| تعداد نشریات | 286 |
| تعداد نشریات سازمان | 84 |
| تعداد شماره‌ها | 3,019 |
| تعداد مقالات | 33,734 |
| تعداد مشاهده مقاله | 44,973,285 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 46,423,416 |
بررسی تنوع ژنتیکی جدایه های قارچ Fusarium verticillioides (Sacc.) Nirenberg، عامل پوسیدگی بلال ذرت با استفاده از نشانگرهای AFLP | ||
| نهال و بذر | ||
| مقاله 7، دوره 24، شماره 3، شهریور 1387، صفحه 457-476 اصل مقاله (359.48 K) | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/spij.2017.110831 | ||
| نویسندگان | ||
| وحید ره جو* ؛ سیدجواد زاد؛ محمد جوان نیکخواه؛ محمدرضا بی همتا؛ سیدمحمود اخوت؛ امیر میرزادی گوهری؛ عبدالحمید الامین؛ سونیا س. کلمسدال | ||
| چکیده | ||
| تعداد 108 جدایه قارچ Fusarium verticillioided عامل بیماری پوسیدگی فوزاریومی بلال ذرت که از نمونه های به دست آمده از مناطق مختلف جغرافیایی و ذرت خیر ایران در سال 1384 جداسازی شده بودند به همراه دو جدایه استاندارد این قارچ از آفریقای جنوبی با استفاده از نشانگرهای AFLP ارزیابی شدند. پس از استخراج DNA جدایه ها، از آنزیم های برشی EcoRI و MseI برای برش استفاده شد و قطعات برش یافته به آداپتورهای دو رشته ای اختصاصی اتصال یافتند. محصولات PCR اولیه پس از رقیق شدن با به کارگیری پنج ترکیب آغازگر از آغازگرهای انتخابی EcoRI نشاندار شده با فسفر 33 و MseI در یک واکنش انتخابی PCR استفاده شدند و در نهایت محصولات تکثیری با استفاده ژل پلی آکریل آمید %5 تفکیک شدند. پس از امتیازدهی الگوهای نواری حاصل به روش مشاهده ای، گروه بندی جدایه ها با استفاده از ضریب شباهت دایس و الگوریتم UPGMA انجام شد. از تجزیه به مختصات اصلی نیز بعنوان روش مکمل تجزیه خوشه ای استفاده شد. بر اساس دندروگرام حاصل از تعداد 98 نشانگر چند شکل، 110 جدایه F. verticillioides به هشت گروه انگشت نگاری مجزا (A-H) منتسب شدند که گروه انگشت نگاری A با 98 عضو بزرگ ترین گروه ژنتیکی و بقیه گروه ها بین یک تا سه عضو را شامل شدند. بر اساس نتایج تجزیه واریانس مولکولی (AMOVA) تنوع ژنتیکی در بین افراد هر جمعیت زیاد و بین جمعیت ها پایین ارزیابی شد که علت آن را شاید بتوان به عوامل موثر در تغییرپذیری ژنتیکی نظیر جهش و مهاجرت ژن یا ژنوتیپ در اثر عوامل مختلف نسبت داد. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| ذرت؛ تنوع ژنتیکی؛ تجزیه خوشه ای؛ Fusarium verticillioides؛ AFLP | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| Study of Genetic Variation in Isolates of Fusarium verticillioides (Sacc.) Nirenberg, the Causal Agent of Fusarium Ear Rot of Corn Using AFLP Markers | ||
| نویسندگان [English] | ||
| V. Rahjoo؛ J. Zad؛ M. Javan-Nikkhah؛ M.R. Bihamta؛ S.M. Okhovvat؛ A. Mirzadi Gohari؛ A. Elameen؛ S. S. Klemsdal | ||
| چکیده [English] | ||
| One hundred and eight isolates of Fusarium verticillioides, the causal agent of fusarium ear rot of corn collected from different geographic regions of Iran during growing season in 2005, and two standard tester isolates of F. verticillioides obtained from South Africa were chosen to be analyzed by AFLP markers to determine their genetic diversity. Total DNA of each isolate was extracted and digested by EcoRI and MseI endonuclease restriction enzymes and then digested fragments were ligated to site-specific double strands adapters. The products of a PCR reaction with non-selective primers were diluted and used in a selective PCR reaction applying five primer-pair combinations of MseI and P33 radioisotope labeled EcoRI. The final products of selective PCR were loaded and separated on a 5% polyacrylamide gel. The 98 polymorphic bands were scored manually and the dendrogram generated by UPGMA method based on Dice similarity coefficient as well as principal coordinate analysis (PCoA), grouped all of the F.verticillioides isolates into eight major clusters (A-H). The fingerprint group A with 98 members was the largest group and the other groups contained between one to three members. Based on the results of analysis of molecular variance (AMOVA) high genetic diversity was observed within each population and low genetic diversity was observed among all populations which it may be due to some variation factors such as mutation and gene or genotype flow | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| Corn, Genetic diversity, cluster analysis, Fusarium verticillioides, AFLP | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 383 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 314 |
||