و آنالیز فیلوژنی ژن bor در سویه X1378 باکتری E. Coli (O78:K80) جدا شده از کلی باسیلوز طیور در ایران | ||
| نویسندگان [English] | ||
| Bahar Nayeri1؛ تقی زهرایی صالحی2؛ علیرضا یوسفی5؛ | ||
| 1Department of Microbiology, Faculty of Veterinary Medicine, University of Tehran, Tehran, Iran. | ||
| چکیده [English] | ||
| کلی‌باسیلوز یک بیماری باکتریایی کشنده است که خسارات اقتصادی زیادی را در سراسر دنیا به بار می‌آورد. این مطالعه با هدف تعیین توالی، ارزیابی خصوصیات ژنتیکی و فیلوژنی ژن bor در سویه X1378 باکتری E. Coli جدا شده از کلی‌باسیلوز طیور ایران و همچنین ایجاد یک روش سریع و بهینه بر پایه PCR با پرایمرهای اختصاصی برای تشخیص این ژن در باکتری E. Coli انجام شد. سویه وحشی با حدت بالای باکتری E. Coli (سویه X1378) جدا شده از جوجه‌های دارای کولی‌باسیولوز سیستمیک در ایران به عنوان منبع ژن bor مورد استفاده قرار گرفت. پس از استخراج DNA، ژن bor با روش PCR تکثیر شد. یک قطعه 658 جفت بازی از ژن bor تکثیر، توالی‌یابی و مورد مطالعه فیلوژنی قرار گرفت. مشابه‌ترین توالی با ژن bor باکتری E. Coli سویه X1380، به ترتیب Escherichia coli APEC O78، Enterobacteria phage HK630 و Escherichia coli BW2952 بود. تشابه توالی بسیار زیادی بین ژن bor در باکتری E. Coli با فاژ و پلاسمید آن‌ها وجود داشت. همچنین، شباهت بسیار زیادی بین ژن bor و iss (نزدیک به 92%) نشان از همولوژی این ژن‌ها داشت. افزون بر این، آنالیز تشابه بین گونه‌های مختلف باکتری، پلازمیدها و باکتریوفاژهای آن‌ها با ژن bor نشان داد که بیشترین تشابه با O78:K80 به ترتیب مربوط به Paracoccidioides brasiliensis، پلازمید Bacillus thuringiensis CT43 و پلازمید S. enterica subsp. enterica serovar Kentucky str .CVM29188 بود. به طور کلی، نتایج این مطالعه نشان از وجود ژن bor در جداییه‌های ایران داشت و همچنین توالی، ارتباط فیلوژنی و تشابه باکتری E. Coli سویه X1378 جدا شده از کولی-باسیلوز طیور در ایران را مشخص نمود. | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| E. Coli, کولی‌باسیلوز, طیور, شناسایی | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 19 |
||
