| تعداد نشریات | 282 |
| تعداد نشریات سازمان | 80 |
| تعداد شمارهها | 3,219 |
| تعداد مقالات | 35,690 |
| تعداد مشاهده مقاله | 53,560,170 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 92,840,567 |
بررسی تنوع ژنتیکی جمعیتهای گونه (Tanacetum polycephalum) آذربایجانغربی با استفاده از نشانگر مولکولی ISSR | ||
| تحقیقات ژنتیک و اصلاح گیاهان مرتعی و جنگلی ایران | ||
| مقاله 11، دوره 26، شماره 2 - شماره پیاپی 52، دی 1397، صفحه 268-278 اصل مقاله (265.56 K) | ||
| نوع مقاله: مقاله علمی - پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/ijrfpbgr.2018.117965 | ||
| نویسندگان | ||
| مهران مجرد* 1؛ سیاوش حسینی سرقین2؛ علی سنبلی3؛ رضا حیدری4 | ||
| 1نویسنده مسئول، دانشجوی دکتری، گروه زیست شناسی، دانشکده علوم، پردیس دانشگاهی دانشگاه ارومیه، ارومیه پست الکترونیک: gmail.com@Mojarrad2017 | ||
| 2استادیار، گروه زیستشناسی، دانشکده علوم، دانشگاه ارومیه، ارومیه | ||
| 3دانشیار، پژوهشکده گیاهان و مواد اولیه دارویی، دانشگاه شهید بهشتی، تهران | ||
| 4استاد، گروه زیستشناسی، دانشگاه غیرانتفاعی صبا، ارومیه | ||
| چکیده | ||
| DOR: 98.1000/1735-0891.1397.2.268.52.26.1576.82 گونه Tanacetum polycephalum متعلق به قبیله بابونه از تیره کاسنی (Asteraceae-Anthemideae) و یکی از گونههای مرتعی با پراکنش وسیع در شمالغرب، شرق و مرکز ایران است که از تنوع مورفولوژیکی بالایی برخوردار است. هدف از این مطالعه بررسی تنوع ژنتیکی 20 جمعیت از گونه مذکور در آذربایجانغربی با استفاده از نشانگر مولکولی ISSR بود. از 14 نشانگر ISSR مورد استفاده 10 نشانگر چند شکلی بالاتری داشتند و بر اساس وجود یا عدم وجود باند امتیازدهی شدند. در مجموع 208 باند تکثیر شد که تعداد آنها از 15 (برای نشانگر 24IS) تا 28 (برای نشانگر 20IS) متغیر و میانگین باندهای تولید شده 8/20 بود. از نظر درصد باندهای چندشکل (%P) نشانگرهای IS8، IS1 ،IS10، IS13 و IS20 بیشترین درصد (100) و نشانگر IS24 کمترین درصد (80) را نشان داد و میانگین درصد چندشکلی برای کل نشانگرها 03/96 درصد بود. میانگین محتوای اطلاعات چند شکلی (PIC)، قدرت تفکیک (RP)، نسبت سهم مؤثر (EMR) و شاخص نشانگر (MI) بهترتیب برابر با 30/0، 06/6، 5/19 و 13/6 بهدست آمد. در مجموع نشانگرهای IS8، IS1 و IS10 مؤثرترین نشانگر در بررسی تنوع جمعیتهای گونه مورد مطالعه بودند.گروهبندی حاصل از تجزیه خوشهای نشان داد که جمعیتها در دو گروه و چهار زیرگروه قرار گرفتند و جمعیتهای جمعآوری شده از یک منطقه در گروهها و زیرگروههای مشابه قرار گرفتند؛ ازاینرو ارتباط نزدیکی بین مناطق جغرافیایی و تنوع زنتیکی وجود داشت. به این ترتیب شرایط جغرافیایی و اقلیمی میتواند یکی از عوامل تنوع بالای جمعیتها باشد. | ||
| کلیدواژهها | ||
| آذربایجانغربی؛ تجزیه خوشهای؛ نشانگر ISSR؛ Tanacetum polycephalum | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| Genetic variability of Tanacetum polycephalum populations in West Azarbaijan using ISSR molecular markers | ||
| نویسندگان [English] | ||
| M. Mojarrad Ashenaabad1؛ S. Hosseini Sarghein2؛ A. Sonboli3؛ R. Heidari4 | ||
| 1PhD Student, Department of Biology, Faculty of Science, Urmia University Pardis, Urmia University, Urmia, I.R. Iran. Email: Mojarrad2017@gmail.com | ||
| 2Corresponding author, Assist. Prof, Department of Biology, Faculty of Science, Urmia University, Urmia, I.R. Iran. | ||
| 3Assoc. Prof., Department of Biology, Medicinal Plants and Drugs Research Institute, Shahid Beheshti University, Tehran, I.R. Iran. | ||
| 4Prof., Saba Nonprofit University, Urmia, I.R. Iran. | ||
| چکیده [English] | ||
| DOR: 98.1000/1735-0891.1397.2.268.52.26.1576.82 Tanacetum polycephalum from Anthemideae tribe of Asteraceae family is a rangeland species with high morphological diversity and vast dispersal in Northwest, East and centre parts of Iran. The purpose of this research was studying genetic diversity of 20 populations of T. polycephalum in West Azarbayjan using ISSR molecular marker. Ten ISSR primers out of 14 primers could be scored based on presence or absence of each band. Over all 208 bands were produced .The range number of bands was between 15(IS24) to 28 (IS20) and the average was 20.8. Regarding the polymorphism bands percentage, IS8, IS1, IS10, IS13, IS20 markers had high percentage (100) and IS24 marker had the lower percentage (80) and mean percentage of polymorphism of the primers was %96.03. PIC, RP, EMR and MI means were 0.30, 6.06, 19.5 and 6.13 respectively. Over all the most effective markers were IS8, IS1 and IS10. Results of cluster analysis revealed the grouping of studied populations in 2 main and 4 subgroups, in which the different populations collected from the same locality were located in the same group. Therefore, a close relationship was characterized between geographic location and genetic diversity and it may be concluded that geographic and climatic factors could be one of the responsible main factor for genetic diversity. | ||
| کلیدواژهها [English] | ||
| cluster analysis, ISSR marker, Tanacetum polycephalum, West Azarbaijan | ||
| مراجع | ||
|
- Aghaei, M., Darvishzadeh, R. and Hassani, A. 2012. Molecular characterisation and similarity relationships among Iranian basil (Ocimum basilicum L.) accessions using inter simple sequence repeat markers. Revista Ciencia Agronomica, 43: 312-320. - Ahmadi, H., Rahimmalek, M. and Zeinali, H., 2014. Assessment of the genetic variation of chamomile (Matricaria chamomilla L.) populations using phytochemical, morphological and ISSR markers. Biochemical Systematics and Ecology, 54: 190–197. - Ahmadi, M., Modarrea-Sanavy, S.A.M., Kafi, M. and Sefidkon, F., 2015. Evaluation of genetic diversity in several populations of medicinal plants Nowruzak (Salvia leriifolia) using ISSR markers. Iranian Journal of Rangelands and Forest Plant Breeding and Genetic Reseaerch, 23(1): 1-12(In Persian). - Amiri, H., 2007. Chemical composition, antibacterial and antioxidant activity of the essential oil of Tanacetum polycephalum Schutz. Bip. International Journal of Botany, 3:321–324. - Arif, I.A., Khan, H.A., Shobrak, M., Al Homaidan, A.A., Al Farhan, A.H. and Al Sadoon, M., 2010. Measuring the genetic diversity of Arabian Oryx using microsatellite markers: implication for captive breeding. Genes & Genetic Systems, 85:141–145. - Baliyan, D., Sirohi, A., Kumar, M., Kumar, V., Malik, S., Sharma, S. and Sharma, S., 2014. Comparative genetic diversity analysis in chrysanthemum: A pilot study based on morpho-agronomic traits and ISSR markers. Scientia Horticulturae, 167: 164–168. - Clasen, B.M., Moss, N.G., Chandler, M.A. and Smith, A.G., 2011. A preliminary genetic structure study of the non-native weed, common tansy (Tanacetum vulgare). Canadian Journal of Plant Sciences, 91: 717–723. - Dastmalchi, T., Omidi, M., Torabi, S., Madah-Arefi, H., Etminan, A., Hasani, M.H. and Behzadi-Rad, M., 2011.Valuating genetic diversity in medicinal plant Althaea & Alcea spp L.with molecular marker of AFLP. Novin Genetics, 6:79- 87 - Gharibi, Sh., Rahimmalek, M., Mirlohi, A., Majidi, M. M. and Tabatabaei, B. E. S. 2011. Assessment of genetic diversity in Achillea millefolium subsp. millefolium and Achillea millefolium subsp. elbursensis using morphological and ISSR markers.Journal of Medicinal Plants Research, 5: 2413–2423. - Ghasemi Pirbalouti, A., Bahmani, M. and Avijgan, M., 2009. Anti-Candida activity of some of the Iranian medicinal plants. Electronic Journal of Biology, 5: 85–88. - Javidnia, K., Miri, R., Soltani, M. and Khosravi, A.R., 2008. Composition of the essential oil of Tanacetum polycephalum Schultz Bip. subsp. farsicum Podl. Journal of Essential Oil Research, 20:209–211. - Hadian, J., Karimi, A., Azizi, A. and Khadivi-Khube, A., 2015. Ubiqutous genetic diversity among and within wild populations of Satureja rechingeri assessed with ISSR markers. Plant Systematic and Evolution. 301:923-930. - Houri, M. and Ferchichi, A., 2008. Study of genetic polymorphism of Artemisisa herba – alba from Tunisia using ISSR markers. African Journal of Biotechnology, 7: 44-50. - Kumar, M., Mishra, G. P., Singh, R., Kumar, J., Naik, P K. and Singh, Sh. B., 2009. Correspondence of ISSR and RAPD markers for comparative analysis of genetic diversity among different apricot genotypes from cold arid deserts Marianum L.). Iranian Journal of Medicinal and Aromatic Plants, 24: 278–292. - Liu, J., Wang, L., Geng, Y., Wang, Q., Luo, L. and Zhong Y., 2006. Genetic diversity and population structure of Lamiophlomis rotate (Lamiaceae), an endemic species of Qinghai-Tibet Plateau. Genetica, 128:385–394. - Mahdavi, M., Jouri, M., Mahmoudi, J., Rezazadeh, F. and Mahzooni-Kachapi, S. 2013. Investigating the altitude effect on the quantity and quality of the essential oil in Tanacetum polycephalum Sch.-Bip. In the Baladeh region of Nour, Iran. Chinese Journal of Natural Medicines, 11: 553–559. - Malekpoor, F., Ghasemi Pirbalouti, A., Salimi, A., Shabani, L., Sharifi, M. and Hamedi, B., 2015. Antimicrobial and antioxidant activities and total phenolic content of Tanacetum polycephalum Schutz.Bip. as a folkloric herb in South western Iran. Indian Journal of Traditional Knowledge, 14: 370–375. - Mohammad Shafie, B. Shafie., Sayed, M. Zain Hasan., Abdullah, M. Zain. and Ramisah, M. Shah. 2011. RAPD and ISSR markers for comparative analysis of genetic diversity in wormwood capillary (Artemisia capillaris) from Negeri Sembilan, Malaysia. Journal of Medicinal Plants Research, 5: 4426–4451. - Prevost, A. andWilkinsonM. J., 1999. A new systemofcomparing PCRprimers applied toISSR fingerprintingof potato cultivars. TheoreticalandApplied Genetics, 98: 107–112. - Rezaee, M.B., Jaimand, K. and Naderi, M., 2012. Chemical composition of the essential oil of Tanacetum polycephalum subsp. polycephalum from different locations of Azerbaijan Province, Iran. Journal of Medicinal Plants and By-products, 1: 71–74. - Sonboli, A., Stroka, K., Kazempour Osaloo, Sh. and Oberprieler, Ch., 2012. Molecular phylogeny and taxonomy of Tanacetum L. (Compositae, Anthemideae) inferred from nrDNA ITS and cpDNA trnH–psbA sequence variation. Plant Systematics and Evolution, 298: 431–444. - Tagizad, A., Ahmadi, J., Haddad, R. and Zarrabi, M., 2010. A comparative analysis of ISSR and RAPD markers for studying genetic diversity in Iranian pistachio cultivars. Iranian Journal of Genetics and Plant Breeding, 1: 6–16. - Varshney, R.K., Chabane, K., Hendre, P.S., Aggarwal, R.K. and Graner, A., 2007. Comparative assessment of EST-SSR, EST-SNP and AFLP markers for evaluation of genetic diversity and conservation of genetic resources using wild, cultivated and elite barleys. Plant Science, 173:638–649. - Wang, K., Kang, J., Zhou, H., Sun, Y., Yang, Q., Dong, J. and Meng, L., 2009. Genetic diversity of Iris lactea var. chinesis germplasm detected by inter-simple sequence repeat (ISSR). African Journal of Biotechnology, 8: 4856–4863. - Zhao, K.G., Zhou, M.Q. and Chen, L.Q., 2007. Genetic diversity and discrimination of Chimonanthus praecox (L.) Link germplasm using ISSR and RAPD markers. Horticulture Science, 42: 1144–1148. | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 619 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 591 |
||