| تعداد نشریات | 282 |
| تعداد نشریات سازمان | 80 |
| تعداد شمارهها | 3,186 |
| تعداد مقالات | 35,332 |
| تعداد مشاهده مقاله | 51,393,684 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 91,299,047 |
بررسی تنوع ژنتیکی اکوتیپهای مریم نخودی (Teucrium polium) با استفاده از نشانگر مولکولی ISSR | ||
| تحقیقات ژنتیک و اصلاح گیاهان مرتعی و جنگلی ایران | ||
| مقاله 11، دوره 25، شماره 1 - شماره پیاپی 49، خرداد 1396، صفحه 135-137 اصل مقاله (320.04 K) | ||
| نوع مقاله: مقاله علمی - پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/ijrfpbgr.2017.109827 | ||
| نویسندگان | ||
| سعید اسفندیاری1؛ محسن فرشادفر* 2؛ هوشمند صفری3؛ هومن شیروانی4؛ صادق اسفندیاری5 | ||
| 1کارشناس ارشد اصلاح نباتات دانشگاه آزاد اسلامی واحد کرمانشاه | ||
| 2دانشگاه پیام نور استان کرمانشاه | ||
| 3عضو هیات علمی بخش تحقیقات جنگلها و مراتع، مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی استان کرمانشاه، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرمانشاه، ایران. | ||
| 4مدرس گروه کشاورزی دانشگاه پیام نور | ||
| 5کارشناس ارشد بخش تحقیقات جنگلها و مراتع، مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی استان کرمانشاه، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرمانشاه، ایران | ||
| چکیده | ||
| مریم نخودی گیاهی است از خانواده نعناعیان و کاربرد وسیعی در صنعت داروسازی دارد. تنوع ژنتیکی 17 اکوتیپ مریم نخودی جمعآوری شده از سراسر استان کرمانشاه با استفاده از نشانگر مولکولی ISSR مورد بررسی قرار گرفت. از 15 آغازگر ISSR استفاده شد که از میان آنها 12 عدد دارای نوارهای قابل امتیازدهی بودند. آغازگرهای ISSR در مجموع توانستند 82 نوار تولید کنند، که 80 باند چند شکل مشاهده شد. میانگین تعداد نوار تولید شده توسط هر آغازگر برای 17 اکوتیپ برابر 83/6 بود. آغازگر IS6 بیشترین تعداد نوار (12 نوار) و آغازگر IS3 کمترین تعداد نوار (4 نوار) را نشان دادند. نشانگر ISSR در بین اکوتیپها چندشکلی مطلوبی نشان داد و تمام آغازگرها برای بررسیهای گونه مریم نخودی مناسب بودند. نتایج نشان داد که اکوتیپ 1G (صحنه) بیشترین فاصله ژنتیکی را با اکوتیپهای 12 G(صحنه)، 7 G(گیلان غرب)، 13G (ثلاث) و 8G (دالاهو) داشت. گروهبندی حاصل از تجزیه خوشهای نشان داد که اکوتیپها در چهار گروه قرار گرفته و تنوع ژنتیکی با تنوع جغرافیایی تطابق نداشت. همچنین نتایج حاصل از گروهبندی با استفاده از تجزیه واریانس مولکولی (AMOVA) و تجزیه به مختصات اصلی (PCo) تأیید شد. | ||
| کلیدواژهها | ||
| مریم نخودی؛ تجزیه خوشهای؛ تجزیه واریانس مولکولی؛ تجزیه به مختصات اصلی | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| Genetic variability of Teucrium polium ecotypes using ISSR molecular markers | ||
| نویسندگان [English] | ||
| S. Esfandyari1؛ M. Farshadfar2؛ H. Safari3؛ H. Shirvani4؛ S. Esfandiari5 | ||
| 1.Sc. Islamic Azad University, Kermanshah, I.R. Iran | ||
| 3Faculty member of Research Department of Forests and Rangelands, Kermanshah Agricultural and Natural Resources Research and Education Center. I.R. Iran | ||
| 4Department of Agriculture, Payame Noor University, I.R. Iran | ||
| 5Faculty member of Research Department of Forests and Rangelands, Kermanshah Agricultural and Natural Resources Research and Education Center. I.R. Iran | ||
| چکیده [English] | ||
| Golden germander (Teucrium polium L.) is an important medicinal plant of the Labiatae family. Genetic variability was studied on 17 ecotypes of Teucrium polium collected from Kermanshah, Iran, based on ISSR molecular markers. Twelve ISSR primers out of 15 primers could be scored. ISSR primers produced 82 bands, of which polymorphism was observed on 80 bands. Average number of bands was 6.83 for each primer. Primer IS6 showed the highest number of bands (12 bands) and IS3 showed the lowest number of bands (4 bands). The results indicated that ecotype G1 had the most genetic distance with G12, G7, G13 and G8. Based on cluster analysis the ecotypes were grouped into four clusters. Genetic diversity of ecotypes did not match with the geographical diversity of the ecotypes. Also results of grouping by analysis of molecular variance (AMOVA) and coordinate analysis (PCo) were confirmed. | ||
| کلیدواژهها [English] | ||
| Analysis of molecular variance, coordinate analysis, cluster analysis, Teucrium polium | ||
| مراجع | ||
|
- Altıntas, S., Toklu, F., Kafkas, S., Kilian, B., Brandolini, A. and Zkan, H.O. 2008. Estimating Genetic Diversity in durum and bread wheat cultivars from Turkey Using AFLP and SAMPL markers. Plant Breeding, 127: 9-14. - Archak, S., Gaikwad, A.B., Gautam, D., Rao, E.V.V.B., Swamy, K.R. M. and Karihaloo, J. L., 2003. Comparative assessment of DNA fingerprinting techniques (RAPD, ISSR and AFLP) for genetic analysis of cashew accession in India. Genome, 46: 362-369. - Chawla, H S., 2000. Introduction to Plant Biotechnology. Science Publishers Inc. USA. - Excoffier, L., Smouse, P. E. and Quattro, J. M., 1992. Analysis of molecular variance inferred from metric distance among DNA haplotypes: application to human mitochondrial DNA restriction data. Genetics, 131: 479-791. - Hou, Y., Yan, Z. and Wei, Y., 2005. Genetic diversity in barely from west China based on RAPD and ISSR analysis barely. Genetics Newsletter, 35:9-22. - Kumar, M., Mishra, G P., Singh, R., Kumar, J., Naik, P K. and Singh, Sh. B., 2009. Correspondence of ISSR and RAPD markers for comparative analysis of genetic diversity among different apricot genotypes from cold arid deserts of Trans-Himalayas. Physiology and Molecular Biology of Plants, 15(3): 225-236. - Mohammadi, S. A. and Prasanna, B. M., 2003. Analysis of genetic diversity in crop plant: Salient statistical tools and considerations. Crop Science, 43: 1235-1248. - Noruzi Gharatape, R., Bernusi, I., Moghadam, A F., Abdollahi Mandulakani. B. and Jafari, M., 2012. Assessment of genetic diversity in different masses of medicinal plant Teucrium polium using ISSR markers. The 12th Iranian Genetics Congress, Tehran, Iran (In Persian). - Pacifico, S., D'Abrosca, B., Scognamiglio, M., D'Angelo, G., Gallicchio, M., Galasso, S., Monaco, P. and Fiorentino, A., 2012. NMR-based metabolic profiling and in vitro antioxidant and hepatotoxic assessment of partially purified fractions from golden germander (Teucrium polium L.) methanolic extract. Food Chem. Dec. 1; 135(3):1957-67. - Pesaraklu, A., Mianabadi, M., Bagherieh Najjar, MB., Sattarian, A. and Baghizadeh, A., 2013. Genetic diversity of different populations of Iranian Teucrium polium L. using RAPD markers. Iranian Journal of Rangelands and Forests Plant Breeding and Genetic Research, 21(1): 24-36 (In Persian). - Powell, W., Morgante, M., Andre, C., Hanafey, M., Vogel, J., Tingey, S. and Rafalski, A., 1996. The comparison of RFLP, RAPD, AFLP and SSR (microsatellite) markers for germplasm analysis. Molecular Breeding, 2: 225-238. - Shokrpour, M., Mohamadi, S.A., Moghadam, M., Ziai S. A. and Javanshir, A., 2008. Analysis if morphologic association, phytochemical and AFLP markers in milk thistle (Silybum marianum L.). Iranian Journal of Medicinal and Aromatic Plants, 24(3): 278-292. - Sicard, D., Nanni, L., Porfiri, O., Bulfon, D., and Papa, R. 2005. Genetic diversity of Phaseolus vulgaris L. and P. coccineus L. landraces in central Italy. Plant Breeding, 124 (5): 464–472. - Surve-Iyer, R. S., Adams, G. C., Lezzon, A. F. and Jones, A. L., 1995. Isozyme detection and variation in Ieucostoma species from prunus and malus. Mycologia, 87: 471- 482. - Tabtib, B., 2014. Assessment of genetic differentiation of two Mediterranean subspecies of Teucrium. Bulletin of the Georgian National Academy of Sciences, 8(1):72-76. - Terzopoulos, P.J. and, Bebeli, P.J., 2008. Genetic diversity analysis of Mediterranean faba bean (Vicia faba L.) with ISSR markers. Field Crops Research, 108:39-44. - Thimmappaiah, W., Santhosh, G., Shobha, D. and Melwyn, G.S., 2008. Assessment of genetic diversity in cashew germplasm using RAPD and ISSR markers. Sciatica Horticulture, 118: 1-7. - Torres, A.M., Weeden, N.F. and Martin, A., 1993. Linkage among isozyme, RFLP and RAPD markers in Vicia faba. Theoretical and Applied Genetics, 85: 935–945. - Zietkiewicz, E., Rafalski, A. and Labuda, D., 1994. Genome fingerprinting by simple sequence repeat (SSR)-anchored polymerase reaction amplification. Genomics, 20: 176-183. - Zinodini, A., Farshadfar, M., Safari, H., Moradi, F. and Shirvani, H., 2013. Study of genetic relationships of some mint species using ISSR markers. Crop Biotechnology, 5: 11-21 (In Persian). | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 924 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 642 |
||