| تعداد نشریات | 285 |
| تعداد نشریات سازمان | 83 |
| تعداد شمارهها | 3,108 |
| تعداد مقالات | 34,636 |
| تعداد مشاهده مقاله | 49,759,226 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 80,131,559 |
A comparative phylogenetic analysis of Theileria spp. by using two two \"18S ribosomal RNA\" and \"Theileria annulata merozoite surface antigen\" gene sequences | ||
| Archives of Razi Institute | ||
| مقاله 8، دوره 68، شماره 1، شهریور 2013، صفحه 47-52 اصل مقاله (120.43 K) | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.7508/ari.2013.01.008 | ||
| نویسنده | ||
| G. Habibi* | ||
| چکیده | ||
| More than 185 species, strains and unclassified Theileria parasites are categorized in the Entrez Taxonomy. The accurate diagnosis and proper identification of the causative agents are important for understanding the epidemiology, prevention and appropriate treatment. This study aims to discuss the importance of two genes of Theileria annulata 18S ribosomal RNA (18S rRNA) and Theileria annulata merozoite surface antigen (Tams1) for phylogenetic analysis of molecular data. Eight Theileria annulata isolates including S15 Iran vaccine strain, six T. annulata field isolates and one Iraq T. annulata field isolate were studied in this study. The 18S rRNA and Tams1 gene sequences were investigated by phylogenetic analysis after DNA extraction, PCR, and DNA sequencing. Sequence fragments of about 1410 to 1412 bp of the complete 18S rRNA gene and 778 nucleotides of Tams1 gene sequences were used in the analysis of nucleotide diversity. Sequence alignment and phylogenetic analysis were performed by constructing the phylogenetic tree and identity matrix based on two above genes. The results of the study revealed, the 18S rRNA is informative in estimation of relationships among Theileria species and strains, but the Tams1 seems to be appropriate for analysis of the molecular antigenicity in vaccine development. | ||
| کلیدواژهها | ||
| Theileria annulata؛ Tams1؛ 18S rRNA؛ Taxonomy؛ Phylogenetic analysis | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| بررسی مقایسه ای فیلوژنی گونه های تیلریا با استفاده از دو ژن 18S ریبوزومی | ||
| نویسندگان [English] | ||
| غلامرضا حبیبی | ||
| چکیده [English] | ||
| بیش از 185 گونه و سویه تیلریا در تاکسونومی Entrez معرفی شده است. شناسایی دقیق عامل مولد در شناخت اپیدمیولوژی، پیشگیری و درمان مناسب اهمیت دارد. هدف از این مقاله بحث در مورد اهمیت دو ژن Theileria annulata یکی ژن مربوط به تحت واحد کوچک ریبوزومی 18S rRNA و دوم ژن مربوط به آنتی ژن سطحی مروزوایت تیلریا آنولاتا (Tams1) در تجزیه و تحلیل فیلوژنی داده های مولکولی است. هشت جدایه Theileria annulata شامل سویه واکسن ایران S15، شش جدایه صحرائی T. annulata و یک جدایه T. annulata تهیه شده از کشور عراق در این مطالعه مورد بررسی قرار گرفت. تجزیه و تحلیل فیلوژنی پس از استخراج DNA، انجام واکنش زنجیرهای پلیمراز و تعیین توالی قطعات حاصله انجام گرفت. قطعات بطول 1410 تا 1412 از ژن کامل 18S rRNA و 778 نوکلئوتیدی از ژن Tams1 در تحلیل تنوع نوکلوتیدی مورد استفاده قرار گرفت. مقایسه توالی ها برای آنالیز فیلوژنی با ترسیم درخت فیلوژنی و ماتریکس تشابهات توالی ها بر اساس دو ژن فوق انجام شد. نتایج این مطالعه نشان داد، که فقط ژن 18S rRNA در پیشگوئی و برآورد ارتباط میان گونه های Theileria معنی دار بوده، اما ژن Tams1 در تجزیه و تحلیل ملکولی تنوع آنتی ژنی در توسعه واکسن می تواند مورد استفاده قرار گیرد. | ||
| کلیدواژهها [English] | ||
| تیلریا آنولاتا, Tams1, 18S rRNA, تاکسونومی, آنالیز فیلوژنی | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 2,291 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 3,217 |
||