| تعداد نشریات | 282 |
| تعداد نشریات سازمان | 80 |
| تعداد شمارهها | 3,230 |
| تعداد مقالات | 35,788 |
| تعداد مشاهده مقاله | 54,014,569 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 93,171,966 |
CHARACTERIZATION OF GENETIC DIVERSITY IN THREE CHARA L. SPECIES (CHARACEAE) IN IRAN USING RAPD-PCR TECHNIQUE | ||
| The Iranian Journal of Botany | ||
| مقاله 20، دوره 18، شماره 2، اسفند 2012، صفحه 318-326 اصل مقاله (667.91 K) | ||
| نوع مقاله: Research Paper | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/ijb.2012.101516 | ||
| نویسندگان | ||
| Saeid Afsharzadeh2؛ Gholamreza Balali3؛ | ||
| 1PhD. Student / Department of Biology, Faculty of Science, University of Isfahan, Isfahan, Iran | ||
| 2Assistant Professor / Department of Biology, Faculty of Science, University of Isfahan, Isfahan, Iran | ||
| 3Associate Professor / Department of Biology, Faculty of Science, University of Isfahan, Isfahan, Iran | ||
| چکیده | ||
| Species separation in the family Characeae is generally based on morphological characters, but these traits used to identify species are influenced by habitat characteristics. The green algal genus Chara Linnaeus comprises of several species, which are morphologically variable. RAPD-PCR technique was used to characterize genetic diversity in three Chara L. species collected from Iran. Five primers were used in this study. Different loci were detected using a total of 17 samples of Chara vulgaris L., C. gymnophylla A. Braun and C. zeylanica C. L. Willdenow. The present study is the first on the molecular characterization of these species using RAPD-PCR marker in Iran. The method seems to be suitable for characterization of the genus at species level. | ||
| کلیدواژهها | ||
| Genetic diversity؛ Chara؛ Iran؛ Characeae؛ RAPD-PCR | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| تعیین تنوع ژنتیکی سه گونه از جنس کارا در ایران با استفاده از تکنیک رپید | ||
| نویسندگان [English] | ||
| سعید افشارزاده2؛ غلامرضا بلالی3؛ | ||
| 1دانشجوی دکتری / گروه زیست شناسی دانشگاه اصفهان. | ||
| 2استادیار / گروه زیست شناسی دانشگاه اصفهان | ||
| 3دانشیار / گروه زیست شناسی دانشگاه اصفهان. | ||
| چکیده [English] | ||
| تمایز گونهها در خانواده کاراسه عموما بر پایه صفات ریختشناسی است، ولی این صفات تحت تاثیر خصوصیات محیطی قرار میگیرند. جنس کارا شامل تعداد زیادی گونه میباشد که تغییرپذیری مورفولوژیکی زیادی را از خود به نمایش میگذارند. تکنیک مولکولی رپید برای تعیین تنوع ژنتیکی در سه گونه از جنس کارا در ایران مورد استفاده قرار گرفت. در این مطالعه پنج پرایمر استفاده شدند. لوکوسهای مختلفی برای 17 نمونه از گونههای Chara vulgaris، C. gymnophylla و C. zeylanica شناسایی شد. مطالعه حاضر برای اولین بار استفاده از تکنیک مولکولی رپید را در تمایز این گونهها در ایران شرح میدهد. به نظر میرسد این تکنیک برای تمایز گونههای این جنس مفید و موثر باشد. | ||
| کلیدواژهها [English] | ||
| Genetic diversity, Chara, Iran, Characeae, RAPD-PCR | ||
| مراجع | ||
|
Abrol, D., Bhatnagar, S. & Kumar, S. 2006: Molecular characterization of five species of the genus Chara (division Charophyta) from India. -Journal of Biological Research. 6: 213-220. Bhattacharya, D. & Medlin, L. 1998: Algal phylogeny and the origin of land plants 1. -Plant Physiology.116: 9–15. Boegle, M. G., Schneider, S. C., Schubert, H. & Melzer, A. 2010: Chara baltica Bruzelius 1824 and Chara intermedia A. Braun 1859- Distinct species or habitat specific modifications? -Aquatic Botany. 93: 195-201. Boegle, M. G., Schneider, S. C., Mannschreck, B. & Melzer, A. 2007: Differentiation of Chara intermaedia and C. baltica compared to C. hispida based on morphology and amplified fragment length polymorphism. -Hydrobiologia. 586: 155-166. Casanova, M. T. 2005: An overview of Chara L. in Australia (Characeae, Charophyta). -Australian Systematic Botany. 18: 25–39. Casanova, M. T. 1997: Oospore variation in three species of Chara (Charales, Chlorophyta). -Phycologia. 36:274–80. Corillion, R. 1957: Les charophycees de France et de Europe Occidentale. -Imprimerie Bretonne, Renne, France. Hu, Y. J., & Zhou, Z. G. 2001: Extraction of RAPD friendlyDNA from Laminaria japonica (Phaeophyta) after enzymatic dissociation of the frozen sporophytic tissues. -Journal of Applied Phycology. 13: 415-422. Karol, K. G., McCourt, R. M., Cimino, M. T. & Delwiche, C. F. 2001: The closest living relatives of land plants. -Science. 294: 2351–2353. Kato, S., Sakayama, H., Sano, S., Kasai, F., Watanabe, M. M., Tanaka, J. & Nozaki, H. 2008: Morphological variation and intraspecific phylogeny of the ubiquitous species Chara braunii(Charales, Charophyceae) in Japan. -Phycologia. 47: 191–202. Kato , S., Sakayama, H., Morishima, H. Sano, S., Oomori, Y., Kato, N. Ito, M., Kasai, F. Watanabe, M. M & Nozaki, H. 2010: Morphology and Molecular Phylogeny of Chara altaica (Charales, Charophyceae), a Monoecious Species of the Section Desvauxia. -Cytologia, 75 (2): 211-220. Krause, W. 1997: Charales (Charophyceae). In: susswasserflora vonmitteleuropa, vol. 18 (Edited by: Ettl, H., Gartner, G. and Mollenhauer), 202 pp. -G. Fischer, Jena, Germany. Mannschreck, B., T. Fink & A. Melzer, 2002: Biosystematics of selected Chara species (Charophyta) using amplified fragment length polymorphism. -Phycologia. 41: 657–666. Meiers, S. T., Proctor, V. W. & Chapman, R. L. 1999: Phylogeny and biogeography of Chara(Charophyta) inferred from 18S rDNA sequences. _Australian Journal of Botany. 47: 347–360. Moore, J. A. 1986: The current status of the Characeae (stoneworts) in the British Isles. -Watsonia. 12:297–309. Murray, A. A. & Thompson, W. F. 2002: Rapid isolation of high molecular weight plant DNA. -Nucleic Acids Research. 8, 4321-4325. Ramos, J. R., Telles, M. P. C., Diniz-Filho, J. A. F., Soares, T. N., Melo, D. B. & Oliveira, G. 2008: Optimizing reproducibility evaluation for random amplified polymorphic DNA markers. -Genetics and Molecular Research. 7(4): 1384-1391. Sakayama, H., Kasai, F., Nozaki, H. Watanabe, M. M., Kawachi, M. Shigyo, M. Washitani, I., Krienitz, L. & Ito, M. 2009: Taxonomic reexamination of Chara globularis(Charales, Charophyceae) from Japan based on oospore morphology and rbcL gene sequences, and the description of C. leptosporasp. nov. -Journal of Phycology. 45: 917–927. Sundaralingam , V. S. 2002: Charophyta - a review. In: Algological research in India. -Singh, B., Singh, M. P. and Dual, D. India. 97-111. Urbaniak, 2010: Analysis of morphological characters of Chara baltica, C. hispida, C. horrida and C. rudis from Europe. -Plant Systematics and Evolution. 286: 209-221. Urbaniak, J. 2011: A SEM and light microscopy study of the oospore wall ornamentation in polish charophytes (Charales, Charophyceae) – genus Chara. -Nova Hedwigia. 93: 1-28. Wood, R. D. & Imahori, K. 1965: Monograph of the Characeae. In: Wood, R. D. and Imahori, K. (editors). A Revision of the Characeae. _J. Cramer, Weinheim. Yu K. F.& Paula, K. P. 1992: Optimization of the PCR program for RAPD analysis. -Nucleic Acids Research. 20: 2606. Zhao, F., Liu, F., Liu, J. & Duan, D. 2008: Genetic structure of natural sargassum muticum (Fucales, Phaeophyta) populations using RAPD and ISSR markers. -Journal of Applied Phycology. 20: 191-198. | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 1,780 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 1,346 |
||