آمار
| تعداد نشریات | 270 |
| تعداد نشریات سازمان | 68 |
| تعداد شماره‌ها | 1,452 |
| تعداد مقالات | 16,967 |
| تعداد مشاهده مقاله | 9,873,836 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 6,619,274 |
Development and evaluation of Real-Time RT-PCR test for Quantitative and Qualitative Recognition of current H9N2 Subtype Avian Influenza Viruses in Iran | ||
| Archives of Razi Institute | ||
| مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده ، انتشار آنلاین از تاریخ 18 اردیبهشت 1397 | ||
| نوع مقاله: Original Articles | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/ari.2017.106968.1059 | ||
| نویسنده | ||
Seyed Gholamreza Mirzaei 
| ||
| موسسه رازی | ||
| چکیده | ||
| Avian influenza H9N2 subtype viruses have had a great impact on Iranian industrial poultry production economy since introduction in the country. To approach Rapid and precise identification of this viruses as control measures in poultry industry, a real time probe base assay was developed to directly detect a specific influenza virus of H9N2 subtype -instead of general detection of Influenza A viruses- which has been endemic over two last decades in the country. An Iranian avian influenza virus strain of A/Iran/chicken/772/1998 H9N2 subtype were selected as reference strain for of primers and probe designing. The high agreement value of 99% indicated that the devolved real time assay for detection of H9 subtype viruses could easily replace the conventional method of virus isolation particularly in investigation of viruses like national surveillance plan. The limit of detection was almost one EID50 which was the least real infectious unit could be detected. So it can be said that this sensitive assay provided a powerful tool to not to miss any significant viral biological activity neither in the host body nor in the environment. A high level of correlation coefficient (R2 = 0.998) also indicated a good correlation between Ct values and viral concentrations. , it can be conclude that the real time RT-PCR could be easily replace virus isolation in detection of H9N2 influenza viruses especially in large monitoring program. The ability in quantifying of the virus concentration extends usage of test in more accurate studies. | ||
| کلیدواژه ها | ||
| Real-Time RT- PCR؛ Avian influenza؛ Comparison؛ H9N2؛ culture | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| تشخیص کمی و کیفی ویروس آنفولانزای پرندگان ساب تایپ H9N2 با روش واکنش پلیمراز در زمان واقعی در ایران | ||
| نویسندگان [English] | ||
| سید غلامرضا میرزایی | ||
| چکیده [English] | ||
| ویروس های آنفلوآنزای طیور تحت تیپ H9N2 از هنگام ورود به کشور خسارات اقتصادی بزرگی را در کشور باعث شده اند. تعیین هویت سریع و دقیق این ویروس به همراه دیگر روش های کنترلی مهمترین ابزار برای برای جلوگیری از بیماری و گسترش ویروس است. برای رسیدن به این منظور یک روش واکنش پلیمراز در زمان واقعی بر اساس طراحی پرایمر و پروب جهت تشخیص اختصاسی ویروس های آنفلوآنزای طیور تحت تیپ H9N2 راه اندازی شد. برای جلوگیری از آلودگی تصمیم گرفته شد که واکنش به صورت یک مرحله ای انجام شود. برای طراحی پرایمر و پروب از یک سویه ایرانی ویروس به نام A/Iran/chicken/772/1998 بعنوان سویه مرجع استفاده شد. دز عفونی قابل تشخیص در این روش تقریبا مقدار یک دز عفونی بود که حداقل مقدار قابل تشخیص است. بنابراین می توان گفت این روش حساس ابزار قدرتمندی فراهم می آورد تا حداقل مقدار بیولوژیکی موثر از ویروس، چه در محیط و چه در بدن میزبان، شناسایی شود. ضریب هبستگی بال (R2 = 0.998) نشان دهنده ارتباط خوب بین سیکل آستانه (ct) و غلظت های ویروسی است. همچنین با توجه به توافق93 درصدی، روش واکنش پلی مراز درزمان واقعی به آسانی می تواند در مطالعات ویروسی مانند برنامه های مراقبت ملی جایگزین روش جداسازی ویروس گردد. قدرت تعیین کمیت ویروس در این روش امکان استفاده آن را به مطالعات دقیق تر گسترش می دهد. | ||
| کلیدواژه ها [English] | ||
| آنفولانزای پرندگان ، H9N2, کشت ، مقایسه, Real-time RT-PCR | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 37 |
||
