| تعداد نشریات | 286 |
| تعداد نشریات سازمان | 84 |
| تعداد شماره‌ها | 3,019 |
| تعداد مقالات | 33,734 |
| تعداد مشاهده مقاله | 44,973,842 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 46,449,098 |
بررسی خصوصیات ژنتیکی بز مرخز براساس توالی ژن سیتوکروم b | ||
| علوم دامی | ||
| مقاله 12، دوره 29، شماره 113، اسفند 1395، صفحه 135-140 اصل مقاله (677.79 K) | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/asj.2017.109470 | ||
| نویسندگان | ||
| محسن عبدالملکی1؛ کیان پهلوان افشار2؛ حمید رضا سیدآبادی* 3 | ||
| 1فارغ التحصیل کارشناسی ارشد دانشگاه آزاد اسلامی واحد ابهر | ||
| 2استادیار گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد ابهر، زنجان. | ||
| 3موسسه تحقیقات علوم دامی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی. کرج. ایران.. | ||
| چکیده | ||
| حفظ تنوع ژنتیکی در جمعیت بز مرخز به عنوان سرمایه ملی بسیار حائز اهمیت است. بررسی توالی نوکلئوتیدی ناحیه سیتوکروم b میتوکندری در درون جمعیت‌ها می‌تواند شاخص مناسبی از میزان تنوع موجود در جمعیت مورد مطالعه باشد. هدف از این پژوهش، بررسی ژنتیکی و فیلوژنتیکی توالی نوکلئوتیدی ناحیه سیتوکروم b ژنوم میتوکندری بز مرخز است. بدین منظور از 40 رأس بز مرخز نمونه خون جمع‌آوری گردید. پس از استخراج DNA، تکثیر قطعه 892 جفت بازی ناحیه سیتوکروم b میتوکندری توسط آغازگرهای اختصاصی انجام گرفت. قطعات تکثیر شده پس از خالص‌سازی به صورت رفت و برگشت توالی‌یابی شدند. تعداد 4 هاپلوتیپ مختلف بر اساس 4 نوکلئوتید چند شکل تعیین گردید. تنوع هاپلوتیپی و نوکلئوتیدی در نژاد بز مرخز به ترتیب 1/0 و 00239/0 برآورد شد. نتایج فیلوژنتیکی با استفاده از روش UPGM نشان داد، که بز مرخز در گروه مجزا نسبت به سایر نژادهای آسیایی قرار دارد. دلیل این فاصله احتمالا ناشی از فاصلة جغرافیایی زیاد بین محل پراکنش بز مرخز با سایر نژادهای بز می باشد. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| بز مرخز؛ ژنوم میتوکندری؛ سیتوکروم b؛ فیلوژنی | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| The genetic characteristics of Marghos goat based on Cytochrome B gene | ||
| نویسندگان [English] | ||
| M. Abdolmaleki1؛ K. Pahlavan Afshar2؛ hamid reza seyedabadi3 | ||
| چکیده [English] | ||
| Preservation of genetic diversity in population of Marghos goat is very important. Studying cytochrome b region of mitochondrial genome in within breeds can give useful information about genetic diversity of the population. The purpose of current research was genetic and phylogenetic investigation of mitochondrial genome cytochrome b region in Marghos goat. In order to, blood samples were collected from 40 Marghos goats. After extracting DNA, fragment 892 bp of cytochrome b region genome mitochondrial amplified by primers was designed and fragment amplified after purification was sequenced. Four different haplotypes were determined based on four single nucleotide polymorphism sequences. The haplotype and nucleotide diversity were estimated in Marghos goat population 0.1 and 0.00239 respectively. Using the UPGM phylogenetic test results showed that the Marghos goat population is separate group from other Asian goat breeds. The reason for this gap may be due to the geographic distance between the distributions of in Marghos goat with other breeds goats. | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| Cytochrome b, Marghos goat, Mitochondrial genome, phylogeny | ||
| مراجع | ||
|
توکلیان، ج. (1387). نگرشی بر ذخایر ژنتیکی دام و طیور ایران. انتشارات موسسه تحقیقات علوم دامی کشور.ص ص. 205-209. جوانروح علی آباد، ع.(1381). بررسی تنوع ژنتیکی شش توده بز بومی ایران با استفاده از نشانگر RAPD. پایان نامه کارشناسی ارشد. دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس. نژاد گشتی، م. (1383). بررسی مولکولی تعدادی از نشانگرهای ریزماهواره در شش توده بز بومی ایران. پایان نامه کارشناسی ارشد. دانشگاه آزاد اسلامی واحد کرج. Bellagamba, F., Moretti, V.M., Comincini, S. and Valfare, F. (2001). Identification of species in animal Feedstuffs by polymerase chain reaction restriction fragment length polymorphism analysis of Mitochondrial DNA. Journal of Agricultural and Food Chemistry. 49: 3775-3781. Chen, S., Fan, B., Liu, B., Yu, M. and Zhao, S. (2006). Genetic variations of 13 indigenous Chinese goat breeds based on cytochrome b gene sequences. Biochemical Genetics. 44: 87-97. Eyre-walker, A. and Awadalla, P. (2001). Does human mtDNA recombine. Journal of Molecular Evolution. 53: 430-435. Hall, T.A. (1999). BioEdit: A user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT. Nucl Acids Symp Ser. 41: 95–98. Luikart, G., Gielly, L., ExcoYer, L., Vigne, J. D., Bouvet, J. and Taberlet, P. (2001). Multiple origins and weak phylogeographic structure in domestic goats. Proceedings of the National Academy of Sciences. 98: 5927–5932. Miller, S.A., Dykes, D.D. and Polesky, H.F. (1988). A simple salting out procedure for extracting DNA from human nucleated cells. Nucleic Acids Research. 16: 1215. Mohammadi Pestehbig, F., Pirani, N., Shoja, J. and Mohammadhashemi, A. (2011). Determination the mtDNA D-loop Sequence in Marandi Native Chicken Population and Its Phylogenic Relationships with Other Breeds. Research Journal of Animal Sciences. 21: 1-9. Nei, M. and Kumar, S. (2000). Molecular Evolution and Phylogenetics. Oxford University Press, New York. Nei, M. (1987). Molecular Evolutionary Genetics .Columbia Univ Press, NewYork. Pakpahan, S., Tunas Artama, W., Widayanti, R. and Suparta, G. (2016) .Genetic Characteristics and Relationship in Different Goat Populations of Indonesia Based on Cytochrome B Gene Sequences. Asian Journal of Animal Sciences.10:29-38. Pirani, N., Mohammadhashemi, A., Alijani, S., Rezazadeh Goli, R. and Ghanbari, S. (2010). Molecular Analysis of Mazandrani native chicken population based on HVR-I region of Mitochondrial DNA. Journal Agriculture Biotechnology. 1: 53-60. Sutopo, J. and Kurnianto, E. (2014). The genetic diversity of Kejobong goat based on Cytochrome B gene.Journal of the Indonesian. Tropical Animal Agriculture. 39: 75-82. Takada, T., Kikkawa, Y., Yonekawa, H., Kawakami, S. and Amano, T. (1997). Bezoar (C. aegagrus) is a matriarchal candidate for ancestor of domestic goat (C. hircus): evidence from the mitochondrial DNA diversity. Biochemical Genetics. 35: 315-326. Tamura, K., Stecher, G., Peterson, D., Filipski A. and Kumar, S. (2013). MEGA6: Molecular evolutionary genetics analysis version 6.0. Molecular Biology and Evolution. 30: 2725-2729. | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 1,039 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 763 |
||