| تعداد نشریات | 282 |
| تعداد نشریات سازمان | 80 |
| تعداد شمارهها | 3,168 |
| تعداد مقالات | 35,197 |
| تعداد مشاهده مقاله | 50,932,431 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 90,937,937 |
چندشکلی تکنوکلئوتیدی ناحیه پروموتور ژن TFAM و ارتباط آن با صفات رشد در گاو سیستانی | ||
| علوم دامی | ||
| مقاله 7، دوره 30، شماره 114، خرداد 1396، صفحه 65-76 اصل مقاله (997.21 K) | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/asj.2017.111312 | ||
| نویسندگان | ||
| حسین مرادقلی1؛ غلامرضا داشاب* 2؛ مهدی وفای واله3 | ||
| 1دانش آموخته کارشناسی ارشد ژنتیک و اصلاح دام، گروه علوم دامی، دانشگاه زابل | ||
| 2استادیار ژنتیک و اصلاح دام، گروه علوم دامی، دانشگاه زابل. | ||
| 3استادیار ژنتیک و اصلاح دام، گروه علوم دامی، دانشگاه زابل | ||
| چکیده | ||
| گاو سیستانی نژاد گوشتی و از ذخایر ژنتیکی باارزش کشور است که از لحاظ تولید گوشت، کمیت و کیفیت لاشه و بازده غذایی مناسب است. در پژوهش حاضر به منظور بررسی چندشکلی ژن TFAM (Mitochondrial transcription factor A) با استفاده از PCR-RFLP، از 150 رأس گاو سیستانی به صورت تصادفی و انفرادی خونگیری از ورید گردنی انجام گرفت. سپس نمونههای خون دامها با روش شستشوی نمکی بهینه شده استخراج وکیفیت آنها با الکتروفورز ژل آگارز 1 درصد بررسی گردید. ناحیه پروموتور جایگاه TFAM به طول bp801 با روشPCR تکثیر و محصول PCR توسط آنزیمBsuRI برش داده شد. محصولات هضم شده توسط الکتروفورز با ژل آگارز 3 درصد و رنگ آمیزی اتیدیوم بروماید نمایانسازی گردید. با توجه به این که آنزیم برشی مذکور در قطعه تکثیر شده دارای چندین سایت برشی میباشد، نتایج الگوی هضمی در حیوانات هموزیگوت (AA) سه باند با اندازه 152، 187 و 462 جفت باز، در حیوانات هموزیگوت (CC) چهار باند با اندازه 83، 104، 152 و 462 جفت باز و نهایتاً در حیوانات هتروزیگوت (AC) پنچ باند با اندازههای 83، 104، 152، 187 و 462 جفت باز مشاهده گردید. دادههای آماری با استفاده نرم افزار POPGENE3.2 مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. جمعیت در جایگاه TFAM انحراف از تعادل هاردی- واینبرگ را نشان داد(05/0>P). شاخص شانون(I)، شاخص نئی، هتروزیگوسیتی مشاهده شده و هتروزیگوسیتی مورد انتظار به ترتیب، 69، 49، 37، 50 درصد محاسبه شد. در مطالعه حاضر ارتباط معنیداری بین ژنوتیپهای گاو سیستانی در جایگاه ژنTFAM با صفات رشد مشاهده نشد. | ||
| کلیدواژهها | ||
| گاو سیستانی؛ صفات رشد؛ افزایش وزن؛ ژن TFAM | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| Polymorphism of TFAM gene and its association with growth traits in Sistani cattle | ||
| نویسندگان [English] | ||
| Hossein Moradgholi1؛ Gholam Reza Dashab2؛ Mehdi Vafa Valleh3 | ||
| 1MS.c of Animal Breeding and Genetics . University of Zabol | ||
| 2Assistant professor of animal science | ||
| 3Assistant Professor, Animal Breeding and Genetics, University of Zabol | ||
| چکیده [English] | ||
| Sistani beef cattle is a native breed of east of Iran that as a valuable genetic resource in the tropical area could be good a candidate to produce high quantity of muscular carcass portions with high efficiency. In order to explore the Mitochondrial transcription factor A gene (TFAM) polymorphisms using PCR-RFLP, 150 Sistani cows were randomly selected and then blood samples were taken from the jugular vein of each animal individually. Thereafter, blood samples were salting-out and electrophoresed with 1% agarose gel. The position of the TFAM promoter region amplified by PCR and PCR products with 801bp length were sliced by BsuRI enzyme. Digestion products on 3% agarose gel were shown by electrophoresis and staining with ethidium bromide. The patterns of digestion in AA homozygotes, CC homozygotes, and AC heterozygotes were as follows: three bands with 152, 187, and 462bp; four bands with 83, 104, 152, and 462bp; and five bands with 83, 104, 152, 187, and 462bp, respectively. The results showed that the position of TFAM population deviated from the Hardy-Weinberg equilibrium (P <0.05). Shannon index (I), Nei index, observed heterozygosity, and expected heterozygosity were 0.69, 0.49, 0.37, and 0.50, respectively. In conclusion, no significant differences between genotypes of Sistani cattle were observed for TFAM gene polymorphism and growth traits. | ||
| کلیدواژهها [English] | ||
| Sistani cattle, Growth traits, Daily gain, TFAM gene | ||
| مراجع | ||
|
بیرجندی، م. ر. (1376). بررسی وضعیت پرورش و تعیین توان تولید شیر و خصوصیات شیرواری گاو سیستانی در منطقه سیستان. چکیده طرحهای تحقیقاتی وزارت جهاد سازندگی (جلد دوم). ص 368-370. وزارت جهاد سازندگی. Ahmetov, I. I., Popov D. V., Missina S. S., Vinogradova O. L. and Rogozkin V. A. (2010). Association of Mitochondrial Transcription Factor (TFAM) gene polymorphism with physical performance in Athletes. Human Physiology. 36: 229–233.
Amaral A., Ramalho-Santos J. and John J. C. (2007). The expression of polymerase gamma and mitochondrial transcription factor A and the regulation of mitochondrial DNA content in mature human sperm. Human Reproduction. 22: 1585-1596.
Ayres D. R., Souza F. R. P., Mercadante M. E. Z., Fonseca L. F. S., Tonhati H., Cyrillo J. N. S. G., Bonilha S. F. M. and Albuquerque L. G. (2010). Evaluation of TFAM and FABP4 gene polymorphisms in three lines of Nellore cattle selected for growth. Genetics and Molecular Research. 9:2050-2059.
Beltinger C., Fulda S., Kammertoens T., Uckert A. and Debatin K. M. (2000). Mitochondrial Amplification of Death Signals Determines Thymidine Kinase. Ganciclovir-triggered Activation of Apoptosis. 60:3212-3217.
Botstein D., White R. L., Skolnick M. and Davis R. W. (1980). Construction of a genetic-linkage map using restriction fragment length polymorphisms. American Journal of Human Genetic. 32: 314-331.
Chan D. C., Ngo H. B. and Kaiser J. T. (2012). TFAM, a mitochondrial transcription and packaging factor, imposes a U-turn on mitochondrial DNA. Nature Structure Molecular Biology.18: 1290-1296.
Clayton D. A. (2000). Transcription and replication of mitochondrial DNA. Human Reproduction.15: 11-17.
Dimauro S. and Schon E. A. (2001). Mitochondrial DNA genetic pandoras. American Journal of Medical Science. 16: 103-116.
Fisher R. P. and Clayton D. A. (1988). Purification and characterization of human mitochondrial transcription factor 1. Molecular Cell Biology. 8: 3496-509.
Jiang Z., Kunej T., Michal J. J., Gaskins C. T., Reeves J. J., Busboom J. R., Dove P. and Wright-RW J. R. (2005). Significant associations of the mitochondrial transcription factor A promoter polymorphisms with marbling and subcutaneous fat depth in Wagyu x Limousin F2 crosses. Biochemical Biophysical Research Communication. 334: 516-523.
Jothi M. P. (2008). Genetic distance and phylogenic inference. Course notes, University of Putra, Malaysia.
Kaplanová K., Dvořák J. and Urban T. (2009). Association of single nucleotid polymorphisms in TG, LEP and TFAM genes with carcass traits cross-breed cattle. Biologie Zivacichu. 4: 647-651.
Kunej T., Wu X. L., Michal J. J., Berlic T. M. Jiang Z. and Dovc P. (2009). The Porcine Mitochondrial Transcription Factor a Gene: Molecular Characterization, Radiation Hybrid Mapping and Genetic Diversity among 12 Pig Breeds. American Journal of Animal and Veterinary Science. 7: 129-135.
SAS Institute Inc, Statistics.(System for Mixed Models. (2009). SAS Institute Inc., Cary. NC. USA. sasdof@wnt.sas.com.
Wilson D. E., Rouse G. H., Graser G. H. and Amim V. (1998). Prediction of carcass traits using live animal ultrasound. In: Beef Research Report. Amsterdam Iowa State University, 7: 1-7.
Woodward B. (2008). Polymorphisms in mitochondrial transcription factor A (“TFAM”) gene and their associations with carcass traits. Patent Application Publication. 56: 1-56.
Yeh F. C., Yang R. C. and Boyle T. (1999). Popgene version 1.31. Microsoft window-based freeware for population genetic analysis. University of Alberta and Centre for International Forestry Research. In Water Catchments Systems. 416-432 pp. | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 964 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 674 |
||